Protein–RNA interactions for Protein: P06339

H2-T23, H-2 class I histocompatibility antigen, D-37 alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-T23P06339 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
H2-T23P06339 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
H2-T23P06339 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2-T23P06339 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2-T23P06339 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2-T23P06339 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2-T23P06339 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2-T23P06339 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
H2-T23P06339 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2-T23P06339 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
H2-T23P06339 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
H2-T23P06339 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
H2-T23P06339 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
H2-T23P06339 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
H2-T23P06339 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
H2-T23P06339 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
H2-T23P06339 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H2-T23P06339 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H2-T23P06339 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2-T23P06339 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2-T23P06339 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2-T23P06339 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2-T23P06339 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2-T23P06339 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2-T23P06339 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2-T23P06339 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2-T23P06339 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2-T23P06339 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
H2-T23P06339 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2-T23P06339 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2-T23P06339 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
H2-T23P06339 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2-T23P06339 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2-T23P06339 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2-T23P06339 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2-T23P06339 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
H2-T23P06339 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-T23P06339 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-T23P06339 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2-T23P06339 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2-T23P06339 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2-T23P06339 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2-T23P06339 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2-T23P06339 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2-T23P06339 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2-T23P06339 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2-T23P06339 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2-T23P06339 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2-T23P06339 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2-T23P06339 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2-T23P06339 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2-T23P06339 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2-T23P06339 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2-T23P06339 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2-T23P06339 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2-T23P06339 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2-T23P06339 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
H2-T23P06339 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2-T23P06339 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2-T23P06339 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2-T23P06339 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2-T23P06339 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2-T23P06339 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2-T23P06339 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
H2-T23P06339 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2-T23P06339 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
H2-T23P06339 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2-T23P06339 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2-T23P06339 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2-T23P06339 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2-T23P06339 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2-T23P06339 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2-T23P06339 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2-T23P06339 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2-T23P06339 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2-T23P06339 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2-T23P06339 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2-T23P06339 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2-T23P06339 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H2-T23P06339 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H2-T23P06339 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2-T23P06339 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H2-T23P06339 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
H2-T23P06339 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
H2-T23P06339 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
H2-T23P06339 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2-T23P06339 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2-T23P06339 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2-T23P06339 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2-T23P06339 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2-T23P06339 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2-T23P06339 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2-T23P06339 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2-T23P06339 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2-T23P06339 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2-T23P06339 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H2-T23P06339 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2-T23P06339 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2-T23P06339 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2-T23P06339 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms