Protein–RNA interactions for Protein: Q5RKV8

Pfpl, Pfpl protein, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PfplQ5RKV8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PfplQ5RKV8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PfplQ5RKV8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PfplQ5RKV8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PfplQ5RKV8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PfplQ5RKV8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PfplQ5RKV8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PfplQ5RKV8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PfplQ5RKV8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PfplQ5RKV8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PfplQ5RKV8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PfplQ5RKV8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PfplQ5RKV8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PfplQ5RKV8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PfplQ5RKV8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PfplQ5RKV8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PfplQ5RKV8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PfplQ5RKV8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PfplQ5RKV8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PfplQ5RKV8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PfplQ5RKV8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PfplQ5RKV8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PfplQ5RKV8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PfplQ5RKV8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PfplQ5RKV8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PfplQ5RKV8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PfplQ5RKV8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PfplQ5RKV8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PfplQ5RKV8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PfplQ5RKV8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PfplQ5RKV8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PfplQ5RKV8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PfplQ5RKV8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PfplQ5RKV8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PfplQ5RKV8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PfplQ5RKV8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PfplQ5RKV8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PfplQ5RKV8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PfplQ5RKV8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PfplQ5RKV8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PfplQ5RKV8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PfplQ5RKV8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PfplQ5RKV8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PfplQ5RKV8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PfplQ5RKV8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PfplQ5RKV8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PfplQ5RKV8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PfplQ5RKV8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
PfplQ5RKV8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PfplQ5RKV8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PfplQ5RKV8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PfplQ5RKV8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PfplQ5RKV8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PfplQ5RKV8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PfplQ5RKV8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PfplQ5RKV8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PfplQ5RKV8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PfplQ5RKV8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PfplQ5RKV8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PfplQ5RKV8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PfplQ5RKV8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PfplQ5RKV8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PfplQ5RKV8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PfplQ5RKV8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PfplQ5RKV8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PfplQ5RKV8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PfplQ5RKV8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PfplQ5RKV8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PfplQ5RKV8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PfplQ5RKV8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PfplQ5RKV8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PfplQ5RKV8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PfplQ5RKV8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PfplQ5RKV8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PfplQ5RKV8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PfplQ5RKV8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PfplQ5RKV8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PfplQ5RKV8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PfplQ5RKV8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PfplQ5RKV8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PfplQ5RKV8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PfplQ5RKV8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PfplQ5RKV8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PfplQ5RKV8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PfplQ5RKV8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PfplQ5RKV8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PfplQ5RKV8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PfplQ5RKV8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PfplQ5RKV8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PfplQ5RKV8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PfplQ5RKV8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PfplQ5RKV8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PfplQ5RKV8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PfplQ5RKV8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PfplQ5RKV8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PfplQ5RKV8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PfplQ5RKV8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PfplQ5RKV8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PfplQ5RKV8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PfplQ5RKV8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms