Protein–RNA interactions for Protein: Q12276

HER1, HMG2-induced ER-remodeling protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HER1Q12276 YNR064CYNR064C 873 nt8.09□□□□□ -1.11
HER1Q12276 EMC3YKL207W 762 nt8.08□□□□□ -1.12
HER1Q12276 ADE16YLR028C 1776 nt8.07□□□□□ -1.12
HER1Q12276 SRM1YGL097W 1449 nt8.06□□□□□ -1.12
HER1Q12276 PAU5YFL020C 369 nt8.06□□□□□ -1.12
HER1Q12276 GPM1YKL152C 744 nt8.06□□□□□ -1.12
HER1Q12276 AAT1YKL106W 1356 nt8.06□□□□□ -1.12
HER1Q12276 SUV3YPL029W 2214 nt8.06□□□□□ -1.12
HER1Q12276 CCT5YJR064W 1689 nt8.05□□□□□ -1.12
HER1Q12276 LPD1YFL018C 1500 nt8.05□□□□□ -1.12
HER1Q12276 YJL064WYJL064W 396 nt8.05□□□□□ -1.12
HER1Q12276 TMA23YMR269W 636 nt8.05□□□□□ -1.12
HER1Q12276 RRT8YOL048C 1029 nt8.05□□□□□ -1.12
HER1Q12276 STP3YLR375W 1032 nt8.04□□□□□ -1.12
HER1Q12276 YMC2YBR104W 990 nt8.04□□□□□ -1.12
HER1Q12276 KEL3YPL263C 1956 nt8.03□□□□□ -1.12
HER1Q12276 YJR114WYJR114W 393 nt8.03□□□□□ -1.12
HER1Q12276 FTH1YBR207W 1398 nt8.01□□□□□ -1.13
HER1Q12276 PAU19YMR325W 375 nt8.01□□□□□ -1.13
HER1Q12276 YMR210WYMR210W 1350 nt8□□□□□ -1.13
HER1Q12276 ADE8YDR408C 645 nt8□□□□□ -1.13
HER1Q12276 IMO32YGR031W 1029 nt8□□□□□ -1.13
HER1Q12276 YJR154WYJR154W 1041 nt8□□□□□ -1.13
HER1Q12276 SNZ1YMR096W 894 nt8□□□□□ -1.13
HER1Q12276 CRC1YOR100C 984 nt8□□□□□ -1.13
HER1Q12276 snR31snR31 225 nt7.98□□□□□ -1.13
HER1Q12276 YGR139WYGR139W 339 nt7.97□□□□□ -1.13
HER1Q12276 NSG2YNL156C 900 nt7.97□□□□□ -1.13
HER1Q12276 YPR126CYPR126C 309 nt7.97□□□□□ -1.13
HER1Q12276 PFS2YNL317W 1398 nt7.97□□□□□ -1.13
HER1Q12276 SLG1YOR008C 1137 nt7.96□□□□□ -1.14
HER1Q12276 HSV2YGR223C 1347 nt7.96□□□□□ -1.14
HER1Q12276 DIA4YHR011W 1341 nt7.96□□□□□ -1.14
HER1Q12276 OPI3YJR073C 621 nt7.93□□□□□ -1.14
HER1Q12276 SFL1YOR140W 2301 nt7.93□□□□□ -1.14
HER1Q12276 THI3YDL080C 1830 nt7.93□□□□□ -1.14
HER1Q12276 GGA2YHR108W 1758 nt7.92□□□□□ -1.14
HER1Q12276 YLR072WYLR072W 2082 nt7.92□□□□□ -1.14
HER1Q12276 MRS4YKR052C 915 nt7.92□□□□□ -1.14
HER1Q12276 TAF13YML098W 504 nt7.92□□□□□ -1.14
HER1Q12276 IML3YBR107C 738 nt7.92□□□□□ -1.14
HER1Q12276 YLR173WYLR173W 1827 nt7.92□□□□□ -1.14
HER1Q12276 RIB1YBL033C 1038 nt7.91□□□□□ -1.14
HER1Q12276 MDH2YOL126C 1134 nt7.91□□□□□ -1.14
HER1Q12276 KGD2YDR148C 1392 nt7.91□□□□□ -1.14
HER1Q12276 MET1YKR069W 1782 nt7.91□□□□□ -1.14
HER1Q12276 MET30YIL046W 1923 nt7.9□□□□□ -1.14
HER1Q12276 CTI6YPL181W 1521 nt7.9□□□□□ -1.14
HER1Q12276 SWT21YNL187W 1074 nt7.9□□□□□ -1.14
HER1Q12276 MHF1YOL086W-A 273 nt7.9□□□□□ -1.14
HER1Q12276 LEA1YPL213W 717 nt7.9□□□□□ -1.14
HER1Q12276 TPN1YGL186C 1740 nt7.89□□□□□ -1.15
