Protein–RNA interactions for Protein: P40645

Sox6, Transcription factor SOX-6, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox6P40645 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox6P40645 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox6P40645 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox6P40645 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox6P40645 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox6P40645 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox6P40645 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox6P40645 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox6P40645 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox6P40645 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sox6P40645 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sox6P40645 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sox6P40645 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sox6P40645 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sox6P40645 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sox6P40645 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sox6P40645 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sox6P40645 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sox6P40645 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sox6P40645 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sox6P40645 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox6P40645 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox6P40645 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox6P40645 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox6P40645 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox6P40645 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox6P40645 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox6P40645 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sox6P40645 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sox6P40645 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sox6P40645 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sox6P40645 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sox6P40645 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sox6P40645 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox6P40645 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox6P40645 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sox6P40645 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sox6P40645 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sox6P40645 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sox6P40645 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sox6P40645 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sox6P40645 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sox6P40645 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox6P40645 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox6P40645 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox6P40645 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox6P40645 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox6P40645 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox6P40645 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox6P40645 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox6P40645 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox6P40645 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox6P40645 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sox6P40645 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sox6P40645 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox6P40645 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox6P40645 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sox6P40645 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sox6P40645 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox6P40645 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox6P40645 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox6P40645 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox6P40645 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox6P40645 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox6P40645 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox6P40645 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox6P40645 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox6P40645 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox6P40645 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox6P40645 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox6P40645 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox6P40645 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox6P40645 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox6P40645 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox6P40645 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox6P40645 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sox6P40645 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox6P40645 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox6P40645 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox6P40645 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox6P40645 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox6P40645 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox6P40645 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox6P40645 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox6P40645 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox6P40645 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sox6P40645 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Sox6P40645 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sox6P40645 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sox6P40645 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Sox6P40645 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox6P40645 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox6P40645 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox6P40645 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox6P40645 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox6P40645 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sox6P40645 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Sox6P40645 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sox6P40645 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sox6P40645 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92 ms