Protein–RNA interactions for Protein: P31311

Hoxa11, Homeobox protein Hox-A11, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa11P31311 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC43.65■■■■■ 4.58
Hoxa11P31311 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
Hoxa11P31311 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Hoxa11P31311 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
Hoxa11P31311 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Hoxa11P31311 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
Hoxa11P31311 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
Hoxa11P31311 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Hoxa11P31311 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Hoxa11P31311 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Hoxa11P31311 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Hoxa11P31311 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Hoxa11P31311 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
Hoxa11P31311 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Hoxa11P31311 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Hoxa11P31311 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Hoxa11P31311 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
Hoxa11P31311 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Hoxa11P31311 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Hoxa11P31311 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Hoxa11P31311 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
Hoxa11P31311 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Hoxa11P31311 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
Hoxa11P31311 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Hoxa11P31311 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Hoxa11P31311 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Hoxa11P31311 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Hoxa11P31311 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Hoxa11P31311 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
Hoxa11P31311 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Hoxa11P31311 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Hoxa11P31311 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Hoxa11P31311 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Hoxa11P31311 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Hoxa11P31311 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
Hoxa11P31311 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Hoxa11P31311 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Hoxa11P31311 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Hoxa11P31311 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Hoxa11P31311 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Hoxa11P31311 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Hoxa11P31311 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Hoxa11P31311 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Hoxa11P31311 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Hoxa11P31311 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Hoxa11P31311 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Hoxa11P31311 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Hoxa11P31311 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Hoxa11P31311 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Hoxa11P31311 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Hoxa11P31311 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Hoxa11P31311 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Hoxa11P31311 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Hoxa11P31311 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Hoxa11P31311 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Hoxa11P31311 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Hoxa11P31311 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Hoxa11P31311 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Hoxa11P31311 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Hoxa11P31311 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Hoxa11P31311 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Hoxa11P31311 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Hoxa11P31311 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Hoxa11P31311 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
Hoxa11P31311 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Hoxa11P31311 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Hoxa11P31311 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Hoxa11P31311 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Hoxa11P31311 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
Hoxa11P31311 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Hoxa11P31311 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Hoxa11P31311 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Hoxa11P31311 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Hoxa11P31311 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Hoxa11P31311 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Hoxa11P31311 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Hoxa11P31311 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Hoxa11P31311 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Hoxa11P31311 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Hoxa11P31311 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Hoxa11P31311 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Hoxa11P31311 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Hoxa11P31311 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Hoxa11P31311 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
Hoxa11P31311 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
Hoxa11P31311 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Hoxa11P31311 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Hoxa11P31311 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Hoxa11P31311 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Hoxa11P31311 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Hoxa11P31311 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Hoxa11P31311 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Hoxa11P31311 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Hoxa11P31311 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Hoxa11P31311 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Hoxa11P31311 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Hoxa11P31311 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Hoxa11P31311 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Hoxa11P31311 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Hoxa11P31311 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms