Protein–RNA interactions for Protein: Q12488

PSF1, DNA replication complex GINS protein PSF1, yeastyeast

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PSF1Q12488 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt7.78□□□□□ -1.16
PSF1Q12488 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt7.78□□□□□ -1.16
PSF1Q12488 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt7.78□□□□□ -1.16
PSF1Q12488 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt7.78□□□□□ -1.16
PSF1Q12488 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt7.78□□□□□ -1.16
PSF1Q12488 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt7.78□□□□□ -1.16
PSF1Q12488 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt7.78□□□□□ -1.16
PSF1Q12488 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt7.78□□□□□ -1.16
PSF1Q12488 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt7.78□□□□□ -1.16
PSF1Q12488 MIM1YOL026C 342 nt7.78□□□□□ -1.16
PSF1Q12488 SNX3YOR357C 489 nt7.78□□□□□ -1.16
PSF1Q12488 FRA1YLL029W 2250 nt7.77□□□□□ -1.17
PSF1Q12488 LEU4YNL104C 1860 nt7.77□□□□□ -1.17
PSF1Q12488 MET1YKR069W 1782 nt7.76□□□□□ -1.17
PSF1Q12488 KRR1YCL059C 951 nt7.76□□□□□ -1.17
PSF1Q12488 YRF1-2YER190W 5046 nt7.75□□□□□ -1.17
PSF1Q12488 MTO1YGL236C 2010 nt7.75□□□□□ -1.17
PSF1Q12488 DPL1YDR294C 1770 nt7.75□□□□□ -1.17
PSF1Q12488 MDL2YPL270W 2322 nt7.75□□□□□ -1.17
PSF1Q12488 NAM8YHR086W 1572 nt7.74□□□□□ -1.17
PSF1Q12488 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt7.73□□□□□ -1.17
PSF1Q12488 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt7.73□□□□□ -1.17
PSF1Q12488 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt7.73□□□□□ -1.17
PSF1Q12488 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt7.73□□□□□ -1.17
PSF1Q12488 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt7.73□□□□□ -1.17
PSF1Q12488 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt7.73□□□□□ -1.17
PSF1Q12488 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt7.73□□□□□ -1.17
PSF1Q12488 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt7.73□□□□□ -1.17
PSF1Q12488 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt7.73□□□□□ -1.17
PSF1Q12488 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt7.73□□□□□ -1.17
PSF1Q12488 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt7.73□□□□□ -1.17
PSF1Q12488 CRC1YOR100C 984 nt7.73□□□□□ -1.17
PSF1Q12488 IPL1YPL209C 1104 nt7.73□□□□□ -1.17
PSF1Q12488 FLX1YIL134W 936 nt7.72□□□□□ -1.17
PSF1Q12488 RSC4YKR008W 1878 nt7.72□□□□□ -1.17
PSF1Q12488 NPP2YEL016C 1482 nt7.71□□□□□ -1.18
PSF1Q12488 PHB2YGR231C 933 nt7.71□□□□□ -1.18
PSF1Q12488 ADH3YMR083W 1128 nt7.71□□□□□ -1.18
PSF1Q12488 TPN1YGL186C 1740 nt7.71□□□□□ -1.18
PSF1Q12488 YDR467CYDR467C 327 nt7.7□□□□□ -1.18
PSF1Q12488 YKL053WYKL053W 375 nt7.7□□□□□ -1.18
PSF1Q12488 YKR012CYKR012C 378 nt7.7□□□□□ -1.18
PSF1Q12488 FET5YFL041W 1869 nt7.7□□□□□ -1.18
