Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT38

D17Wsu92e, Uncharacterized protein C6orf106 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17Wsu92eQ3TT38 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
D17Wsu92eQ3TT38 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
D17Wsu92eQ3TT38 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
D17Wsu92eQ3TT38 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
D17Wsu92eQ3TT38 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
D17Wsu92eQ3TT38 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
D17Wsu92eQ3TT38 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
D17Wsu92eQ3TT38 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
D17Wsu92eQ3TT38 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
D17Wsu92eQ3TT38 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
D17Wsu92eQ3TT38 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
D17Wsu92eQ3TT38 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
D17Wsu92eQ3TT38 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
D17Wsu92eQ3TT38 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
D17Wsu92eQ3TT38 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
D17Wsu92eQ3TT38 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
D17Wsu92eQ3TT38 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
D17Wsu92eQ3TT38 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
D17Wsu92eQ3TT38 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
D17Wsu92eQ3TT38 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
D17Wsu92eQ3TT38 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
D17Wsu92eQ3TT38 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
D17Wsu92eQ3TT38 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
D17Wsu92eQ3TT38 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
D17Wsu92eQ3TT38 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
D17Wsu92eQ3TT38 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
D17Wsu92eQ3TT38 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
D17Wsu92eQ3TT38 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
D17Wsu92eQ3TT38 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
D17Wsu92eQ3TT38 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
D17Wsu92eQ3TT38 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
D17Wsu92eQ3TT38 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
D17Wsu92eQ3TT38 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
D17Wsu92eQ3TT38 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
D17Wsu92eQ3TT38 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
D17Wsu92eQ3TT38 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
D17Wsu92eQ3TT38 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
D17Wsu92eQ3TT38 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
D17Wsu92eQ3TT38 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
D17Wsu92eQ3TT38 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
D17Wsu92eQ3TT38 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
D17Wsu92eQ3TT38 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
D17Wsu92eQ3TT38 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
D17Wsu92eQ3TT38 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
D17Wsu92eQ3TT38 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
D17Wsu92eQ3TT38 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
D17Wsu92eQ3TT38 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
D17Wsu92eQ3TT38 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
D17Wsu92eQ3TT38 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
D17Wsu92eQ3TT38 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
D17Wsu92eQ3TT38 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
D17Wsu92eQ3TT38 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
D17Wsu92eQ3TT38 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
D17Wsu92eQ3TT38 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
D17Wsu92eQ3TT38 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
D17Wsu92eQ3TT38 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
D17Wsu92eQ3TT38 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
D17Wsu92eQ3TT38 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
D17Wsu92eQ3TT38 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
D17Wsu92eQ3TT38 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
D17Wsu92eQ3TT38 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
D17Wsu92eQ3TT38 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
D17Wsu92eQ3TT38 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
D17Wsu92eQ3TT38 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
D17Wsu92eQ3TT38 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
D17Wsu92eQ3TT38 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
D17Wsu92eQ3TT38 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
D17Wsu92eQ3TT38 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
D17Wsu92eQ3TT38 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
D17Wsu92eQ3TT38 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
D17Wsu92eQ3TT38 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
D17Wsu92eQ3TT38 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
D17Wsu92eQ3TT38 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
D17Wsu92eQ3TT38 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
D17Wsu92eQ3TT38 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
D17Wsu92eQ3TT38 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
D17Wsu92eQ3TT38 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
D17Wsu92eQ3TT38 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
D17Wsu92eQ3TT38 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
D17Wsu92eQ3TT38 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
D17Wsu92eQ3TT38 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
D17Wsu92eQ3TT38 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
D17Wsu92eQ3TT38 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
D17Wsu92eQ3TT38 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
D17Wsu92eQ3TT38 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
D17Wsu92eQ3TT38 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
D17Wsu92eQ3TT38 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
D17Wsu92eQ3TT38 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
D17Wsu92eQ3TT38 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
D17Wsu92eQ3TT38 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
D17Wsu92eQ3TT38 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
D17Wsu92eQ3TT38 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
D17Wsu92eQ3TT38 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
D17Wsu92eQ3TT38 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
D17Wsu92eQ3TT38 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
D17Wsu92eQ3TT38 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
D17Wsu92eQ3TT38 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
D17Wsu92eQ3TT38 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
D17Wsu92eQ3TT38 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
D17Wsu92eQ3TT38 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms