Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trip11E9Q512 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trip11E9Q512 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trip11E9Q512 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trip11E9Q512 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trip11E9Q512 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trip11E9Q512 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trip11E9Q512 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trip11E9Q512 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Trip11E9Q512 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trip11E9Q512 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trip11E9Q512 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trip11E9Q512 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trip11E9Q512 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trip11E9Q512 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trip11E9Q512 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trip11E9Q512 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trip11E9Q512 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trip11E9Q512 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trip11E9Q512 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Trip11E9Q512 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trip11E9Q512 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trip11E9Q512 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trip11E9Q512 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trip11E9Q512 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trip11E9Q512 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trip11E9Q512 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trip11E9Q512 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trip11E9Q512 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trip11E9Q512 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trip11E9Q512 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trip11E9Q512 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trip11E9Q512 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Trip11E9Q512 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Trip11E9Q512 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trip11E9Q512 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Trip11E9Q512 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trip11E9Q512 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trip11E9Q512 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trip11E9Q512 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trip11E9Q512 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Trip11E9Q512 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trip11E9Q512 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Trip11E9Q512 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trip11E9Q512 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trip11E9Q512 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Trip11E9Q512 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trip11E9Q512 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trip11E9Q512 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trip11E9Q512 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trip11E9Q512 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trip11E9Q512 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trip11E9Q512 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trip11E9Q512 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Trip11E9Q512 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Trip11E9Q512 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trip11E9Q512 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Trip11E9Q512 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Trip11E9Q512 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trip11E9Q512 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trip11E9Q512 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Trip11E9Q512 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trip11E9Q512 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trip11E9Q512 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trip11E9Q512 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trip11E9Q512 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trip11E9Q512 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trip11E9Q512 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trip11E9Q512 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trip11E9Q512 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trip11E9Q512 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trip11E9Q512 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trip11E9Q512 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trip11E9Q512 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trip11E9Q512 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trip11E9Q512 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trip11E9Q512 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trip11E9Q512 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trip11E9Q512 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trip11E9Q512 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trip11E9Q512 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trip11E9Q512 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trip11E9Q512 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trip11E9Q512 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trip11E9Q512 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trip11E9Q512 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trip11E9Q512 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trip11E9Q512 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trip11E9Q512 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trip11E9Q512 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trip11E9Q512 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trip11E9Q512 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Trip11E9Q512 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trip11E9Q512 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trip11E9Q512 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trip11E9Q512 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trip11E9Q512 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trip11E9Q512 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trip11E9Q512 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trip11E9Q512 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms