Protein–RNA interactions for Protein: Q06835

RDS3, Pre-mRNA-splicing factor RDS3, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RDS3Q06835 SRP102YKL154W 735 nt6.14□□□□□ -1.43
RDS3Q06835 REX2YLR059C 810 nt6.14□□□□□ -1.43
RDS3Q06835 YMR007WYMR007W 381 nt6.14□□□□□ -1.43
RDS3Q06835 YKL053WYKL053W 375 nt6.13□□□□□ -1.43
RDS3Q06835 ENO1YGR254W 1314 nt6.13□□□□□ -1.43
RDS3Q06835 POP2YNR052C 1302 nt6.13□□□□□ -1.43
RDS3Q06835 MAE1YKL029C 2010 nt6.13□□□□□ -1.43
RDS3Q06835 RPC31YNL151C 756 nt6.12□□□□□ -1.43
RDS3Q06835 CRC1YOR100C 984 nt6.12□□□□□ -1.43
RDS3Q06835 SRP54YPR088C 1626 nt6.12□□□□□ -1.43
RDS3Q06835 KRR1YCL059C 951 nt6.11□□□□□ -1.43
RDS3Q06835 YER152W-AYER152W-A 567 nt6.11□□□□□ -1.43
RDS3Q06835 RCR1YBR005W 642 nt6.11□□□□□ -1.43
RDS3Q06835 ERO1YML130C 1692 nt6.1□□□□□ -1.43
RDS3Q06835 YLR280CYLR280C 351 nt6.1□□□□□ -1.43
RDS3Q06835 SAN1YDR143C 1833 nt6.1□□□□□ -1.43
RDS3Q06835 YGR210CYGR210C 1236 nt6.09□□□□□ -1.43
RDS3Q06835 HXT10YFL011W 1641 nt6.08□□□□□ -1.44
RDS3Q06835 INH1YDL181W 258 nt6.08□□□□□ -1.44
RDS3Q06835 TGA1tA(UGC)A 73 nt6.07□□□□□ -1.44
RDS3Q06835 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt6.07□□□□□ -1.44
RDS3Q06835 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt6.07□□□□□ -1.44
RDS3Q06835 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt6.07□□□□□ -1.44
RDS3Q06835 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt6.07□□□□□ -1.44
RDS3Q06835 YPT11YNL304W 1254 nt6.07□□□□□ -1.44
RDS3Q06835 KGD2YDR148C 1392 nt6.06□□□□□ -1.44
RDS3Q06835 YDR467CYDR467C 327 nt6.06□□□□□ -1.44
RDS3Q06835 YFR020WYFR020W 699 nt6.06□□□□□ -1.44
RDS3Q06835 RIM2YBR192W 1134 nt6.06□□□□□ -1.44
RDS3Q06835 YPL108WYPL108W 507 nt6.05□□□□□ -1.44
RDS3Q06835 YHR218WYHR218W 1812 nt6.04□□□□□ -1.44
RDS3Q06835 LEU4YNL104C 1860 nt6.04□□□□□ -1.44
RDS3Q06835 FCY1YPR062W 477 nt6.03□□□□□ -1.44
RDS3Q06835 DPL1YDR294C 1770 nt6.03□□□□□ -1.44
RDS3Q06835 GAS1YMR307W 1680 nt6.02□□□□□ -1.45
RDS3Q06835 BUD20YLR074C 501 nt6.02□□□□□ -1.45
RDS3Q06835 PTC6YCR079W 1329 nt6.01□□□□□ -1.45
RDS3Q06835 AGP3YFL055W 1677 nt6.01□□□□□ -1.45
RDS3Q06835 SBP1YHL034C 885 nt6.01□□□□□ -1.45
RDS3Q06835 YJL160CYJL160C 864 nt6.01□□□□□ -1.45
RDS3Q06835 RSM7YJR113C 744 nt6□□□□□ -1.45
RDS3Q06835 PAU21YOR394W 495 nt5.99□□□□□ -1.45
RDS3Q06835 PAU22YPL282C 495 nt5.99□□□□□ -1.45
RDS3Q06835 EMC3YKL207W 762 nt5.98□□□□□ -1.45
RDS3Q06835 YMR166CYMR166C 1107 nt5.98□□□□□ -1.45
RDS3Q06835 YOR343CYOR343C 327 nt5.98□□□□□ -1.45
RDS3Q06835 YMC2YBR104W 990 nt5.98□□□□□ -1.45
RDS3Q06835 YHL008CYHL008C 1884 nt5.98□□□□□ -1.45
RDS3Q06835 GPM1YKL152C 744 nt5.97□□□□□ -1.45
RDS3Q06835 YMR210WYMR210W 1350 nt5.96□□□□□ -1.45
RDS3Q06835 GRH1YDR517W 1119 nt5.96□□□□□ -1.46
RDS3Q06835 HRA1HRA1 564 nt5.96□□□□□ -1.46
RDS3Q06835 YBL095WYBL095W 813 nt5.96□□□□□ -1.46
RDS3Q06835 LSP1YPL004C 1026 nt5.96□□□□□ -1.46
RDS3Q06835 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt5.95□□□□□ -1.46
RDS3Q06835 GGA2YHR108W 1758 nt5.95□□□□□ -1.46
RDS3Q06835 NPP2YEL016C 1482 nt5.95□□□□□ -1.46
RDS3Q06835 RRT14YIL127C 621 nt5.94□□□□□ -1.46
RDS3Q06835 THI3YDL080C 1830 nt5.93□□□□□ -1.46
RDS3Q06835 PET18YCR020C 648 nt5.93□□□□□ -1.46
RDS3Q06835 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt5.93□□□□□ -1.46
RDS3Q06835 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt5.93□□□□□ -1.46
RDS3Q06835 RPL12BYDR418W 498 nt5.93□□□□□ -1.46
RDS3Q06835 YLR460CYLR460C 1131 nt5.93□□□□□ -1.46
RDS3Q06835 YRF1-2YER190W 5046 nt5.93□□□□□ -1.46
RDS3Q06835 MRP1YDR347W 966 nt5.92□□□□□ -1.46
RDS3Q06835 MET22YOL064C 1074 nt5.92□□□□□ -1.46
RDS3Q06835 NBA1YOL070C 1506 nt5.92□□□□□ -1.46
RDS3Q06835 OCH1YGL038C 1443 nt5.91□□□□□ -1.46
RDS3Q06835 CAK1YFL029C 1107 nt5.91□□□□□ -1.46
RDS3Q06835 CHS7YHR142W 951 nt5.91□□□□□ -1.46
RDS3Q06835 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt5.91□□□□□ -1.46
RDS3Q06835 MRS4YKR052C 915 nt5.91□□□□□ -1.46
RDS3Q06835 YOR072WYOR072W 315 nt5.91□□□□□ -1.46
RDS3Q06835 AAT1YKL106W 1356 nt5.91□□□□□ -1.46
RDS3Q06835 YER156CYER156C 1017 nt5.9□□□□□ -1.46
RDS3Q06835 PDC6YGR087C 1692 nt5.89□□□□□ -1.47
RDS3Q06835 GDH1YOR375C 1365 nt5.89□□□□□ -1.47
RDS3Q06835 MTO1YGL236C 2010 nt5.89□□□□□ -1.47
RDS3Q06835 MET2YNL277W 1461 nt5.89□□□□□ -1.47
RDS3Q06835 MFT1YML062C 1179 nt5.88□□□□□ -1.47
RDS3Q06835 ADA2YDR448W 1305 nt5.88□□□□□ -1.47
RDS3Q06835 BSP1YPR171W 1731 nt5.88□□□□□ -1.47
RDS3Q06835 UTR5YEL035C 501 nt5.87□□□□□ -1.47
RDS3Q06835 YIR035CYIR035C 765 nt5.87□□□□□ -1.47
RDS3Q06835 YJL009WYJL009W 327 nt5.87□□□□□ -1.47
RDS3Q06835 RNA170RNA170 169 nt5.87□□□□□ -1.47
RDS3Q06835 TPO4YOR273C 1980 nt5.87□□□□□ -1.47
RDS3Q06835 TPN1YGL186C 1740 nt5.86□□□□□ -1.47
RDS3Q06835 TRP2YER090W 1524 nt5.86□□□□□ -1.47
RDS3Q06835 OLA1YBR025C 1185 nt5.86□□□□□ -1.47
RDS3Q06835 AAC3YBR085W 924 nt5.86□□□□□ -1.47
RDS3Q06835 TMS1YDR105C 1422 nt5.85□□□□□ -1.47
RDS3Q06835 TAD2YJL035C 753 nt5.85□□□□□ -1.47
RDS3Q06835 THI6YPL214C 1623 nt5.85□□□□□ -1.47
RDS3Q06835 HXK1YFR053C 1458 nt5.84□□□□□ -1.47
RDS3Q06835 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt5.84□□□□□ -1.47
RDS3Q06835 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt5.84□□□□□ -1.47
RDS3Q06835 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt5.84□□□□□ -1.47
RDS3Q06835 SUP51tL(UAA)J 84 nt5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25.4 ms