Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX0

5730507C01Rik, RIKEN cDNA 5730507C01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730507C01RikJ3QPX0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
5730507C01RikJ3QPX0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
5730507C01RikJ3QPX0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
5730507C01RikJ3QPX0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
5730507C01RikJ3QPX0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
5730507C01RikJ3QPX0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
5730507C01RikJ3QPX0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
5730507C01RikJ3QPX0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
5730507C01RikJ3QPX0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
5730507C01RikJ3QPX0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
5730507C01RikJ3QPX0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
5730507C01RikJ3QPX0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
5730507C01RikJ3QPX0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
5730507C01RikJ3QPX0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
5730507C01RikJ3QPX0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
5730507C01RikJ3QPX0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
5730507C01RikJ3QPX0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
5730507C01RikJ3QPX0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
5730507C01RikJ3QPX0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
5730507C01RikJ3QPX0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
5730507C01RikJ3QPX0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
5730507C01RikJ3QPX0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
5730507C01RikJ3QPX0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
5730507C01RikJ3QPX0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
5730507C01RikJ3QPX0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
5730507C01RikJ3QPX0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
5730507C01RikJ3QPX0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
5730507C01RikJ3QPX0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
5730507C01RikJ3QPX0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
5730507C01RikJ3QPX0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
5730507C01RikJ3QPX0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
5730507C01RikJ3QPX0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
5730507C01RikJ3QPX0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
5730507C01RikJ3QPX0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
5730507C01RikJ3QPX0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
5730507C01RikJ3QPX0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
5730507C01RikJ3QPX0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
5730507C01RikJ3QPX0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
5730507C01RikJ3QPX0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
5730507C01RikJ3QPX0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
5730507C01RikJ3QPX0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
5730507C01RikJ3QPX0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
5730507C01RikJ3QPX0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
5730507C01RikJ3QPX0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
5730507C01RikJ3QPX0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
5730507C01RikJ3QPX0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
5730507C01RikJ3QPX0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
5730507C01RikJ3QPX0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
5730507C01RikJ3QPX0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
5730507C01RikJ3QPX0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
5730507C01RikJ3QPX0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
5730507C01RikJ3QPX0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
5730507C01RikJ3QPX0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
5730507C01RikJ3QPX0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
5730507C01RikJ3QPX0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
5730507C01RikJ3QPX0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
5730507C01RikJ3QPX0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
5730507C01RikJ3QPX0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
5730507C01RikJ3QPX0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
5730507C01RikJ3QPX0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
5730507C01RikJ3QPX0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
5730507C01RikJ3QPX0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
5730507C01RikJ3QPX0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
5730507C01RikJ3QPX0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
5730507C01RikJ3QPX0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
5730507C01RikJ3QPX0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
5730507C01RikJ3QPX0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
5730507C01RikJ3QPX0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
5730507C01RikJ3QPX0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
5730507C01RikJ3QPX0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
5730507C01RikJ3QPX0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
5730507C01RikJ3QPX0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
5730507C01RikJ3QPX0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
5730507C01RikJ3QPX0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
5730507C01RikJ3QPX0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
5730507C01RikJ3QPX0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
5730507C01RikJ3QPX0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
5730507C01RikJ3QPX0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
5730507C01RikJ3QPX0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
5730507C01RikJ3QPX0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
5730507C01RikJ3QPX0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
5730507C01RikJ3QPX0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
5730507C01RikJ3QPX0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
5730507C01RikJ3QPX0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
5730507C01RikJ3QPX0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
5730507C01RikJ3QPX0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
5730507C01RikJ3QPX0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
5730507C01RikJ3QPX0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
5730507C01RikJ3QPX0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
5730507C01RikJ3QPX0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
5730507C01RikJ3QPX0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
5730507C01RikJ3QPX0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
5730507C01RikJ3QPX0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
5730507C01RikJ3QPX0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
5730507C01RikJ3QPX0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
5730507C01RikJ3QPX0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
5730507C01RikJ3QPX0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
5730507C01RikJ3QPX0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
5730507C01RikJ3QPX0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
5730507C01RikJ3QPX0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.7 ms