Protein–RNA interactions for Protein: P40018

SMB1, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SMB1P40018 GGA2YHR108W 1758 nt7.43□□□□□ -1.22
SMB1P40018 CTI6YPL181W 1521 nt7.43□□□□□ -1.22
SMB1P40018 YIL177CYIL177C 5277 nt7.43□□□□□ -1.22
SMB1P40018 EMC3YKL207W 762 nt7.43□□□□□ -1.22
SMB1P40018 THI6YPL214C 1623 nt7.42□□□□□ -1.22
SMB1P40018 SBP1YHL034C 885 nt7.42□□□□□ -1.22
SMB1P40018 HBS1YKR084C 1836 nt7.41□□□□□ -1.22
SMB1P40018 YKL053WYKL053W 375 nt7.41□□□□□ -1.22
SMB1P40018 MRS4YKR052C 915 nt7.4□□□□□ -1.22
SMB1P40018 ORT1YOR130C 879 nt7.4□□□□□ -1.22
SMB1P40018 THI3YDL080C 1830 nt7.38□□□□□ -1.23
SMB1P40018 HXT11YOL156W 1704 nt7.38□□□□□ -1.23
SMB1P40018 TAF13YML098W 504 nt7.37□□□□□ -1.23
SMB1P40018 TPC1YGR096W 945 nt7.36□□□□□ -1.23
SMB1P40018 MHF1YOL086W-A 273 nt7.36□□□□□ -1.23
SMB1P40018 LEU2YCL018W 1095 nt7.36□□□□□ -1.23
SMB1P40018 YJL195CYJL195C 702 nt7.35□□□□□ -1.23
SMB1P40018 NSG2YNL156C 900 nt7.35□□□□□ -1.23
SMB1P40018 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt7.34□□□□□ -1.23
SMB1P40018 SRP54YPR088C 1626 nt7.34□□□□□ -1.24
SMB1P40018 SAN1YDR143C 1833 nt7.34□□□□□ -1.24
SMB1P40018 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.33□□□□□ -1.24
SMB1P40018 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.33□□□□□ -1.24
SMB1P40018 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.33□□□□□ -1.24
SMB1P40018 ESS1YJR017C 513 nt7.33□□□□□ -1.24
SMB1P40018 LPD1YFL018C 1500 nt7.32□□□□□ -1.24
SMB1P40018 snR4snR4 186 nt7.32□□□□□ -1.24
SMB1P40018 YMR210WYMR210W 1350 nt7.32□□□□□ -1.24
SMB1P40018 NAM8YHR086W 1572 nt7.31□□□□□ -1.24
SMB1P40018 POT1YIL160C 1254 nt7.31□□□□□ -1.24
SMB1P40018 GAS1YMR307W 1680 nt7.31□□□□□ -1.24
SMB1P40018 DUR3YHL016C 2208 nt7.31□□□□□ -1.24
SMB1P40018 SRM1YGL097W 1449 nt7.3□□□□□ -1.24
SMB1P40018 KRE1YNL322C 942 nt7.3□□□□□ -1.24
SMB1P40018 YLR173WYLR173W 1827 nt7.29□□□□□ -1.24
SMB1P40018 YJL009WYJL009W 327 nt7.29□□□□□ -1.24
SMB1P40018 PTC6YCR079W 1329 nt7.28□□□□□ -1.24
SMB1P40018 snR86snR86 1004 nt7.28□□□□□ -1.24
SMB1P40018 AAC3YBR085W 924 nt7.28□□□□□ -1.24
SMB1P40018 REX2YLR059C 810 nt7.27□□□□□ -1.25
SMB1P40018 YDR306CYDR306C 1437 nt7.27□□□□□ -1.25
SMB1P40018 YEL008WYEL008W 381 nt7.26□□□□□ -1.25
SMB1P40018 YPT11YNL304W 1254 nt7.26□□□□□ -1.25
SMB1P40018 GNP1YDR508C 1992 nt7.26□□□□□ -1.25
SMB1P40018 RTG2YGL252C 1767 nt7.25□□□□□ -1.25
SMB1P40018 ADE16YLR028C 1776 nt7.25□□□□□ -1.25
SMB1P40018 FTH1YBR207W 1398 nt7.25□□□□□ -1.25
SMB1P40018 SPE2YOL052C 1191 nt7.25□□□□□ -1.25
SMB1P40018 TMS1YDR105C 1422 nt7.25□□□□□ -1.25
SMB1P40018 UFD1YGR048W 1086 nt7.24□□□□□ -1.25
SMB1P40018 FUN14YAL008W 597 nt7.24□□□□□ -1.25
SMB1P40018 LEA1YPL213W 717 nt7.24□□□□□ -1.25
SMB1P40018 YLR072WYLR072W 2082 nt7.23□□□□□ -1.25
SMB1P40018 POP2YNR052C 1302 nt7.22□□□□□ -1.25
SMB1P40018 DIA4YHR011W 1341 nt7.21□□□□□ -1.26
SMB1P40018 DUS3YLR401C 2007 nt7.2□□□□□ -1.26
SMB1P40018 PUS7YOR243C 2031 nt7.2□□□□□ -1.26
SMB1P40018 GSF2YML048W 1212 nt7.2□□□□□ -1.26
SMB1P40018 HIS3YOR202W 663 nt7.2□□□□□ -1.26
SMB1P40018 FIT1YDR534C 1587 nt7.2□□□□□ -1.26
SMB1P40018 GCD11YER025W 1584 nt7.2□□□□□ -1.26
SMB1P40018 RSM7YJR113C 744 nt7.19□□□□□ -1.26
SMB1P40018 PAR32YDL173W 888 nt7.18□□□□□ -1.26
SMB1P40018 YJR149WYJR149W 1215 nt7.18□□□□□ -1.26
SMB1P40018 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.18□□□□□ -1.26
SMB1P40018 YIR035CYIR035C 765 nt7.17□□□□□ -1.26
SMB1P40018 YKR012CYKR012C 378 nt7.17□□□□□ -1.26
SMB1P40018 LYS20YDL182W 1287 nt7.16□□□□□ -1.26
SMB1P40018 BUB2YMR055C 921 nt7.16□□□□□ -1.26
SMB1P40018 FSH2YMR222C 672 nt7.16□□□□□ -1.26
SMB1P40018 TUB4YLR212C 1422 nt7.16□□□□□ -1.26
SMB1P40018 ABP1YCR088W 1779 nt7.15□□□□□ -1.27
SMB1P40018 NDE2YDL085W 1638 nt7.14□□□□□ -1.27
SMB1P40018 THP3YPR045C 1413 nt7.14□□□□□ -1.27
SMB1P40018 ECM10YEL030W 1935 nt7.13□□□□□ -1.27
SMB1P40018 MEP1YGR121C 1479 nt7.13□□□□□ -1.27
SMB1P40018 PFS2YNL317W 1398 nt7.13□□□□□ -1.27
SMB1P40018 NIF3YGL221C 867 nt7.13□□□□□ -1.27
SMB1P40018 YNL140CYNL140C 570 nt7.13□□□□□ -1.27
SMB1P40018 INO1YJL153C 1602 nt7.12□□□□□ -1.27
SMB1P40018 YBR056WYBR056W 1506 nt7.12□□□□□ -1.27
SMB1P40018 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.12□□□□□ -1.27
SMB1P40018 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.12□□□□□ -1.27
SMB1P40018 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.12□□□□□ -1.27
SMB1P40018 TIF3YPR163C 1311 nt7.12□□□□□ -1.27
SMB1P40018 APS2YJR058C 444 nt7.12□□□□□ -1.27
SMB1P40018 MDH2YOL126C 1134 nt7.12□□□□□ -1.27
SMB1P40018 HSV2YGR223C 1347 nt7.11□□□□□ -1.27
SMB1P40018 MET30YIL046W 1923 nt7.09□□□□□ -1.27
SMB1P40018 SDS24YBR214W 1584 nt7.09□□□□□ -1.27
SMB1P40018 BUD31YCR063W 474 nt7.08□□□□□ -1.28
SMB1P40018 INM1YHR046C 888 nt7.08□□□□□ -1.28
SMB1P40018 YLR460CYLR460C 1131 nt7.08□□□□□ -1.28
SMB1P40018 ENO1YGR254W 1314 nt7.07□□□□□ -1.28
SMB1P40018 CPD1YGR247W 720 nt7.07□□□□□ -1.28
SMB1P40018 NAS2YIL007C 663 nt7.07□□□□□ -1.28
SMB1P40018 YNL190WYNL190W 615 nt7.07□□□□□ -1.28
SMB1P40018 VBA3YCL069W 1377 nt7.07□□□□□ -1.28
SMB1P40018 TGL5YOR081C 2250 nt7.06□□□□□ -1.28
SMB1P40018 SLM3YDL033C 1254 nt7.06□□□□□ -1.28
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