Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RhodP97348 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RhodP97348 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RhodP97348 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RhodP97348 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RhodP97348 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RhodP97348 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RhodP97348 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RhodP97348 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RhodP97348 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RhodP97348 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RhodP97348 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RhodP97348 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RhodP97348 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RhodP97348 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RhodP97348 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RhodP97348 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RhodP97348 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RhodP97348 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RhodP97348 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RhodP97348 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RhodP97348 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RhodP97348 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RhodP97348 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RhodP97348 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RhodP97348 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RhodP97348 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
RhodP97348 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RhodP97348 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RhodP97348 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RhodP97348 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RhodP97348 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RhodP97348 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RhodP97348 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RhodP97348 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RhodP97348 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RhodP97348 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RhodP97348 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RhodP97348 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RhodP97348 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RhodP97348 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RhodP97348 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RhodP97348 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RhodP97348 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RhodP97348 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RhodP97348 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RhodP97348 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RhodP97348 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RhodP97348 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RhodP97348 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RhodP97348 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RhodP97348 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RhodP97348 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RhodP97348 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RhodP97348 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RhodP97348 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RhodP97348 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RhodP97348 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RhodP97348 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RhodP97348 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RhodP97348 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RhodP97348 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RhodP97348 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RhodP97348 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RhodP97348 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RhodP97348 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RhodP97348 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RhodP97348 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RhodP97348 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RhodP97348 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RhodP97348 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RhodP97348 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RhodP97348 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RhodP97348 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RhodP97348 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RhodP97348 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RhodP97348 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RhodP97348 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RhodP97348 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RhodP97348 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RhodP97348 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RhodP97348 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RhodP97348 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RhodP97348 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RhodP97348 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RhodP97348 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RhodP97348 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RhodP97348 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RhodP97348 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RhodP97348 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RhodP97348 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RhodP97348 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RhodP97348 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RhodP97348 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
RhodP97348 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RhodP97348 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RhodP97348 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RhodP97348 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RhodP97348 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RhodP97348 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms