Protein–RNA interactions for Protein: P56564

Slc1a3, Excitatory amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a3P56564 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc1a3P56564 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc1a3P56564 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc1a3P56564 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc1a3P56564 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc1a3P56564 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc1a3P56564 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc1a3P56564 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc1a3P56564 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc1a3P56564 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc1a3P56564 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc1a3P56564 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc1a3P56564 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc1a3P56564 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc1a3P56564 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc1a3P56564 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc1a3P56564 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc1a3P56564 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc1a3P56564 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc1a3P56564 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc1a3P56564 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc1a3P56564 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc1a3P56564 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc1a3P56564 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc1a3P56564 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc1a3P56564 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc1a3P56564 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc1a3P56564 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc1a3P56564 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc1a3P56564 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc1a3P56564 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc1a3P56564 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc1a3P56564 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slc1a3P56564 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc1a3P56564 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc1a3P56564 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc1a3P56564 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc1a3P56564 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc1a3P56564 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc1a3P56564 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc1a3P56564 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc1a3P56564 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc1a3P56564 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc1a3P56564 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc1a3P56564 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc1a3P56564 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc1a3P56564 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc1a3P56564 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc1a3P56564 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc1a3P56564 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc1a3P56564 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc1a3P56564 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc1a3P56564 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc1a3P56564 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc1a3P56564 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc1a3P56564 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc1a3P56564 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc1a3P56564 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc1a3P56564 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc1a3P56564 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc1a3P56564 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc1a3P56564 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc1a3P56564 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc1a3P56564 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc1a3P56564 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc1a3P56564 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc1a3P56564 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc1a3P56564 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc1a3P56564 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc1a3P56564 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc1a3P56564 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc1a3P56564 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc1a3P56564 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc1a3P56564 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc1a3P56564 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Slc1a3P56564 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Slc1a3P56564 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Slc1a3P56564 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc1a3P56564 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc1a3P56564 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc1a3P56564 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc1a3P56564 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc1a3P56564 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc1a3P56564 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc1a3P56564 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc1a3P56564 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc1a3P56564 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc1a3P56564 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc1a3P56564 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc1a3P56564 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc1a3P56564 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc1a3P56564 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc1a3P56564 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc1a3P56564 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc1a3P56564 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc1a3P56564 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc1a3P56564 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc1a3P56564 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc1a3P56564 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc1a3P56564 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms