Protein–RNA interactions for Protein: P31311

Hoxa11, Homeobox protein Hox-A11, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa11P31311 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hoxa11P31311 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Hoxa11P31311 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Hoxa11P31311 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Hoxa11P31311 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hoxa11P31311 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Hoxa11P31311 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hoxa11P31311 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Hoxa11P31311 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hoxa11P31311 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hoxa11P31311 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hoxa11P31311 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hoxa11P31311 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hoxa11P31311 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Hoxa11P31311 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hoxa11P31311 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hoxa11P31311 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Hoxa11P31311 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hoxa11P31311 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hoxa11P31311 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Hoxa11P31311 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Hoxa11P31311 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Hoxa11P31311 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hoxa11P31311 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hoxa11P31311 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hoxa11P31311 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hoxa11P31311 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Hoxa11P31311 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hoxa11P31311 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Hoxa11P31311 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Hoxa11P31311 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Hoxa11P31311 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Hoxa11P31311 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Hoxa11P31311 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hoxa11P31311 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hoxa11P31311 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hoxa11P31311 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Hoxa11P31311 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Hoxa11P31311 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hoxa11P31311 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hoxa11P31311 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Hoxa11P31311 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Hoxa11P31311 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Hoxa11P31311 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Hoxa11P31311 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Hoxa11P31311 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Hoxa11P31311 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Hoxa11P31311 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Hoxa11P31311 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Hoxa11P31311 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Hoxa11P31311 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hoxa11P31311 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Hoxa11P31311 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Hoxa11P31311 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Hoxa11P31311 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Hoxa11P31311 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Hoxa11P31311 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Hoxa11P31311 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Hoxa11P31311 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hoxa11P31311 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hoxa11P31311 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hoxa11P31311 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hoxa11P31311 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hoxa11P31311 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hoxa11P31311 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hoxa11P31311 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Hoxa11P31311 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Hoxa11P31311 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hoxa11P31311 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hoxa11P31311 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hoxa11P31311 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hoxa11P31311 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hoxa11P31311 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hoxa11P31311 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hoxa11P31311 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hoxa11P31311 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hoxa11P31311 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hoxa11P31311 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hoxa11P31311 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Hoxa11P31311 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Hoxa11P31311 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hoxa11P31311 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Hoxa11P31311 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Hoxa11P31311 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hoxa11P31311 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hoxa11P31311 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hoxa11P31311 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hoxa11P31311 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hoxa11P31311 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hoxa11P31311 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hoxa11P31311 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hoxa11P31311 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hoxa11P31311 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hoxa11P31311 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hoxa11P31311 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hoxa11P31311 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Hoxa11P31311 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Hoxa11P31311 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hoxa11P31311 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hoxa11P31311 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms