Protein–RNA interactions for Protein: E9PUD6

Zscan18, Zinc finger and SCAN domain-containing 18, mousemouse

Predictions only

Length 809 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan18E9PUD6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zscan18E9PUD6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zscan18E9PUD6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Zscan18E9PUD6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Zscan18E9PUD6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Zscan18E9PUD6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Zscan18E9PUD6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Zscan18E9PUD6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Zscan18E9PUD6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Zscan18E9PUD6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Zscan18E9PUD6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Zscan18E9PUD6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Zscan18E9PUD6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Zscan18E9PUD6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Zscan18E9PUD6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Zscan18E9PUD6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Zscan18E9PUD6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Zscan18E9PUD6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Zscan18E9PUD6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Zscan18E9PUD6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Zscan18E9PUD6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Zscan18E9PUD6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Zscan18E9PUD6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Zscan18E9PUD6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Zscan18E9PUD6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Zscan18E9PUD6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Zscan18E9PUD6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Zscan18E9PUD6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Zscan18E9PUD6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Zscan18E9PUD6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Zscan18E9PUD6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Zscan18E9PUD6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Zscan18E9PUD6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Zscan18E9PUD6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zscan18E9PUD6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zscan18E9PUD6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zscan18E9PUD6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Zscan18E9PUD6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Zscan18E9PUD6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Zscan18E9PUD6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Zscan18E9PUD6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Zscan18E9PUD6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Zscan18E9PUD6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Zscan18E9PUD6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Zscan18E9PUD6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Zscan18E9PUD6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Zscan18E9PUD6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Zscan18E9PUD6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Zscan18E9PUD6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Zscan18E9PUD6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Zscan18E9PUD6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Zscan18E9PUD6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Zscan18E9PUD6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Zscan18E9PUD6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Zscan18E9PUD6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Zscan18E9PUD6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Zscan18E9PUD6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Zscan18E9PUD6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Zscan18E9PUD6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Zscan18E9PUD6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Zscan18E9PUD6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Zscan18E9PUD6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Zscan18E9PUD6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Zscan18E9PUD6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Zscan18E9PUD6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Zscan18E9PUD6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Zscan18E9PUD6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Zscan18E9PUD6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Zscan18E9PUD6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Zscan18E9PUD6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Zscan18E9PUD6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Zscan18E9PUD6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Zscan18E9PUD6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Zscan18E9PUD6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Zscan18E9PUD6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Zscan18E9PUD6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Zscan18E9PUD6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Zscan18E9PUD6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Zscan18E9PUD6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Zscan18E9PUD6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Zscan18E9PUD6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Zscan18E9PUD6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Zscan18E9PUD6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Zscan18E9PUD6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Zscan18E9PUD6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Zscan18E9PUD6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Zscan18E9PUD6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Zscan18E9PUD6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Zscan18E9PUD6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Zscan18E9PUD6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Zscan18E9PUD6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Zscan18E9PUD6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Zscan18E9PUD6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Zscan18E9PUD6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Zscan18E9PUD6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Zscan18E9PUD6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Zscan18E9PUD6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Zscan18E9PUD6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Zscan18E9PUD6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Zscan18E9PUD6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms