Protein–RNA interactions for Protein: P35279

Rab6a, Ras-related protein Rab-6A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab6aP35279 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rab6aP35279 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rab6aP35279 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rab6aP35279 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab6aP35279 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab6aP35279 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab6aP35279 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab6aP35279 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab6aP35279 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab6aP35279 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab6aP35279 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab6aP35279 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab6aP35279 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab6aP35279 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab6aP35279 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab6aP35279 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab6aP35279 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab6aP35279 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab6aP35279 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab6aP35279 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab6aP35279 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab6aP35279 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab6aP35279 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab6aP35279 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab6aP35279 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab6aP35279 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Rab6aP35279 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab6aP35279 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab6aP35279 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab6aP35279 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab6aP35279 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab6aP35279 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab6aP35279 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab6aP35279 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab6aP35279 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab6aP35279 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab6aP35279 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab6aP35279 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab6aP35279 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab6aP35279 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab6aP35279 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab6aP35279 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rab6aP35279 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rab6aP35279 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rab6aP35279 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rab6aP35279 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rab6aP35279 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab6aP35279 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab6aP35279 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab6aP35279 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rab6aP35279 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rab6aP35279 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rab6aP35279 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rab6aP35279 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rab6aP35279 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rab6aP35279 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rab6aP35279 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rab6aP35279 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rab6aP35279 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rab6aP35279 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rab6aP35279 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rab6aP35279 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab6aP35279 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab6aP35279 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab6aP35279 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab6aP35279 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab6aP35279 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab6aP35279 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab6aP35279 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab6aP35279 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab6aP35279 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab6aP35279 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab6aP35279 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab6aP35279 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab6aP35279 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab6aP35279 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab6aP35279 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rab6aP35279 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rab6aP35279 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rab6aP35279 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rab6aP35279 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rab6aP35279 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rab6aP35279 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rab6aP35279 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab6aP35279 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab6aP35279 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab6aP35279 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab6aP35279 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab6aP35279 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab6aP35279 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab6aP35279 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab6aP35279 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab6aP35279 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab6aP35279 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab6aP35279 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab6aP35279 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab6aP35279 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab6aP35279 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab6aP35279 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab6aP35279 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms