Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Garnl3Q3V0G7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Garnl3Q3V0G7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Garnl3Q3V0G7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Garnl3Q3V0G7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Garnl3Q3V0G7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Garnl3Q3V0G7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Garnl3Q3V0G7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Garnl3Q3V0G7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Garnl3Q3V0G7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Garnl3Q3V0G7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Garnl3Q3V0G7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Garnl3Q3V0G7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Garnl3Q3V0G7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Garnl3Q3V0G7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Garnl3Q3V0G7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Garnl3Q3V0G7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Garnl3Q3V0G7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Garnl3Q3V0G7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Garnl3Q3V0G7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Garnl3Q3V0G7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Garnl3Q3V0G7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Garnl3Q3V0G7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Garnl3Q3V0G7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Garnl3Q3V0G7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Garnl3Q3V0G7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Garnl3Q3V0G7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Garnl3Q3V0G7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Garnl3Q3V0G7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Garnl3Q3V0G7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Garnl3Q3V0G7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Garnl3Q3V0G7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Garnl3Q3V0G7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Garnl3Q3V0G7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Garnl3Q3V0G7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Garnl3Q3V0G7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Garnl3Q3V0G7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Garnl3Q3V0G7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Garnl3Q3V0G7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Garnl3Q3V0G7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Garnl3Q3V0G7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Garnl3Q3V0G7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Garnl3Q3V0G7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Garnl3Q3V0G7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Garnl3Q3V0G7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Garnl3Q3V0G7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Garnl3Q3V0G7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Garnl3Q3V0G7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Garnl3Q3V0G7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Garnl3Q3V0G7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Garnl3Q3V0G7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Garnl3Q3V0G7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Garnl3Q3V0G7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Garnl3Q3V0G7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Garnl3Q3V0G7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Garnl3Q3V0G7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Garnl3Q3V0G7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Garnl3Q3V0G7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Garnl3Q3V0G7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Garnl3Q3V0G7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Garnl3Q3V0G7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Garnl3Q3V0G7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Garnl3Q3V0G7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Garnl3Q3V0G7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Garnl3Q3V0G7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Garnl3Q3V0G7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Garnl3Q3V0G7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Garnl3Q3V0G7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Garnl3Q3V0G7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Garnl3Q3V0G7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Garnl3Q3V0G7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Garnl3Q3V0G7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Garnl3Q3V0G7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Garnl3Q3V0G7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Garnl3Q3V0G7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Garnl3Q3V0G7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Garnl3Q3V0G7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Garnl3Q3V0G7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Garnl3Q3V0G7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Garnl3Q3V0G7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Garnl3Q3V0G7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Garnl3Q3V0G7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Garnl3Q3V0G7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Garnl3Q3V0G7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Garnl3Q3V0G7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Garnl3Q3V0G7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Garnl3Q3V0G7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Garnl3Q3V0G7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Garnl3Q3V0G7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Garnl3Q3V0G7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Garnl3Q3V0G7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Garnl3Q3V0G7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Garnl3Q3V0G7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Garnl3Q3V0G7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Garnl3Q3V0G7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Garnl3Q3V0G7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Garnl3Q3V0G7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Garnl3Q3V0G7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Garnl3Q3V0G7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Garnl3Q3V0G7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms