Protein–RNA interactions for Protein: D3YYY1

Scgb2b7, ABPBG7, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scgb2b7D3YYY1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Scgb2b7D3YYY1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Scgb2b7D3YYY1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Scgb2b7D3YYY1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Scgb2b7D3YYY1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Scgb2b7D3YYY1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scgb2b7D3YYY1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scgb2b7D3YYY1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scgb2b7D3YYY1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scgb2b7D3YYY1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scgb2b7D3YYY1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scgb2b7D3YYY1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scgb2b7D3YYY1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scgb2b7D3YYY1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scgb2b7D3YYY1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scgb2b7D3YYY1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scgb2b7D3YYY1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scgb2b7D3YYY1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scgb2b7D3YYY1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scgb2b7D3YYY1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scgb2b7D3YYY1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scgb2b7D3YYY1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scgb2b7D3YYY1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Scgb2b7D3YYY1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Scgb2b7D3YYY1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Scgb2b7D3YYY1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scgb2b7D3YYY1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scgb2b7D3YYY1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scgb2b7D3YYY1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scgb2b7D3YYY1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scgb2b7D3YYY1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scgb2b7D3YYY1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scgb2b7D3YYY1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scgb2b7D3YYY1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scgb2b7D3YYY1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scgb2b7D3YYY1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scgb2b7D3YYY1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scgb2b7D3YYY1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scgb2b7D3YYY1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scgb2b7D3YYY1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scgb2b7D3YYY1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scgb2b7D3YYY1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scgb2b7D3YYY1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scgb2b7D3YYY1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scgb2b7D3YYY1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scgb2b7D3YYY1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Scgb2b7D3YYY1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scgb2b7D3YYY1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scgb2b7D3YYY1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scgb2b7D3YYY1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scgb2b7D3YYY1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scgb2b7D3YYY1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scgb2b7D3YYY1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scgb2b7D3YYY1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scgb2b7D3YYY1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scgb2b7D3YYY1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scgb2b7D3YYY1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scgb2b7D3YYY1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scgb2b7D3YYY1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scgb2b7D3YYY1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scgb2b7D3YYY1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scgb2b7D3YYY1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scgb2b7D3YYY1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scgb2b7D3YYY1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scgb2b7D3YYY1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scgb2b7D3YYY1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scgb2b7D3YYY1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scgb2b7D3YYY1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scgb2b7D3YYY1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scgb2b7D3YYY1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scgb2b7D3YYY1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scgb2b7D3YYY1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scgb2b7D3YYY1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Scgb2b7D3YYY1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Scgb2b7D3YYY1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Scgb2b7D3YYY1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scgb2b7D3YYY1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scgb2b7D3YYY1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scgb2b7D3YYY1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scgb2b7D3YYY1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scgb2b7D3YYY1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scgb2b7D3YYY1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scgb2b7D3YYY1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scgb2b7D3YYY1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scgb2b7D3YYY1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scgb2b7D3YYY1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scgb2b7D3YYY1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scgb2b7D3YYY1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scgb2b7D3YYY1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scgb2b7D3YYY1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scgb2b7D3YYY1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scgb2b7D3YYY1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scgb2b7D3YYY1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scgb2b7D3YYY1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Scgb2b7D3YYY1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scgb2b7D3YYY1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scgb2b7D3YYY1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scgb2b7D3YYY1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scgb2b7D3YYY1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scgb2b7D3YYY1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms