Protein–RNA interactions for Protein: Q12241

VAM3, Syntaxin VAM3, yeastyeast

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Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VAM3Q12241 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt7.34□□□□□ -1.23
VAM3Q12241 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt7.34□□□□□ -1.23
VAM3Q12241 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt7.34□□□□□ -1.23
VAM3Q12241 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt7.34□□□□□ -1.23
VAM3Q12241 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt7.34□□□□□ -1.23
VAM3Q12241 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt7.34□□□□□ -1.23
VAM3Q12241 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt7.34□□□□□ -1.23
VAM3Q12241 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt7.34□□□□□ -1.23
VAM3Q12241 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt7.34□□□□□ -1.23
VAM3Q12241 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt7.34□□□□□ -1.23
VAM3Q12241 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt7.34□□□□□ -1.23
VAM3Q12241 MIM1YOL026C 342 nt7.34□□□□□ -1.23
VAM3Q12241 IML3YBR107C 738 nt7.34□□□□□ -1.23
VAM3Q12241 OPI3YJR073C 621 nt7.33□□□□□ -1.24
VAM3Q12241 FET5YFL041W 1869 nt7.32□□□□□ -1.24
VAM3Q12241 TVP23YDR084C 600 nt7.31□□□□□ -1.24
VAM3Q12241 YLR349WYLR349W 507 nt7.31□□□□□ -1.24
VAM3Q12241 YBL095WYBL095W 813 nt7.31□□□□□ -1.24
VAM3Q12241 MHF1YOL086W-A 273 nt7.31□□□□□ -1.24
VAM3Q12241 CTI6YPL181W 1521 nt7.31□□□□□ -1.24
VAM3Q12241 GPM1YKL152C 744 nt7.3□□□□□ -1.24
VAM3Q12241 CRC1YOR100C 984 nt7.3□□□□□ -1.24
VAM3Q12241 HBS1YKR084C 1836 nt7.29□□□□□ -1.24
VAM3Q12241 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt7.29□□□□□ -1.24
VAM3Q12241 SPS100YHR139C 981 nt7.29□□□□□ -1.24
VAM3Q12241 TAF13YML098W 504 nt7.29□□□□□ -1.24
VAM3Q12241 GUT1YHL032C 2130 nt7.28□□□□□ -1.24
VAM3Q12241 UFD1YGR048W 1086 nt7.28□□□□□ -1.24
VAM3Q12241 CPD1YGR247W 720 nt7.27□□□□□ -1.25
VAM3Q12241 SWT21YNL187W 1074 nt7.27□□□□□ -1.25
VAM3Q12241 YMC2YBR104W 990 nt7.26□□□□□ -1.25
VAM3Q12241 TRP2YER090W 1524 nt7.26□□□□□ -1.25
VAM3Q12241 CCR4YAL021C 2514 nt7.26□□□□□ -1.25
VAM3Q12241 MET1YKR069W 1782 nt7.25□□□□□ -1.25
VAM3Q12241 STF1YDL130W-A 261 nt7.24□□□□□ -1.25
VAM3Q12241 POT1YIL160C 1254 nt7.24□□□□□ -1.25
VAM3Q12241 ORT1YOR130C 879 nt7.24□□□□□ -1.25
VAM3Q12241 AAC3YBR085W 924 nt7.24□□□□□ -1.25
VAM3Q12241 HXT11YOL156W 1704 nt7.24□□□□□ -1.25
VAM3Q12241 AAT1YKL106W 1356 nt7.23□□□□□ -1.25
VAM3Q12241 NDE1YMR145C 1683 nt7.23□□□□□ -1.25
VAM3Q12241 EMC3YKL207W 762 nt7.23□□□□□ -1.25
VAM3Q12241 GGA2YHR108W 1758 nt7.23□□□□□ -1.25
VAM3Q12241 PMA2YPL036W 2844 nt7.23□□□□□ -1.25
VAM3Q12241 KGD2YDR148C 1392 nt7.22□□□□□ -1.25
VAM3Q12241 YJL045WYJL045W 1905 nt7.22□□□□□ -1.25
VAM3Q12241 AMF1YOR378W 1548 nt7.22□□□□□ -1.25
VAM3Q12241 RAD51YER095W 1203 nt7.21□□□□□ -1.26
VAM3Q12241 ABZ2YMR289W 1125 nt7.21□□□□□ -1.26
VAM3Q12241 ENO2YHR174W 1314 nt7.21□□□□□ -1.26
VAM3Q12241 THI3YDL080C 1830 nt7.2□□□□□ -1.26
VAM3Q12241 ADH7YCR105W 1086 nt7.2□□□□□ -1.26
VAM3Q12241 FIT1YDR534C 1587 nt7.2□□□□□ -1.26
VAM3Q12241 MET30YIL046W 1923 nt7.19□□□□□ -1.26
VAM3Q12241 SBP1YHL034C 885 nt7.19□□□□□ -1.26
VAM3Q12241 GSF2YML048W 1212 nt7.19□□□□□ -1.26
VAM3Q12241 YNL190WYNL190W 615 nt7.19□□□□□ -1.26
VAM3Q12241 YKL053WYKL053W 375 nt7.18□□□□□ -1.26
VAM3Q12241 MRS4YKR052C 915 nt7.18□□□□□ -1.26
VAM3Q12241 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt7.18□□□□□ -1.26
VAM3Q12241 CBK1YNL161W 2271 nt7.17□□□□□ -1.26
VAM3Q12241 MLS1YNL117W 1665 nt7.17□□□□□ -1.26
VAM3Q12241 PAU15YIR041W 375 nt7.17□□□□□ -1.26
VAM3Q12241 TUB4YLR212C 1422 nt7.17□□□□□ -1.26
VAM3Q12241 FRT1YOR324C 1809 nt7.16□□□□□ -1.26
VAM3Q12241 LAS17YOR181W 1902 nt7.16□□□□□ -1.26
VAM3Q12241 YMR210WYMR210W 1350 nt7.16□□□□□ -1.26
VAM3Q12241 NIF3YGL221C 867 nt7.15□□□□□ -1.26
VAM3Q12241 snR4snR4 186 nt7.15□□□□□ -1.26
VAM3Q12241 SRM1YGL097W 1449 nt7.15□□□□□ -1.27
VAM3Q12241 SAN1YDR143C 1833 nt7.15□□□□□ -1.27
VAM3Q12241 MGM101YJR144W 810 nt7.13□□□□□ -1.27
VAM3Q12241 LEU2YCL018W 1095 nt7.12□□□□□ -1.27
VAM3Q12241 ADE16YLR028C 1776 nt7.12□□□□□ -1.27
VAM3Q12241 YLR072WYLR072W 2082 nt7.12□□□□□ -1.27
VAM3Q12241 ESS1YJR017C 513 nt7.11□□□□□ -1.27
VAM3Q12241 APS2YJR058C 444 nt7.11□□□□□ -1.27
VAM3Q12241 SRP54YPR088C 1626 nt7.1□□□□□ -1.27
VAM3Q12241 PAU5YFL020C 369 nt7.1□□□□□ -1.27
VAM3Q12241 STP3YLR375W 1032 nt7.1□□□□□ -1.27
VAM3Q12241 snR86snR86 1004 nt7.09□□□□□ -1.27
VAM3Q12241 TPC1YGR096W 945 nt7.09□□□□□ -1.27
VAM3Q12241 PGC1YPL206C 966 nt7.09□□□□□ -1.27
VAM3Q12241 DUS3YLR401C 2007 nt7.08□□□□□ -1.28
VAM3Q12241 DIA4YHR011W 1341 nt7.08□□□□□ -1.28
VAM3Q12241 POP2YNR052C 1302 nt7.08□□□□□ -1.28
VAM3Q12241 LEA1YPL213W 717 nt7.08□□□□□ -1.28
VAM3Q12241 GAS1YMR307W 1680 nt7.08□□□□□ -1.28
VAM3Q12241 BEM1YBR200W 1656 nt7.08□□□□□ -1.28
VAM3Q12241 FTH1YBR207W 1398 nt7.08□□□□□ -1.28
VAM3Q12241 PAR32YDL173W 888 nt7.07□□□□□ -1.28
VAM3Q12241 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt7.07□□□□□ -1.28
VAM3Q12241 TMS1YDR105C 1422 nt7.07□□□□□ -1.28
VAM3Q12241 NAM8YHR086W 1572 nt7.07□□□□□ -1.28
VAM3Q12241 YHR131CYHR131C 2553 nt7.07□□□□□ -1.28
VAM3Q12241 AFG2YLR397C 2343 nt7.06□□□□□ -1.28
VAM3Q12241 FSH2YMR222C 672 nt7.06□□□□□ -1.28
VAM3Q12241 KRE1YNL322C 942 nt7.06□□□□□ -1.28
VAM3Q12241 YPL041CYPL041C 624 nt7.06□□□□□ -1.28
VAM3Q12241 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.06□□□□□ -1.28
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