Protein–RNA interactions for Protein: Q6WBX7

Rad9b, Cell cycle checkpoint control protein RAD9B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad9bQ6WBX7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rad9bQ6WBX7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rad9bQ6WBX7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rad9bQ6WBX7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rad9bQ6WBX7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rad9bQ6WBX7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rad9bQ6WBX7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rad9bQ6WBX7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rad9bQ6WBX7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Rad9bQ6WBX7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rad9bQ6WBX7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rad9bQ6WBX7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rad9bQ6WBX7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rad9bQ6WBX7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rad9bQ6WBX7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rad9bQ6WBX7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rad9bQ6WBX7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rad9bQ6WBX7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rad9bQ6WBX7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rad9bQ6WBX7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rad9bQ6WBX7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rad9bQ6WBX7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Rad9bQ6WBX7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rad9bQ6WBX7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rad9bQ6WBX7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rad9bQ6WBX7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rad9bQ6WBX7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Rad9bQ6WBX7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rad9bQ6WBX7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Rad9bQ6WBX7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rad9bQ6WBX7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rad9bQ6WBX7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rad9bQ6WBX7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rad9bQ6WBX7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rad9bQ6WBX7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rad9bQ6WBX7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rad9bQ6WBX7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rad9bQ6WBX7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rad9bQ6WBX7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rad9bQ6WBX7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rad9bQ6WBX7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rad9bQ6WBX7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rad9bQ6WBX7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Rad9bQ6WBX7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rad9bQ6WBX7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rad9bQ6WBX7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rad9bQ6WBX7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rad9bQ6WBX7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rad9bQ6WBX7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rad9bQ6WBX7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rad9bQ6WBX7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rad9bQ6WBX7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rad9bQ6WBX7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rad9bQ6WBX7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rad9bQ6WBX7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rad9bQ6WBX7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rad9bQ6WBX7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Rad9bQ6WBX7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rad9bQ6WBX7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rad9bQ6WBX7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rad9bQ6WBX7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rad9bQ6WBX7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rad9bQ6WBX7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Rad9bQ6WBX7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rad9bQ6WBX7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rad9bQ6WBX7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rad9bQ6WBX7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rad9bQ6WBX7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Rad9bQ6WBX7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rad9bQ6WBX7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rad9bQ6WBX7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Rad9bQ6WBX7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Rad9bQ6WBX7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rad9bQ6WBX7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rad9bQ6WBX7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rad9bQ6WBX7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rad9bQ6WBX7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Rad9bQ6WBX7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rad9bQ6WBX7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rad9bQ6WBX7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rad9bQ6WBX7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rad9bQ6WBX7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rad9bQ6WBX7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rad9bQ6WBX7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rad9bQ6WBX7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Rad9bQ6WBX7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rad9bQ6WBX7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rad9bQ6WBX7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rad9bQ6WBX7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rad9bQ6WBX7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rad9bQ6WBX7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rad9bQ6WBX7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rad9bQ6WBX7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rad9bQ6WBX7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rad9bQ6WBX7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rad9bQ6WBX7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rad9bQ6WBX7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Rad9bQ6WBX7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Rad9bQ6WBX7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rad9bQ6WBX7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms