Protein–RNA interactions for Protein: Q12199

TIP41, Type 2A phosphatase activator TIP41, yeastyeast

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TIP41Q12199 CYC3YAL039C 810 nt9.34□□□□□ -0.91
TIP41Q12199 YPT11YNL304W 1254 nt9.34□□□□□ -0.91
TIP41Q12199 SLG1YOR008C 1137 nt9.34□□□□□ -0.91
TIP41Q12199 VBA3YCL069W 1377 nt9.33□□□□□ -0.92
TIP41Q12199 NPP1YCR026C 2229 nt9.31□□□□□ -0.92
TIP41Q12199 YDR467CYDR467C 327 nt9.31□□□□□ -0.92
TIP41Q12199 CYT1YOR065W 930 nt9.31□□□□□ -0.92
TIP41Q12199 GAS1YMR307W 1680 nt9.31□□□□□ -0.92
TIP41Q12199 PSD1YNL169C 1503 nt9.3□□□□□ -0.92
TIP41Q12199 LEU4YNL104C 1860 nt9.3□□□□□ -0.92
TIP41Q12199 PTC6YCR079W 1329 nt9.3□□□□□ -0.92
TIP41Q12199 HXT10YFL011W 1641 nt9.28□□□□□ -0.92
TIP41Q12199 INH1YDL181W 258 nt9.27□□□□□ -0.93
TIP41Q12199 GPM1YKL152C 744 nt9.27□□□□□ -0.93
TIP41Q12199 GGA2YHR108W 1758 nt9.27□□□□□ -0.93
TIP41Q12199 LYS20YDL182W 1287 nt9.26□□□□□ -0.93
TIP41Q12199 SER2YGR208W 930 nt9.26□□□□□ -0.93
TIP41Q12199 SRP102YKL154W 735 nt9.26□□□□□ -0.93
TIP41Q12199 YLR280CYLR280C 351 nt9.26□□□□□ -0.93
TIP41Q12199 YCP4YCR004C 744 nt9.25□□□□□ -0.93
TIP41Q12199 RSM7YJR113C 744 nt9.25□□□□□ -0.93
TIP41Q12199 THI3YDL080C 1830 nt9.24□□□□□ -0.93
TIP41Q12199 HMG2YLR450W 3138 nt9.24□□□□□ -0.93
TIP41Q12199 TPO4YOR273C 1980 nt9.24□□□□□ -0.93
TIP41Q12199 YHR218WYHR218W 1812 nt9.24□□□□□ -0.93
TIP41Q12199 SAM50YNL026W 1455 nt9.23□□□□□ -0.93
TIP41Q12199 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt9.23□□□□□ -0.93
TIP41Q12199 ERO1YML130C 1692 nt9.23□□□□□ -0.93
TIP41Q12199 YRF1-2YER190W 5046 nt9.22□□□□□ -0.93
TIP41Q12199 GID7YCL039W 2238 nt9.22□□□□□ -0.93
TIP41Q12199 YFR020WYFR020W 699 nt9.22□□□□□ -0.93
TIP41Q12199 HTS1YPR033C 1641 nt9.22□□□□□ -0.93
TIP41Q12199 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt9.21□□□□□ -0.94
TIP41Q12199 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt9.21□□□□□ -0.94
TIP41Q12199 AGP3YFL055W 1677 nt9.2□□□□□ -0.94
TIP41Q12199 YBL095WYBL095W 813 nt9.2□□□□□ -0.94
TIP41Q12199 YMC2YBR104W 990 nt9.18□□□□□ -0.94
TIP41Q12199 TGA1tA(UGC)A 73 nt9.17□□□□□ -0.94
TIP41Q12199 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt9.17□□□□□ -0.94
TIP41Q12199 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt9.17□□□□□ -0.94
TIP41Q12199 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt9.17□□□□□ -0.94
TIP41Q12199 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt9.17□□□□□ -0.94
TIP41Q12199 YGR210CYGR210C 1236 nt9.17□□□□□ -0.94
TIP41Q12199 NPP2YEL016C 1482 nt9.15□□□□□ -0.94
TIP41Q12199 SWM1YDR260C 513 nt9.15□□□□□ -0.94
TIP41Q12199 YLR460CYLR460C 1131 nt9.13□□□□□ -0.95