HER1Q12276 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.88□□□□□ -1.15
HER1Q12276 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.88□□□□□ -1.15
HER1Q12276 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.88□□□□□ -1.15
HER1Q12276 YIL177CYIL177C 5277 nt7.88□□□□□ -1.15
HER1Q12276 YNL190WYNL190W 615 nt7.88□□□□□ -1.15
HER1Q12276 SLM3YDL033C 1254 nt7.87□□□□□ -1.15
HER1Q12276 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt7.87□□□□□ -1.15
HER1Q12276 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt7.87□□□□□ -1.15
HER1Q12276 snR86snR86 1004 nt7.86□□□□□ -1.15
HER1Q12276 SPS100YHR139C 981 nt7.86□□□□□ -1.15
HER1Q12276 ERG6YML008C 1152 nt7.86□□□□□ -1.15
HER1Q12276 POT1YIL160C 1254 nt7.85□□□□□ -1.15
HER1Q12276 TOM71YHR117W 1920 nt7.84□□□□□ -1.15
HER1Q12276 SBP1YHL034C 885 nt7.84□□□□□ -1.15
HER1Q12276 TVP23YDR084C 600 nt7.83□□□□□ -1.16
HER1Q12276 YIA6YIL006W 1122 nt7.83□□□□□ -1.16
HER1Q12276 YKL053WYKL053W 375 nt7.83□□□□□ -1.16
HER1Q12276 SNU66YOR308C 1764 nt7.82□□□□□ -1.16
HER1Q12276 SOD2YHR008C 702 nt7.82□□□□□ -1.16
HER1Q12276 AIM34YMR003W 597 nt7.82□□□□□ -1.16
HER1Q12276 PAR32YDL173W 888 nt7.81□□□□□ -1.16
HER1Q12276 ABP1YCR088W 1779 nt7.81□□□□□ -1.16
HER1Q12276 GSF2YML048W 1212 nt7.79□□□□□ -1.16
HER1Q12276 HIS3YOR202W 663 nt7.79□□□□□ -1.16
HER1Q12276 AAC3YBR085W 924 nt7.79□□□□□ -1.16
HER1Q12276 PMT7YDR307W 1989 nt7.78□□□□□ -1.16
HER1Q12276 LAS17YOR181W 1902 nt7.78□□□□□ -1.16
HER1Q12276 SAN1YDR143C 1833 nt7.78□□□□□ -1.16
HER1Q12276 TUB4YLR212C 1422 nt7.78□□□□□ -1.16
HER1Q12276 ABZ2YMR289W 1125 nt7.77□□□□□ -1.17
HER1Q12276 NIF3YGL221C 867 nt7.76□□□□□ -1.17
HER1Q12276 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.76□□□□□ -1.17
HER1Q12276 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.76□□□□□ -1.17
HER1Q12276 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.76□□□□□ -1.17
HER1Q12276 AMF1YOR378W 1548 nt7.75□□□□□ -1.17
HER1Q12276 CHA1YCL064C 1083 nt7.75□□□□□ -1.17
HER1Q12276 APS2YJR058C 444 nt7.75□□□□□ -1.17
HER1Q12276 ENO2YHR174W 1314 nt7.75□□□□□ -1.17
HER1Q12276 ADE2YOR128C 1716 nt7.75□□□□□ -1.17
HER1Q12276 NDE2YDL085W 1638 nt7.74□□□□□ -1.17
HER1Q12276 LYS20YDL182W 1287 nt7.74□□□□□ -1.17
HER1Q12276 YPL264CYPL264C 1062 nt7.74□□□□□ -1.17
HER1Q12276 PRC1YMR297W 1599 nt7.74□□□□□ -1.17
HER1Q12276 ITR1YDR497C 1755 nt7.74□□□□□ -1.17
HER1Q12276 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt7.72□□□□□ -1.17
HER1Q12276 YJL009WYJL009W 327 nt7.72□□□□□ -1.17
HER1Q12276 RTG2YGL252C 1767 nt7.71□□□□□ -1.17
HER1Q12276 TMS1YDR105C 1422 nt7.71□□□□□ -1.17
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