Protein–RNA interactions for Protein: P16675

Ctsa, Lysosomal protective protein, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsaP16675 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CtsaP16675 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CtsaP16675 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CtsaP16675 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CtsaP16675 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CtsaP16675 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CtsaP16675 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CtsaP16675 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtsaP16675 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtsaP16675 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CtsaP16675 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CtsaP16675 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CtsaP16675 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CtsaP16675 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtsaP16675 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtsaP16675 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtsaP16675 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtsaP16675 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtsaP16675 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CtsaP16675 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CtsaP16675 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CtsaP16675 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CtsaP16675 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CtsaP16675 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CtsaP16675 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CtsaP16675 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CtsaP16675 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CtsaP16675 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CtsaP16675 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CtsaP16675 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CtsaP16675 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtsaP16675 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CtsaP16675 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CtsaP16675 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CtsaP16675 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CtsaP16675 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CtsaP16675 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CtsaP16675 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CtsaP16675 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CtsaP16675 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CtsaP16675 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CtsaP16675 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CtsaP16675 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CtsaP16675 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CtsaP16675 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CtsaP16675 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CtsaP16675 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CtsaP16675 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CtsaP16675 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CtsaP16675 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CtsaP16675 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CtsaP16675 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CtsaP16675 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CtsaP16675 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CtsaP16675 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CtsaP16675 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CtsaP16675 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CtsaP16675 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CtsaP16675 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CtsaP16675 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CtsaP16675 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CtsaP16675 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CtsaP16675 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CtsaP16675 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CtsaP16675 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CtsaP16675 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CtsaP16675 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CtsaP16675 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CtsaP16675 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CtsaP16675 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CtsaP16675 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CtsaP16675 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CtsaP16675 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CtsaP16675 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CtsaP16675 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CtsaP16675 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CtsaP16675 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CtsaP16675 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CtsaP16675 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CtsaP16675 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CtsaP16675 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CtsaP16675 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CtsaP16675 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CtsaP16675 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CtsaP16675 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CtsaP16675 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CtsaP16675 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CtsaP16675 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CtsaP16675 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CtsaP16675 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CtsaP16675 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CtsaP16675 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CtsaP16675 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CtsaP16675 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CtsaP16675 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CtsaP16675 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CtsaP16675 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CtsaP16675 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CtsaP16675 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CtsaP16675 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms