Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Avl9Q80U56 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Avl9Q80U56 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Avl9Q80U56 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Avl9Q80U56 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Avl9Q80U56 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Avl9Q80U56 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Avl9Q80U56 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Avl9Q80U56 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Avl9Q80U56 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Avl9Q80U56 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Avl9Q80U56 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Avl9Q80U56 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Avl9Q80U56 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Avl9Q80U56 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Avl9Q80U56 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Avl9Q80U56 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Avl9Q80U56 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Avl9Q80U56 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Avl9Q80U56 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Avl9Q80U56 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Avl9Q80U56 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Avl9Q80U56 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Avl9Q80U56 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Avl9Q80U56 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Avl9Q80U56 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Avl9Q80U56 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Avl9Q80U56 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Avl9Q80U56 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Avl9Q80U56 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Avl9Q80U56 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Avl9Q80U56 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Avl9Q80U56 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Avl9Q80U56 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Avl9Q80U56 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Avl9Q80U56 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Avl9Q80U56 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Avl9Q80U56 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Avl9Q80U56 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Avl9Q80U56 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Avl9Q80U56 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Avl9Q80U56 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Avl9Q80U56 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Avl9Q80U56 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Avl9Q80U56 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Avl9Q80U56 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Avl9Q80U56 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Avl9Q80U56 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Avl9Q80U56 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Avl9Q80U56 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Avl9Q80U56 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Avl9Q80U56 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Avl9Q80U56 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Avl9Q80U56 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Avl9Q80U56 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Avl9Q80U56 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Avl9Q80U56 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Avl9Q80U56 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Avl9Q80U56 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Avl9Q80U56 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Avl9Q80U56 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Avl9Q80U56 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Avl9Q80U56 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Avl9Q80U56 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Avl9Q80U56 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Avl9Q80U56 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Avl9Q80U56 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Avl9Q80U56 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Avl9Q80U56 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Avl9Q80U56 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Avl9Q80U56 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Avl9Q80U56 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Avl9Q80U56 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Avl9Q80U56 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Avl9Q80U56 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Avl9Q80U56 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Avl9Q80U56 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Avl9Q80U56 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Avl9Q80U56 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Avl9Q80U56 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Avl9Q80U56 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Avl9Q80U56 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Avl9Q80U56 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Avl9Q80U56 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Avl9Q80U56 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Avl9Q80U56 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Avl9Q80U56 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Avl9Q80U56 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Avl9Q80U56 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Avl9Q80U56 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Avl9Q80U56 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Avl9Q80U56 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Avl9Q80U56 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Avl9Q80U56 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Avl9Q80U56 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Avl9Q80U56 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Avl9Q80U56 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Avl9Q80U56 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Avl9Q80U56 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Avl9Q80U56 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms