Protein–RNA interactions for Protein: Q12024

YTM1, Ribosome biogenesis protein YTM1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YTM1Q12024 ELO1YJL196C 933 nt8.06□□□□□ -1.12
YTM1Q12024 YNL165WYNL165W 1221 nt8.06□□□□□ -1.12
YTM1Q12024 ENO2YHR174W 1314 nt8.05□□□□□ -1.12
YTM1Q12024 AGP3YFL055W 1677 nt8.05□□□□□ -1.12
YTM1Q12024 BNS1YGR230W 414 nt8.05□□□□□ -1.12
YTM1Q12024 APS2YJR058C 444 nt8.05□□□□□ -1.12
YTM1Q12024 YMR265CYMR265C 1386 nt8.05□□□□□ -1.12
YTM1Q12024 NIF3YGL221C 867 nt8.04□□□□□ -1.12
YTM1Q12024 YLR122CYLR122C 378 nt8.04□□□□□ -1.12
YTM1Q12024 KRE1YNL322C 942 nt8.03□□□□□ -1.12
YTM1Q12024 KEL3YPL263C 1956 nt8.02□□□□□ -1.12
YTM1Q12024 SUV3YPL029W 2214 nt8.02□□□□□ -1.13
YTM1Q12024 YKR023WYKR023W 1593 nt8.02□□□□□ -1.13
YTM1Q12024 TOM20YGR082W 552 nt8.02□□□□□ -1.13
YTM1Q12024 HAP5YOR358W 729 nt8.02□□□□□ -1.13
YTM1Q12024 AMF1YOR378W 1548 nt8.02□□□□□ -1.13
YTM1Q12024 PCP1YGR101W 1041 nt8.01□□□□□ -1.13
YTM1Q12024 NAP1YKR048C 1254 nt8.01□□□□□ -1.13
YTM1Q12024 SEN2YLR105C 1134 nt8.01□□□□□ -1.13
YTM1Q12024 URA8YJR103W 1737 nt8□□□□□ -1.13
YTM1Q12024 snR31snR31 225 nt8□□□□□ -1.13
YTM1Q12024 LEU4YNL104C 1860 nt8□□□□□ -1.13
YTM1Q12024 INH1YDL181W 258 nt7.99□□□□□ -1.13
YTM1Q12024 RPN14YGL004C 1254 nt7.99□□□□□ -1.13
YTM1Q12024 YPL277CYPL277C 1464 nt7.97□□□□□ -1.13
YTM1Q12024 SFL1YOR140W 2301 nt7.97□□□□□ -1.13
YTM1Q12024 GAL2YLR081W 1725 nt7.96□□□□□ -1.14
YTM1Q12024 TPC1YGR096W 945 nt7.96□□□□□ -1.14
YTM1Q12024 LEU2YCL018W 1095 nt7.96□□□□□ -1.14
YTM1Q12024 NBA1YOL070C 1506 nt7.96□□□□□ -1.14
YTM1Q12024 IGD1YFR017C 588 nt7.95□□□□□ -1.14
YTM1Q12024 ARA2YMR041C 1008 nt7.95□□□□□ -1.14
YTM1Q12024 FSH2YMR222C 672 nt7.95□□□□□ -1.14
YTM1Q12024 SWT21YNL187W 1074 nt7.95□□□□□ -1.14
YTM1Q12024 SPE2YOL052C 1191 nt7.95□□□□□ -1.14
YTM1Q12024 CRC1YOR100C 984 nt7.94□□□□□ -1.14
YTM1Q12024 THP3YPR045C 1413 nt7.94□□□□□ -1.14
YTM1Q12024 FRA1YLL029W 2250 nt7.92□□□□□ -1.14
YTM1Q12024 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.92□□□□□ -1.14
YTM1Q12024 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.92□□□□□ -1.14
YTM1Q12024 YDR467CYDR467C 327 nt7.92□□□□□ -1.14
YTM1Q12024 YJL064WYJL064W 396 nt7.92□□□□□ -1.14
YTM1Q12024 MET1YKR069W 1782 nt7.92□□□□□ -1.14
YTM1Q12024 MAK32YCR019W 1092 nt7.91□□□□□ -1.14
YTM1Q12024 NAS2YIL007C 663 nt7.91□□□□□ -1.14
YTM1Q12024 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt7.91□□□□□ -1.14
YTM1Q12024 GTB1YDR221W 2109 nt7.9□□□□□ -1.14
YTM1Q12024 NPP2YEL016C 1482 nt7.9□□□□□ -1.14
YTM1Q12024 PAU19YMR325W 375 nt7.9□□□□□ -1.14
YTM1Q12024 NAM8YHR086W 1572 nt7.89□□□□□ -1.15
YTM1Q12024 ECM27YJR106W 2178 nt7.89□□□□□ -1.15
YTM1Q12024 TOK1YJL093C 2076 nt7.87□□□□□ -1.15
YTM1Q12024 FET5YFL041W 1869 nt7.87□□□□□ -1.15
YTM1Q12024 HXK1YFR053C 1458 nt7.87□□□□□ -1.15
YTM1Q12024 ALD5YER073W 1563 nt7.86□□□□□ -1.15
YTM1Q12024 YJL211CYJL211C 444 nt7.86□□□□□ -1.15
YTM1Q12024 CDD1YLR245C 429 nt7.86□□□□□ -1.15
YTM1Q12024 KGD2YDR148C 1392 nt7.85□□□□□ -1.15
YTM1Q12024 GPM1YKL152C 744 nt7.85□□□□□ -1.15
YTM1Q12024 REX2YLR059C 810 nt7.85□□□□□ -1.15
YTM1Q12024 YKL053WYKL053W 375 nt7.84□□□□□ -1.15
YTM1Q12024 YKR012CYKR012C 378 nt7.84□□□□□ -1.15
YTM1Q12024 PUP1YOR157C 786 nt7.84□□□□□ -1.15
YTM1Q12024 IPL1YPL209C 1104 nt7.84□□□□□ -1.15
YTM1Q12024 SRP54YPR088C 1626 nt7.83□□□□□ -1.16
YTM1Q12024 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt7.83□□□□□ -1.16
YTM1Q12024 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt7.83□□□□□ -1.16
YTM1Q12024 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt7.83□□□□□ -1.16
YTM1Q12024 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt7.83□□□□□ -1.16
YTM1Q12024 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt7.83□□□□□ -1.16
YTM1Q12024 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt7.83□□□□□ -1.16
YTM1Q12024 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt7.83□□□□□ -1.16
YTM1Q12024 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt7.83□□□□□ -1.16
YTM1Q12024 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt7.83□□□□□ -1.16
YTM1Q12024 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt7.83□□□□□ -1.16
YTM1Q12024 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt7.83□□□□□ -1.16
YTM1Q12024 ADH3YMR083W 1128 nt7.83□□□□□ -1.16
YTM1Q12024 SWP1YMR149W 861 nt7.83□□□□□ -1.16
YTM1Q12024 YBL095WYBL095W 813 nt7.83□□□□□ -1.16
YTM1Q12024 YOR072WYOR072W 315 nt7.83□□□□□ -1.16
YTM1Q12024 EEB1YPL095C 1371 nt7.83□□□□□ -1.16
YTM1Q12024 YCR025CYCR025C 411 nt7.82□□□□□ -1.16
YTM1Q12024 MOB1YIL106W 945 nt7.82□□□□□ -1.16
YTM1Q12024 FLX1YIL134W 936 nt7.82□□□□□ -1.16
YTM1Q12024 THI3YDL080C 1830 nt7.81□□□□□ -1.16
YTM1Q12024 PHB2YGR231C 933 nt7.81□□□□□ -1.16
YTM1Q12024 SAN1YDR143C 1833 nt7.8□□□□□ -1.16
YTM1Q12024 YPT11YNL304W 1254 nt7.8□□□□□ -1.16
YTM1Q12024 MTO1YGL236C 2010 nt7.79□□□□□ -1.16
YTM1Q12024 GGA2YHR108W 1758 nt7.79□□□□□ -1.16
YTM1Q12024 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt7.79□□□□□ -1.16
YTM1Q12024 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt7.79□□□□□ -1.16
YTM1Q12024 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt7.79□□□□□ -1.16
YTM1Q12024 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt7.79□□□□□ -1.16
YTM1Q12024 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt7.79□□□□□ -1.16
YTM1Q12024 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt7.79□□□□□ -1.16
YTM1Q12024 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt7.79□□□□□ -1.16
YTM1Q12024 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt7.79□□□□□ -1.16
YTM1Q12024 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt7.79□□□□□ -1.16
YTM1Q12024 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt7.79□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 40.2 ms