Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Puf60Q3UEB3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Puf60Q3UEB3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Puf60Q3UEB3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Puf60Q3UEB3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Puf60Q3UEB3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
Puf60Q3UEB3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Puf60Q3UEB3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
Puf60Q3UEB3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Puf60Q3UEB3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Puf60Q3UEB3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
Puf60Q3UEB3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Puf60Q3UEB3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Puf60Q3UEB3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Puf60Q3UEB3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Puf60Q3UEB3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Puf60Q3UEB3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Puf60Q3UEB3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Puf60Q3UEB3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Puf60Q3UEB3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Puf60Q3UEB3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Puf60Q3UEB3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Puf60Q3UEB3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Puf60Q3UEB3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Puf60Q3UEB3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Puf60Q3UEB3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Puf60Q3UEB3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Puf60Q3UEB3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Puf60Q3UEB3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Puf60Q3UEB3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Puf60Q3UEB3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Puf60Q3UEB3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Puf60Q3UEB3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Puf60Q3UEB3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Puf60Q3UEB3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Puf60Q3UEB3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Puf60Q3UEB3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Puf60Q3UEB3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Puf60Q3UEB3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Puf60Q3UEB3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Puf60Q3UEB3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Puf60Q3UEB3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Puf60Q3UEB3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Puf60Q3UEB3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Puf60Q3UEB3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Puf60Q3UEB3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Puf60Q3UEB3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Puf60Q3UEB3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Puf60Q3UEB3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
Puf60Q3UEB3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Puf60Q3UEB3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Puf60Q3UEB3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Puf60Q3UEB3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Puf60Q3UEB3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Puf60Q3UEB3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Puf60Q3UEB3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Puf60Q3UEB3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Puf60Q3UEB3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Puf60Q3UEB3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Puf60Q3UEB3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Puf60Q3UEB3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Puf60Q3UEB3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Puf60Q3UEB3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Puf60Q3UEB3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Puf60Q3UEB3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Puf60Q3UEB3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Puf60Q3UEB3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Puf60Q3UEB3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Puf60Q3UEB3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Puf60Q3UEB3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Puf60Q3UEB3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Puf60Q3UEB3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Puf60Q3UEB3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Puf60Q3UEB3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Puf60Q3UEB3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Puf60Q3UEB3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Puf60Q3UEB3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Puf60Q3UEB3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Puf60Q3UEB3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Puf60Q3UEB3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Puf60Q3UEB3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Puf60Q3UEB3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Puf60Q3UEB3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Puf60Q3UEB3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Puf60Q3UEB3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Puf60Q3UEB3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Puf60Q3UEB3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Puf60Q3UEB3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Puf60Q3UEB3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Puf60Q3UEB3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Puf60Q3UEB3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Puf60Q3UEB3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Puf60Q3UEB3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Puf60Q3UEB3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Puf60Q3UEB3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Puf60Q3UEB3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Puf60Q3UEB3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Puf60Q3UEB3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Puf60Q3UEB3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Puf60Q3UEB3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms