Protein–RNA interactions for Protein: P97368

Meis3, Homeobox protein Meis3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis3P97368 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Meis3P97368 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Meis3P97368 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Meis3P97368 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Meis3P97368 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Meis3P97368 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Meis3P97368 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Meis3P97368 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Meis3P97368 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Meis3P97368 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Meis3P97368 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Meis3P97368 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Meis3P97368 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Meis3P97368 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Meis3P97368 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Meis3P97368 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Meis3P97368 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Meis3P97368 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Meis3P97368 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Meis3P97368 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Meis3P97368 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Meis3P97368 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Meis3P97368 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Meis3P97368 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Meis3P97368 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Meis3P97368 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Meis3P97368 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Meis3P97368 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Meis3P97368 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Meis3P97368 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Meis3P97368 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Meis3P97368 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Meis3P97368 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Meis3P97368 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Meis3P97368 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Meis3P97368 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Meis3P97368 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Meis3P97368 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Meis3P97368 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Meis3P97368 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Meis3P97368 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Meis3P97368 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Meis3P97368 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Meis3P97368 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Meis3P97368 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Meis3P97368 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Meis3P97368 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Meis3P97368 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Meis3P97368 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Meis3P97368 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Meis3P97368 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Meis3P97368 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Meis3P97368 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Meis3P97368 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Meis3P97368 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Meis3P97368 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Meis3P97368 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Meis3P97368 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Meis3P97368 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Meis3P97368 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Meis3P97368 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Meis3P97368 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Meis3P97368 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Meis3P97368 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Meis3P97368 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Meis3P97368 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Meis3P97368 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Meis3P97368 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Meis3P97368 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Meis3P97368 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Meis3P97368 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Meis3P97368 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Meis3P97368 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Meis3P97368 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Meis3P97368 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Meis3P97368 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Meis3P97368 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Meis3P97368 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Meis3P97368 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Meis3P97368 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Meis3P97368 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Meis3P97368 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Meis3P97368 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Meis3P97368 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Meis3P97368 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Meis3P97368 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Meis3P97368 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Meis3P97368 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Meis3P97368 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Meis3P97368 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Meis3P97368 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Meis3P97368 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Meis3P97368 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Meis3P97368 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Meis3P97368 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Meis3P97368 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Meis3P97368 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Meis3P97368 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Meis3P97368 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Meis3P97368 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms