Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Foxd1Q61345 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Foxd1Q61345 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Foxd1Q61345 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Foxd1Q61345 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Foxd1Q61345 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Foxd1Q61345 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Foxd1Q61345 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Foxd1Q61345 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Foxd1Q61345 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Foxd1Q61345 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Foxd1Q61345 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Foxd1Q61345 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Foxd1Q61345 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Foxd1Q61345 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Foxd1Q61345 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Foxd1Q61345 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Foxd1Q61345 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Foxd1Q61345 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Foxd1Q61345 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Foxd1Q61345 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Foxd1Q61345 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Foxd1Q61345 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Foxd1Q61345 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Foxd1Q61345 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Foxd1Q61345 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Foxd1Q61345 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Foxd1Q61345 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Foxd1Q61345 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Foxd1Q61345 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Foxd1Q61345 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Foxd1Q61345 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Foxd1Q61345 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Foxd1Q61345 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Foxd1Q61345 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Foxd1Q61345 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Foxd1Q61345 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Foxd1Q61345 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Foxd1Q61345 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Foxd1Q61345 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Foxd1Q61345 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Foxd1Q61345 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Foxd1Q61345 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Foxd1Q61345 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Foxd1Q61345 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Foxd1Q61345 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Foxd1Q61345 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Foxd1Q61345 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Foxd1Q61345 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Foxd1Q61345 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Foxd1Q61345 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Foxd1Q61345 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Foxd1Q61345 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Foxd1Q61345 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Foxd1Q61345 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Foxd1Q61345 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Foxd1Q61345 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Foxd1Q61345 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Foxd1Q61345 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Foxd1Q61345 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Foxd1Q61345 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Foxd1Q61345 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Foxd1Q61345 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Foxd1Q61345 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Foxd1Q61345 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Foxd1Q61345 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Foxd1Q61345 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Foxd1Q61345 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Foxd1Q61345 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Foxd1Q61345 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Foxd1Q61345 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Foxd1Q61345 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Foxd1Q61345 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Foxd1Q61345 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Foxd1Q61345 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Foxd1Q61345 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Foxd1Q61345 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Foxd1Q61345 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Foxd1Q61345 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Foxd1Q61345 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Foxd1Q61345 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Foxd1Q61345 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Foxd1Q61345 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Foxd1Q61345 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Foxd1Q61345 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Foxd1Q61345 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Foxd1Q61345 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Foxd1Q61345 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Foxd1Q61345 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Foxd1Q61345 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Foxd1Q61345 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Foxd1Q61345 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Foxd1Q61345 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Foxd1Q61345 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Foxd1Q61345 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Foxd1Q61345 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Foxd1Q61345 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Foxd1Q61345 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Foxd1Q61345 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Foxd1Q61345 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms