Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Smchd1Q6P5D8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smchd1Q6P5D8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Smchd1Q6P5D8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Smchd1Q6P5D8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Smchd1Q6P5D8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Smchd1Q6P5D8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Smchd1Q6P5D8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Smchd1Q6P5D8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Smchd1Q6P5D8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Smchd1Q6P5D8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Smchd1Q6P5D8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Smchd1Q6P5D8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smchd1Q6P5D8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smchd1Q6P5D8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Smchd1Q6P5D8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smchd1Q6P5D8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smchd1Q6P5D8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smchd1Q6P5D8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smchd1Q6P5D8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Smchd1Q6P5D8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Smchd1Q6P5D8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Smchd1Q6P5D8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smchd1Q6P5D8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smchd1Q6P5D8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Smchd1Q6P5D8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Smchd1Q6P5D8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Smchd1Q6P5D8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Smchd1Q6P5D8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Smchd1Q6P5D8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Smchd1Q6P5D8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Smchd1Q6P5D8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smchd1Q6P5D8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smchd1Q6P5D8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smchd1Q6P5D8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smchd1Q6P5D8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smchd1Q6P5D8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Smchd1Q6P5D8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smchd1Q6P5D8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smchd1Q6P5D8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Smchd1Q6P5D8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Smchd1Q6P5D8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Smchd1Q6P5D8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Smchd1Q6P5D8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Smchd1Q6P5D8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Smchd1Q6P5D8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Smchd1Q6P5D8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Smchd1Q6P5D8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Smchd1Q6P5D8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Smchd1Q6P5D8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Smchd1Q6P5D8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Smchd1Q6P5D8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smchd1Q6P5D8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smchd1Q6P5D8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smchd1Q6P5D8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Smchd1Q6P5D8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smchd1Q6P5D8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smchd1Q6P5D8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Smchd1Q6P5D8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Smchd1Q6P5D8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Smchd1Q6P5D8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Smchd1Q6P5D8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Smchd1Q6P5D8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Smchd1Q6P5D8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smchd1Q6P5D8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smchd1Q6P5D8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smchd1Q6P5D8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smchd1Q6P5D8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smchd1Q6P5D8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Smchd1Q6P5D8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Smchd1Q6P5D8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smchd1Q6P5D8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smchd1Q6P5D8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smchd1Q6P5D8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smchd1Q6P5D8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smchd1Q6P5D8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smchd1Q6P5D8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smchd1Q6P5D8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smchd1Q6P5D8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smchd1Q6P5D8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smchd1Q6P5D8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Smchd1Q6P5D8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Smchd1Q6P5D8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Smchd1Q6P5D8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Smchd1Q6P5D8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Smchd1Q6P5D8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Smchd1Q6P5D8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Smchd1Q6P5D8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Smchd1Q6P5D8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Smchd1Q6P5D8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Smchd1Q6P5D8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Smchd1Q6P5D8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Smchd1Q6P5D8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Smchd1Q6P5D8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Smchd1Q6P5D8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Smchd1Q6P5D8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Smchd1Q6P5D8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smchd1Q6P5D8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Smchd1Q6P5D8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smchd1Q6P5D8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms