Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RhoP15409 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RhoP15409 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RhoP15409 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RhoP15409 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RhoP15409 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RhoP15409 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RhoP15409 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RhoP15409 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RhoP15409 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RhoP15409 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RhoP15409 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RhoP15409 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RhoP15409 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RhoP15409 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RhoP15409 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RhoP15409 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RhoP15409 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RhoP15409 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RhoP15409 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RhoP15409 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RhoP15409 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RhoP15409 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RhoP15409 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RhoP15409 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RhoP15409 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RhoP15409 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RhoP15409 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RhoP15409 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RhoP15409 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RhoP15409 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RhoP15409 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RhoP15409 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RhoP15409 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RhoP15409 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RhoP15409 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RhoP15409 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RhoP15409 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RhoP15409 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RhoP15409 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RhoP15409 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RhoP15409 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RhoP15409 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RhoP15409 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RhoP15409 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RhoP15409 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RhoP15409 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RhoP15409 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RhoP15409 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RhoP15409 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RhoP15409 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RhoP15409 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RhoP15409 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RhoP15409 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RhoP15409 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RhoP15409 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RhoP15409 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RhoP15409 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RhoP15409 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RhoP15409 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RhoP15409 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RhoP15409 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RhoP15409 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RhoP15409 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RhoP15409 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RhoP15409 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RhoP15409 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RhoP15409 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RhoP15409 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RhoP15409 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RhoP15409 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RhoP15409 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RhoP15409 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RhoP15409 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RhoP15409 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RhoP15409 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RhoP15409 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RhoP15409 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RhoP15409 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RhoP15409 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RhoP15409 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RhoP15409 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RhoP15409 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RhoP15409 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RhoP15409 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RhoP15409 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RhoP15409 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RhoP15409 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RhoP15409 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RhoP15409 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RhoP15409 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RhoP15409 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RhoP15409 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RhoP15409 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RhoP15409 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RhoP15409 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RhoP15409 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RhoP15409 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RhoP15409 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RhoP15409 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms