Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Lmod3E9QA62 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lmod3E9QA62 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lmod3E9QA62 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lmod3E9QA62 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lmod3E9QA62 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lmod3E9QA62 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lmod3E9QA62 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lmod3E9QA62 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lmod3E9QA62 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lmod3E9QA62 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lmod3E9QA62 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lmod3E9QA62 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lmod3E9QA62 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lmod3E9QA62 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lmod3E9QA62 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lmod3E9QA62 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lmod3E9QA62 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lmod3E9QA62 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lmod3E9QA62 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lmod3E9QA62 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lmod3E9QA62 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Lmod3E9QA62 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lmod3E9QA62 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lmod3E9QA62 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lmod3E9QA62 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lmod3E9QA62 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lmod3E9QA62 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lmod3E9QA62 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lmod3E9QA62 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lmod3E9QA62 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Lmod3E9QA62 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lmod3E9QA62 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lmod3E9QA62 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lmod3E9QA62 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lmod3E9QA62 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lmod3E9QA62 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lmod3E9QA62 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lmod3E9QA62 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lmod3E9QA62 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Lmod3E9QA62 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lmod3E9QA62 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lmod3E9QA62 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lmod3E9QA62 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lmod3E9QA62 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Lmod3E9QA62 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Lmod3E9QA62 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Lmod3E9QA62 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Lmod3E9QA62 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Lmod3E9QA62 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Lmod3E9QA62 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Lmod3E9QA62 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Lmod3E9QA62 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lmod3E9QA62 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lmod3E9QA62 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lmod3E9QA62 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lmod3E9QA62 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lmod3E9QA62 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lmod3E9QA62 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Lmod3E9QA62 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Lmod3E9QA62 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Lmod3E9QA62 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lmod3E9QA62 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lmod3E9QA62 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lmod3E9QA62 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lmod3E9QA62 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lmod3E9QA62 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lmod3E9QA62 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lmod3E9QA62 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lmod3E9QA62 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lmod3E9QA62 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Lmod3E9QA62 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lmod3E9QA62 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lmod3E9QA62 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Lmod3E9QA62 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lmod3E9QA62 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lmod3E9QA62 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lmod3E9QA62 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lmod3E9QA62 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Lmod3E9QA62 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lmod3E9QA62 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lmod3E9QA62 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lmod3E9QA62 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lmod3E9QA62 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lmod3E9QA62 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lmod3E9QA62 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lmod3E9QA62 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lmod3E9QA62 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Lmod3E9QA62 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Lmod3E9QA62 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lmod3E9QA62 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Lmod3E9QA62 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lmod3E9QA62 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lmod3E9QA62 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lmod3E9QA62 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lmod3E9QA62 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lmod3E9QA62 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lmod3E9QA62 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lmod3E9QA62 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Lmod3E9QA62 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms