Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
F13bQ07968 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
F13bQ07968 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
F13bQ07968 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
F13bQ07968 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
F13bQ07968 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
F13bQ07968 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
F13bQ07968 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
F13bQ07968 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
F13bQ07968 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
F13bQ07968 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
F13bQ07968 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
F13bQ07968 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
F13bQ07968 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
F13bQ07968 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
F13bQ07968 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
F13bQ07968 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
F13bQ07968 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
F13bQ07968 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
F13bQ07968 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
F13bQ07968 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
F13bQ07968 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
F13bQ07968 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
F13bQ07968 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
F13bQ07968 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
F13bQ07968 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
F13bQ07968 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
F13bQ07968 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
F13bQ07968 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
F13bQ07968 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
F13bQ07968 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
F13bQ07968 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
F13bQ07968 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
F13bQ07968 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
F13bQ07968 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
F13bQ07968 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
F13bQ07968 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
F13bQ07968 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
F13bQ07968 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
F13bQ07968 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
F13bQ07968 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
F13bQ07968 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
F13bQ07968 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
F13bQ07968 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
F13bQ07968 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
F13bQ07968 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
F13bQ07968 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
F13bQ07968 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
F13bQ07968 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
F13bQ07968 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
F13bQ07968 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
F13bQ07968 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
F13bQ07968 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
F13bQ07968 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
F13bQ07968 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
F13bQ07968 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
F13bQ07968 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
F13bQ07968 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
F13bQ07968 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
F13bQ07968 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
F13bQ07968 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
F13bQ07968 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
F13bQ07968 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
F13bQ07968 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
F13bQ07968 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
F13bQ07968 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
F13bQ07968 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
F13bQ07968 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
F13bQ07968 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
F13bQ07968 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
F13bQ07968 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
F13bQ07968 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
F13bQ07968 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
F13bQ07968 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
F13bQ07968 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
F13bQ07968 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
F13bQ07968 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
F13bQ07968 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
F13bQ07968 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
F13bQ07968 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
F13bQ07968 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
F13bQ07968 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
F13bQ07968 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
F13bQ07968 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
F13bQ07968 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
F13bQ07968 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
F13bQ07968 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
F13bQ07968 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
F13bQ07968 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
F13bQ07968 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
F13bQ07968 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
F13bQ07968 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
F13bQ07968 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
F13bQ07968 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
F13bQ07968 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
F13bQ07968 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
F13bQ07968 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
F13bQ07968 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
F13bQ07968 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
F13bQ07968 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms