Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT79

Mcph1, Microcephalin, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcph1Q7TT79 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mcph1Q7TT79 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mcph1Q7TT79 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mcph1Q7TT79 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mcph1Q7TT79 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mcph1Q7TT79 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Mcph1Q7TT79 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Mcph1Q7TT79 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Mcph1Q7TT79 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Mcph1Q7TT79 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Mcph1Q7TT79 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Mcph1Q7TT79 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Mcph1Q7TT79 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Mcph1Q7TT79 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Mcph1Q7TT79 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Mcph1Q7TT79 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Mcph1Q7TT79 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Mcph1Q7TT79 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mcph1Q7TT79 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mcph1Q7TT79 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mcph1Q7TT79 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mcph1Q7TT79 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Mcph1Q7TT79 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mcph1Q7TT79 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mcph1Q7TT79 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Mcph1Q7TT79 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Mcph1Q7TT79 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Mcph1Q7TT79 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Mcph1Q7TT79 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mcph1Q7TT79 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mcph1Q7TT79 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mcph1Q7TT79 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Mcph1Q7TT79 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Mcph1Q7TT79 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Mcph1Q7TT79 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mcph1Q7TT79 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mcph1Q7TT79 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mcph1Q7TT79 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mcph1Q7TT79 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mcph1Q7TT79 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mcph1Q7TT79 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Mcph1Q7TT79 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Mcph1Q7TT79 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Mcph1Q7TT79 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mcph1Q7TT79 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mcph1Q7TT79 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mcph1Q7TT79 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mcph1Q7TT79 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mcph1Q7TT79 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mcph1Q7TT79 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Mcph1Q7TT79 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Mcph1Q7TT79 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Mcph1Q7TT79 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Mcph1Q7TT79 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mcph1Q7TT79 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Mcph1Q7TT79 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Mcph1Q7TT79 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Mcph1Q7TT79 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Mcph1Q7TT79 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Mcph1Q7TT79 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Mcph1Q7TT79 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Mcph1Q7TT79 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Mcph1Q7TT79 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Mcph1Q7TT79 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Mcph1Q7TT79 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Mcph1Q7TT79 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Mcph1Q7TT79 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Mcph1Q7TT79 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Mcph1Q7TT79 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Mcph1Q7TT79 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Mcph1Q7TT79 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Mcph1Q7TT79 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Mcph1Q7TT79 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Mcph1Q7TT79 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Mcph1Q7TT79 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Mcph1Q7TT79 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Mcph1Q7TT79 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Mcph1Q7TT79 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Mcph1Q7TT79 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Mcph1Q7TT79 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Mcph1Q7TT79 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Mcph1Q7TT79 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Mcph1Q7TT79 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Mcph1Q7TT79 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Mcph1Q7TT79 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Mcph1Q7TT79 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Mcph1Q7TT79 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Mcph1Q7TT79 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Mcph1Q7TT79 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Mcph1Q7TT79 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Mcph1Q7TT79 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Mcph1Q7TT79 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Mcph1Q7TT79 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Mcph1Q7TT79 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Mcph1Q7TT79 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Mcph1Q7TT79 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Mcph1Q7TT79 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Mcph1Q7TT79 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Mcph1Q7TT79 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Mcph1Q7TT79 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms