Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prkaa1Q5EG47 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prkaa1Q5EG47 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prkaa1Q5EG47 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prkaa1Q5EG47 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prkaa1Q5EG47 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prkaa1Q5EG47 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prkaa1Q5EG47 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prkaa1Q5EG47 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prkaa1Q5EG47 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prkaa1Q5EG47 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prkaa1Q5EG47 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prkaa1Q5EG47 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prkaa1Q5EG47 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prkaa1Q5EG47 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prkaa1Q5EG47 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prkaa1Q5EG47 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prkaa1Q5EG47 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Prkaa1Q5EG47 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prkaa1Q5EG47 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prkaa1Q5EG47 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prkaa1Q5EG47 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prkaa1Q5EG47 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prkaa1Q5EG47 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prkaa1Q5EG47 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prkaa1Q5EG47 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Prkaa1Q5EG47 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prkaa1Q5EG47 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prkaa1Q5EG47 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prkaa1Q5EG47 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prkaa1Q5EG47 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prkaa1Q5EG47 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prkaa1Q5EG47 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prkaa1Q5EG47 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prkaa1Q5EG47 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prkaa1Q5EG47 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prkaa1Q5EG47 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prkaa1Q5EG47 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prkaa1Q5EG47 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prkaa1Q5EG47 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prkaa1Q5EG47 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Prkaa1Q5EG47 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prkaa1Q5EG47 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prkaa1Q5EG47 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prkaa1Q5EG47 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prkaa1Q5EG47 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prkaa1Q5EG47 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prkaa1Q5EG47 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prkaa1Q5EG47 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prkaa1Q5EG47 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prkaa1Q5EG47 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prkaa1Q5EG47 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prkaa1Q5EG47 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prkaa1Q5EG47 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prkaa1Q5EG47 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prkaa1Q5EG47 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prkaa1Q5EG47 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prkaa1Q5EG47 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prkaa1Q5EG47 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Prkaa1Q5EG47 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prkaa1Q5EG47 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prkaa1Q5EG47 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prkaa1Q5EG47 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prkaa1Q5EG47 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prkaa1Q5EG47 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prkaa1Q5EG47 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prkaa1Q5EG47 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prkaa1Q5EG47 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Prkaa1Q5EG47 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prkaa1Q5EG47 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prkaa1Q5EG47 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prkaa1Q5EG47 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prkaa1Q5EG47 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prkaa1Q5EG47 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prkaa1Q5EG47 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prkaa1Q5EG47 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prkaa1Q5EG47 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prkaa1Q5EG47 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Prkaa1Q5EG47 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prkaa1Q5EG47 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prkaa1Q5EG47 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prkaa1Q5EG47 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prkaa1Q5EG47 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prkaa1Q5EG47 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prkaa1Q5EG47 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prkaa1Q5EG47 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prkaa1Q5EG47 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prkaa1Q5EG47 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prkaa1Q5EG47 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prkaa1Q5EG47 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prkaa1Q5EG47 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prkaa1Q5EG47 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prkaa1Q5EG47 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prkaa1Q5EG47 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Prkaa1Q5EG47 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prkaa1Q5EG47 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prkaa1Q5EG47 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prkaa1Q5EG47 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prkaa1Q5EG47 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prkaa1Q5EG47 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms