Protein–RNA interactions for Protein: P61407

Tdrd6, Tudor domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd6P61407 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tdrd6P61407 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tdrd6P61407 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tdrd6P61407 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tdrd6P61407 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Tdrd6P61407 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tdrd6P61407 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tdrd6P61407 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tdrd6P61407 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tdrd6P61407 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tdrd6P61407 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Tdrd6P61407 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tdrd6P61407 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tdrd6P61407 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tdrd6P61407 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tdrd6P61407 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tdrd6P61407 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Tdrd6P61407 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tdrd6P61407 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tdrd6P61407 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tdrd6P61407 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tdrd6P61407 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tdrd6P61407 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tdrd6P61407 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tdrd6P61407 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tdrd6P61407 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tdrd6P61407 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tdrd6P61407 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tdrd6P61407 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tdrd6P61407 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Tdrd6P61407 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tdrd6P61407 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tdrd6P61407 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tdrd6P61407 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tdrd6P61407 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tdrd6P61407 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tdrd6P61407 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Tdrd6P61407 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tdrd6P61407 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tdrd6P61407 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tdrd6P61407 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tdrd6P61407 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tdrd6P61407 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tdrd6P61407 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tdrd6P61407 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tdrd6P61407 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tdrd6P61407 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tdrd6P61407 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tdrd6P61407 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tdrd6P61407 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tdrd6P61407 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tdrd6P61407 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tdrd6P61407 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tdrd6P61407 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tdrd6P61407 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tdrd6P61407 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tdrd6P61407 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tdrd6P61407 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tdrd6P61407 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tdrd6P61407 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tdrd6P61407 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tdrd6P61407 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tdrd6P61407 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tdrd6P61407 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tdrd6P61407 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tdrd6P61407 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tdrd6P61407 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Tdrd6P61407 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tdrd6P61407 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tdrd6P61407 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tdrd6P61407 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tdrd6P61407 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tdrd6P61407 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tdrd6P61407 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tdrd6P61407 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tdrd6P61407 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tdrd6P61407 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Tdrd6P61407 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tdrd6P61407 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tdrd6P61407 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tdrd6P61407 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tdrd6P61407 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Tdrd6P61407 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tdrd6P61407 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tdrd6P61407 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tdrd6P61407 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Tdrd6P61407 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tdrd6P61407 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tdrd6P61407 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tdrd6P61407 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tdrd6P61407 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tdrd6P61407 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tdrd6P61407 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tdrd6P61407 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tdrd6P61407 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tdrd6P61407 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tdrd6P61407 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tdrd6P61407 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tdrd6P61407 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tdrd6P61407 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms