Protein–RNA interactions for Protein: Q01965

Ly9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly9Q01965 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ly9Q01965 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ly9Q01965 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ly9Q01965 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ly9Q01965 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ly9Q01965 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ly9Q01965 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ly9Q01965 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Ly9Q01965 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ly9Q01965 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ly9Q01965 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ly9Q01965 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ly9Q01965 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ly9Q01965 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Ly9Q01965 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ly9Q01965 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ly9Q01965 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ly9Q01965 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ly9Q01965 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ly9Q01965 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Ly9Q01965 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ly9Q01965 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ly9Q01965 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ly9Q01965 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ly9Q01965 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ly9Q01965 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ly9Q01965 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ly9Q01965 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ly9Q01965 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ly9Q01965 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ly9Q01965 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ly9Q01965 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ly9Q01965 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ly9Q01965 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ly9Q01965 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ly9Q01965 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ly9Q01965 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Ly9Q01965 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ly9Q01965 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ly9Q01965 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ly9Q01965 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Ly9Q01965 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ly9Q01965 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ly9Q01965 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ly9Q01965 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ly9Q01965 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ly9Q01965 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ly9Q01965 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ly9Q01965 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ly9Q01965 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ly9Q01965 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ly9Q01965 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ly9Q01965 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ly9Q01965 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ly9Q01965 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ly9Q01965 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ly9Q01965 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ly9Q01965 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ly9Q01965 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ly9Q01965 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ly9Q01965 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Ly9Q01965 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ly9Q01965 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ly9Q01965 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ly9Q01965 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ly9Q01965 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ly9Q01965 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ly9Q01965 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ly9Q01965 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ly9Q01965 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ly9Q01965 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ly9Q01965 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ly9Q01965 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ly9Q01965 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ly9Q01965 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ly9Q01965 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ly9Q01965 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ly9Q01965 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ly9Q01965 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ly9Q01965 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ly9Q01965 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ly9Q01965 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ly9Q01965 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ly9Q01965 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ly9Q01965 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ly9Q01965 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ly9Q01965 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ly9Q01965 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ly9Q01965 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ly9Q01965 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ly9Q01965 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ly9Q01965 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ly9Q01965 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ly9Q01965 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ly9Q01965 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ly9Q01965 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ly9Q01965 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ly9Q01965 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ly9Q01965 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ly9Q01965 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms