Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULD5

Mccc2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc2Q3ULD5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mccc2Q3ULD5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mccc2Q3ULD5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mccc2Q3ULD5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mccc2Q3ULD5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mccc2Q3ULD5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mccc2Q3ULD5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mccc2Q3ULD5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mccc2Q3ULD5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mccc2Q3ULD5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mccc2Q3ULD5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mccc2Q3ULD5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mccc2Q3ULD5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mccc2Q3ULD5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mccc2Q3ULD5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mccc2Q3ULD5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mccc2Q3ULD5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mccc2Q3ULD5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mccc2Q3ULD5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mccc2Q3ULD5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mccc2Q3ULD5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Mccc2Q3ULD5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Mccc2Q3ULD5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mccc2Q3ULD5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mccc2Q3ULD5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mccc2Q3ULD5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Mccc2Q3ULD5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mccc2Q3ULD5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mccc2Q3ULD5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mccc2Q3ULD5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mccc2Q3ULD5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Mccc2Q3ULD5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mccc2Q3ULD5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mccc2Q3ULD5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mccc2Q3ULD5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Mccc2Q3ULD5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mccc2Q3ULD5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mccc2Q3ULD5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mccc2Q3ULD5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mccc2Q3ULD5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mccc2Q3ULD5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mccc2Q3ULD5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Mccc2Q3ULD5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mccc2Q3ULD5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mccc2Q3ULD5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mccc2Q3ULD5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mccc2Q3ULD5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mccc2Q3ULD5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mccc2Q3ULD5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mccc2Q3ULD5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mccc2Q3ULD5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mccc2Q3ULD5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mccc2Q3ULD5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mccc2Q3ULD5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mccc2Q3ULD5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mccc2Q3ULD5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mccc2Q3ULD5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mccc2Q3ULD5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mccc2Q3ULD5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mccc2Q3ULD5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mccc2Q3ULD5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mccc2Q3ULD5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mccc2Q3ULD5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Mccc2Q3ULD5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mccc2Q3ULD5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mccc2Q3ULD5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mccc2Q3ULD5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mccc2Q3ULD5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mccc2Q3ULD5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mccc2Q3ULD5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mccc2Q3ULD5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mccc2Q3ULD5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mccc2Q3ULD5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mccc2Q3ULD5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mccc2Q3ULD5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mccc2Q3ULD5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mccc2Q3ULD5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mccc2Q3ULD5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mccc2Q3ULD5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mccc2Q3ULD5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mccc2Q3ULD5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mccc2Q3ULD5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Mccc2Q3ULD5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mccc2Q3ULD5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mccc2Q3ULD5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mccc2Q3ULD5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mccc2Q3ULD5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mccc2Q3ULD5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mccc2Q3ULD5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mccc2Q3ULD5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mccc2Q3ULD5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mccc2Q3ULD5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mccc2Q3ULD5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mccc2Q3ULD5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mccc2Q3ULD5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mccc2Q3ULD5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mccc2Q3ULD5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mccc2Q3ULD5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mccc2Q3ULD5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mccc2Q3ULD5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms