Protein–RNA interactions for Protein: Q6VZZ7

Opn5, Opsin-5, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn5Q6VZZ7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Opn5Q6VZZ7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Opn5Q6VZZ7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Opn5Q6VZZ7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Opn5Q6VZZ7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Opn5Q6VZZ7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Opn5Q6VZZ7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Opn5Q6VZZ7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Opn5Q6VZZ7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Opn5Q6VZZ7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Opn5Q6VZZ7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Opn5Q6VZZ7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Opn5Q6VZZ7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Opn5Q6VZZ7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Opn5Q6VZZ7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Opn5Q6VZZ7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Opn5Q6VZZ7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Opn5Q6VZZ7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Opn5Q6VZZ7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Opn5Q6VZZ7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Opn5Q6VZZ7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Opn5Q6VZZ7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Opn5Q6VZZ7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Opn5Q6VZZ7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Opn5Q6VZZ7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Opn5Q6VZZ7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Opn5Q6VZZ7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Opn5Q6VZZ7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Opn5Q6VZZ7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Opn5Q6VZZ7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Opn5Q6VZZ7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Opn5Q6VZZ7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Opn5Q6VZZ7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Opn5Q6VZZ7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Opn5Q6VZZ7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Opn5Q6VZZ7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Opn5Q6VZZ7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Opn5Q6VZZ7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Opn5Q6VZZ7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Opn5Q6VZZ7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Opn5Q6VZZ7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Opn5Q6VZZ7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Opn5Q6VZZ7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Opn5Q6VZZ7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Opn5Q6VZZ7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Opn5Q6VZZ7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Opn5Q6VZZ7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Opn5Q6VZZ7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Opn5Q6VZZ7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Opn5Q6VZZ7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Opn5Q6VZZ7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Opn5Q6VZZ7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Opn5Q6VZZ7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Opn5Q6VZZ7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Opn5Q6VZZ7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Opn5Q6VZZ7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Opn5Q6VZZ7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Opn5Q6VZZ7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Opn5Q6VZZ7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Opn5Q6VZZ7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Opn5Q6VZZ7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Opn5Q6VZZ7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Opn5Q6VZZ7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Opn5Q6VZZ7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Opn5Q6VZZ7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Opn5Q6VZZ7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Opn5Q6VZZ7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Opn5Q6VZZ7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Opn5Q6VZZ7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Opn5Q6VZZ7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Opn5Q6VZZ7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Opn5Q6VZZ7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Opn5Q6VZZ7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Opn5Q6VZZ7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Opn5Q6VZZ7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Opn5Q6VZZ7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Opn5Q6VZZ7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Opn5Q6VZZ7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Opn5Q6VZZ7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Opn5Q6VZZ7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Opn5Q6VZZ7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Opn5Q6VZZ7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Opn5Q6VZZ7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Opn5Q6VZZ7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Opn5Q6VZZ7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Opn5Q6VZZ7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Opn5Q6VZZ7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Opn5Q6VZZ7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Opn5Q6VZZ7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Opn5Q6VZZ7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Opn5Q6VZZ7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Opn5Q6VZZ7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Opn5Q6VZZ7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Opn5Q6VZZ7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Opn5Q6VZZ7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Opn5Q6VZZ7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Opn5Q6VZZ7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Opn5Q6VZZ7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Opn5Q6VZZ7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Opn5Q6VZZ7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms