Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFD9

Nup98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup98Q6PFD9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nup98Q6PFD9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nup98Q6PFD9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nup98Q6PFD9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nup98Q6PFD9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nup98Q6PFD9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Nup98Q6PFD9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nup98Q6PFD9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nup98Q6PFD9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nup98Q6PFD9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nup98Q6PFD9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nup98Q6PFD9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nup98Q6PFD9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nup98Q6PFD9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nup98Q6PFD9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nup98Q6PFD9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Nup98Q6PFD9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Nup98Q6PFD9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nup98Q6PFD9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nup98Q6PFD9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nup98Q6PFD9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nup98Q6PFD9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nup98Q6PFD9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Nup98Q6PFD9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nup98Q6PFD9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Nup98Q6PFD9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nup98Q6PFD9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nup98Q6PFD9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nup98Q6PFD9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Nup98Q6PFD9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nup98Q6PFD9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nup98Q6PFD9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nup98Q6PFD9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nup98Q6PFD9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nup98Q6PFD9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nup98Q6PFD9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Nup98Q6PFD9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nup98Q6PFD9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nup98Q6PFD9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Nup98Q6PFD9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nup98Q6PFD9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nup98Q6PFD9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Nup98Q6PFD9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nup98Q6PFD9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nup98Q6PFD9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nup98Q6PFD9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nup98Q6PFD9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nup98Q6PFD9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nup98Q6PFD9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nup98Q6PFD9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nup98Q6PFD9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nup98Q6PFD9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nup98Q6PFD9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nup98Q6PFD9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nup98Q6PFD9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nup98Q6PFD9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nup98Q6PFD9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nup98Q6PFD9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nup98Q6PFD9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nup98Q6PFD9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nup98Q6PFD9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
Nup98Q6PFD9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nup98Q6PFD9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Nup98Q6PFD9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nup98Q6PFD9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Nup98Q6PFD9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nup98Q6PFD9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nup98Q6PFD9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nup98Q6PFD9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nup98Q6PFD9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Nup98Q6PFD9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nup98Q6PFD9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nup98Q6PFD9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Nup98Q6PFD9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nup98Q6PFD9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nup98Q6PFD9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nup98Q6PFD9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nup98Q6PFD9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nup98Q6PFD9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nup98Q6PFD9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nup98Q6PFD9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nup98Q6PFD9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nup98Q6PFD9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Nup98Q6PFD9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nup98Q6PFD9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nup98Q6PFD9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nup98Q6PFD9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nup98Q6PFD9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nup98Q6PFD9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nup98Q6PFD9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nup98Q6PFD9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nup98Q6PFD9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nup98Q6PFD9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nup98Q6PFD9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nup98Q6PFD9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nup98Q6PFD9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nup98Q6PFD9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nup98Q6PFD9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nup98Q6PFD9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nup98Q6PFD9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.5 ms