TIP41Q12199 FCY1YPR062W 477 nt9.13□□□□□ -0.95
TIP41Q12199 MRS4YKR052C 915 nt9.12□□□□□ -0.95
TIP41Q12199 YMR007WYMR007W 381 nt9.11□□□□□ -0.95
TIP41Q12199 AAC3YBR085W 924 nt9.11□□□□□ -0.95
TIP41Q12199 YHL008CYHL008C 1884 nt9.09□□□□□ -0.95
TIP41Q12199 YIA6YIL006W 1122 nt9.09□□□□□ -0.95
TIP41Q12199 YPL108WYPL108W 507 nt9.09□□□□□ -0.95
TIP41Q12199 TMS1YDR105C 1422 nt9.08□□□□□ -0.96
TIP41Q12199 CHS7YHR142W 951 nt9.08□□□□□ -0.96
TIP41Q12199 AAT1YKL106W 1356 nt9.08□□□□□ -0.96
TIP41Q12199 YIR035CYIR035C 765 nt9.07□□□□□ -0.96
TIP41Q12199 YMR166CYMR166C 1107 nt9.07□□□□□ -0.96
TIP41Q12199 RCR1YBR005W 642 nt9.07□□□□□ -0.96
TIP41Q12199 TPN1YGL186C 1740 nt9.06□□□□□ -0.96
TIP41Q12199 YJL009WYJL009W 327 nt9.05□□□□□ -0.96
TIP41Q12199 YJR149WYJR149W 1215 nt9.05□□□□□ -0.96
TIP41Q12199 RIB1YBL033C 1038 nt9.05□□□□□ -0.96
TIP41Q12199 OLA1YBR025C 1185 nt9.05□□□□□ -0.96
TIP41Q12199 LSP1YPL004C 1026 nt9.05□□□□□ -0.96
TIP41Q12199 SOD2YHR008C 702 nt9.04□□□□□ -0.96
TIP41Q12199 MTO1YGL236C 2010 nt9.04□□□□□ -0.96
TIP41Q12199 MET22YOL064C 1074 nt9.03□□□□□ -0.96
TIP41Q12199 BUB2YMR055C 921 nt9.02□□□□□ -0.97
TIP41Q12199 URA8YJR103W 1737 nt9.02□□□□□ -0.97
TIP41Q12199 CAK1YFL029C 1107 nt9.01□□□□□ -0.97
TIP41Q12199 OCH1YGL038C 1443 nt9.01□□□□□ -0.97
TIP41Q12199 BSP1YPR171W 1731 nt9.01□□□□□ -0.97
TIP41Q12199 RRT14YIL127C 621 nt8.99□□□□□ -0.97
TIP41Q12199 NBA1YOL070C 1506 nt8.99□□□□□ -0.97
TIP41Q12199 snR86snR86 1004 nt8.98□□□□□ -0.97
TIP41Q12199 YJL160CYJL160C 864 nt8.98□□□□□ -0.97
TIP41Q12199 EMC3YKL207W 762 nt8.98□□□□□ -0.97
TIP41Q12199 YBR056WYBR056W 1506 nt8.97□□□□□ -0.97
TIP41Q12199 ERG6YML008C 1152 nt8.97□□□□□ -0.97
TIP41Q12199 RNA170RNA170 169 nt8.97□□□□□ -0.97
TIP41Q12199 PDC6YGR087C 1692 nt8.97□□□□□ -0.97
TIP41Q12199 TRP2YER090W 1524 nt8.96□□□□□ -0.97
TIP41Q12199 THI6YPL214C 1623 nt8.96□□□□□ -0.98
TIP41Q12199 FET5YFL041W 1869 nt8.94□□□□□ -0.98
TIP41Q12199 MEP1YGR121C 1479 nt8.94□□□□□ -0.98
TIP41Q12199 PET18YCR020C 648 nt8.93□□□□□ -0.98
TIP41Q12199 YMR210WYMR210W 1350 nt8.93□□□□□ -0.98
TIP41Q12199 HXK1YFR053C 1458 nt8.93□□□□□ -0.98
TIP41Q12199 YPT31YER031C 672 nt8.91□□□□□ -0.98
TIP41Q12199 RHO1YPR165W 630 nt8.91□□□□□ -0.98
TIP41Q12199 ALD5YER073W 1563 nt8.9□□□□□ -0.99
TIP41Q12199 HXT11YOL156W 1704 nt8.88□□□□□ -0.99
TIP41Q12199 THI73YLR004C 1572 nt8.88□□□□□ -0.99
TIP41Q12199 YPR084WYPR084W 1371 nt8.87□□□□□ -0.99
TIP41Q12199 MFT1YML062C 1179 nt8.87□□□□□ -0.99
TIP41Q12199 YRF1-3YGR296W 5580 nt8.86□□□□□ -0.99
TIP41Q12199 YRF1-6YNL339C 5580 nt8.86□□□□□ -0.99
TIP41Q12199 YRF1-7YPL283C 5580 nt8.86□□□□□ -0.99
TIP41Q12199 YER156CYER156C 1017 nt8.86□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.9 ms