PSF1Q12488 TOM71YHR117W 1920 nt7.7□□□□□ -1.18
PSF1Q12488 REX2YLR059C 810 nt7.69□□□□□ -1.18
PSF1Q12488 SRP54YPR088C 1626 nt7.68□□□□□ -1.18
PSF1Q12488 YCR025CYCR025C 411 nt7.68□□□□□ -1.18
PSF1Q12488 SDS24YBR214W 1584 nt7.67□□□□□ -1.18
PSF1Q12488 SAN1YDR143C 1833 nt7.67□□□□□ -1.18
PSF1Q12488 MOB1YIL106W 945 nt7.67□□□□□ -1.18
PSF1Q12488 SLG1YOR008C 1137 nt7.67□□□□□ -1.18
PSF1Q12488 HBS1YKR084C 1836 nt7.66□□□□□ -1.18
PSF1Q12488 KGD2YDR148C 1392 nt7.65□□□□□ -1.18
PSF1Q12488 CYC3YAL039C 810 nt7.65□□□□□ -1.18
PSF1Q12488 TRP2YER090W 1524 nt7.64□□□□□ -1.19
PSF1Q12488 NSG2YNL156C 900 nt7.64□□□□□ -1.19
PSF1Q12488 YPT11YNL304W 1254 nt7.64□□□□□ -1.19
PSF1Q12488 VBA3YCL069W 1377 nt7.63□□□□□ -1.19
PSF1Q12488 ENO1YGR254W 1314 nt7.63□□□□□ -1.19
PSF1Q12488 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.63□□□□□ -1.19
PSF1Q12488 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.63□□□□□ -1.19
PSF1Q12488 UFD1YGR048W 1086 nt7.62□□□□□ -1.19
PSF1Q12488 SBP1YHL034C 885 nt7.62□□□□□ -1.19
PSF1Q12488 YCP4YCR004C 744 nt7.61□□□□□ -1.19
PSF1Q12488 SRP102YKL154W 735 nt7.61□□□□□ -1.19
PSF1Q12488 ORT1YOR130C 879 nt7.61□□□□□ -1.19
PSF1Q12488 snR4snR4 186 nt7.6□□□□□ -1.19
PSF1Q12488 THI6YPL214C 1623 nt7.6□□□□□ -1.19
PSF1Q12488 GAS1YMR307W 1680 nt7.58□□□□□ -1.2
PSF1Q12488 DUR3YHL016C 2208 nt7.58□□□□□ -1.2
PSF1Q12488 LYS20YDL182W 1287 nt7.58□□□□□ -1.2
PSF1Q12488 SER2YGR208W 930 nt7.58□□□□□ -1.2
PSF1Q12488 FIT1YDR534C 1587 nt7.58□□□□□ -1.2
PSF1Q12488 SAM50YNL026W 1455 nt7.57□□□□□ -1.2
PSF1Q12488 EMC3YKL207W 762 nt7.57□□□□□ -1.2
PSF1Q12488 HXT11YOL156W 1704 nt7.57□□□□□ -1.2
PSF1Q12488 HTS1YPR033C 1641 nt7.56□□□□□ -1.2
PSF1Q12488 PTC6YCR079W 1329 nt7.56□□□□□ -1.2
PSF1Q12488 YBL095WYBL095W 813 nt7.56□□□□□ -1.2
PSF1Q12488 AAT1YKL106W 1356 nt7.56□□□□□ -1.2
PSF1Q12488 SWM1YDR260C 513 nt7.55□□□□□ -1.2
PSF1Q12488 YFR020WYFR020W 699 nt7.55□□□□□ -1.2
PSF1Q12488 YLR280CYLR280C 351 nt7.55□□□□□ -1.2
PSF1Q12488 YMC2YBR104W 990 nt7.55□□□□□ -1.2
PSF1Q12488 GGA2YHR108W 1758 nt7.55□□□□□ -1.2
PSF1Q12488 ERO1YML130C 1692 nt7.54□□□□□ -1.2
PSF1Q12488 DUS3YLR401C 2007 nt7.54□□□□□ -1.2
PSF1Q12488 RSM7YJR113C 744 nt7.54□□□□□ -1.2
PSF1Q12488 GPM1YKL152C 744 nt7.54□□□□□ -1.2
PSF1Q12488 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt7.53□□□□□ -1.2
PSF1Q12488 SRM1YGL097W 1449 nt7.52□□□□□ -1.2
PSF1Q12488 THI3YDL080C 1830 nt7.52□□□□□ -1.2
PSF1Q12488 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.52□□□□□ -1.21
PSF1Q12488 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.52□□□□□ -1.21
PSF1Q12488 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.52□□□□□ -1.21
PSF1Q12488 ALR1YOL130W 2580 nt7.52□□□□□ -1.21
PSF1Q12488 POP2YNR052C 1302 nt7.52□□□□□ -1.21
PSF1Q12488 YLR173WYLR173W 1827 nt7.51□□□□□ -1.21
PSF1Q12488 YIA6YIL006W 1122 nt7.51□□□□□ -1.21
PSF1Q12488 ADE16YLR028C 1776 nt7.5□□□□□ -1.21
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