Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TnfP06804 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TnfP06804 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TnfP06804 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TnfP06804 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TnfP06804 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TnfP06804 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TnfP06804 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TnfP06804 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TnfP06804 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TnfP06804 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TnfP06804 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TnfP06804 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TnfP06804 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TnfP06804 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TnfP06804 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TnfP06804 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TnfP06804 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TnfP06804 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TnfP06804 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TnfP06804 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TnfP06804 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TnfP06804 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TnfP06804 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TnfP06804 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TnfP06804 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TnfP06804 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TnfP06804 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TnfP06804 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TnfP06804 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TnfP06804 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TnfP06804 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TnfP06804 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TnfP06804 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TnfP06804 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TnfP06804 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TnfP06804 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TnfP06804 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TnfP06804 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TnfP06804 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TnfP06804 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TnfP06804 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TnfP06804 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TnfP06804 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TnfP06804 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TnfP06804 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TnfP06804 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TnfP06804 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TnfP06804 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TnfP06804 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TnfP06804 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TnfP06804 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TnfP06804 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TnfP06804 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TnfP06804 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TnfP06804 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TnfP06804 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TnfP06804 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TnfP06804 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TnfP06804 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TnfP06804 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TnfP06804 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TnfP06804 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TnfP06804 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TnfP06804 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TnfP06804 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TnfP06804 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TnfP06804 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TnfP06804 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TnfP06804 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TnfP06804 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TnfP06804 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TnfP06804 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TnfP06804 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TnfP06804 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TnfP06804 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TnfP06804 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TnfP06804 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TnfP06804 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TnfP06804 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TnfP06804 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TnfP06804 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TnfP06804 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TnfP06804 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TnfP06804 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TnfP06804 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TnfP06804 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TnfP06804 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TnfP06804 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TnfP06804 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TnfP06804 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TnfP06804 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TnfP06804 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TnfP06804 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TnfP06804 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TnfP06804 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TnfP06804 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TnfP06804 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TnfP06804 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TnfP06804 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms