Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD6

Slfn9, Schlafen 9, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn9B1ARD6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slfn9B1ARD6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slfn9B1ARD6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Slfn9B1ARD6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slfn9B1ARD6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slfn9B1ARD6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slfn9B1ARD6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slfn9B1ARD6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slfn9B1ARD6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slfn9B1ARD6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slfn9B1ARD6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slfn9B1ARD6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slfn9B1ARD6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slfn9B1ARD6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slfn9B1ARD6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slfn9B1ARD6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slfn9B1ARD6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slfn9B1ARD6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slfn9B1ARD6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slfn9B1ARD6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slfn9B1ARD6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slfn9B1ARD6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slfn9B1ARD6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slfn9B1ARD6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slfn9B1ARD6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slfn9B1ARD6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slfn9B1ARD6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slfn9B1ARD6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slfn9B1ARD6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slfn9B1ARD6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slfn9B1ARD6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slfn9B1ARD6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slfn9B1ARD6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Slfn9B1ARD6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Slfn9B1ARD6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slfn9B1ARD6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slfn9B1ARD6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slfn9B1ARD6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slfn9B1ARD6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slfn9B1ARD6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slfn9B1ARD6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slfn9B1ARD6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slfn9B1ARD6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slfn9B1ARD6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Slfn9B1ARD6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slfn9B1ARD6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slfn9B1ARD6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Slfn9B1ARD6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slfn9B1ARD6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slfn9B1ARD6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slfn9B1ARD6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Slfn9B1ARD6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slfn9B1ARD6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slfn9B1ARD6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slfn9B1ARD6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slfn9B1ARD6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slfn9B1ARD6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slfn9B1ARD6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slfn9B1ARD6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slfn9B1ARD6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slfn9B1ARD6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slfn9B1ARD6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slfn9B1ARD6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slfn9B1ARD6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slfn9B1ARD6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slfn9B1ARD6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slfn9B1ARD6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slfn9B1ARD6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slfn9B1ARD6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slfn9B1ARD6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slfn9B1ARD6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slfn9B1ARD6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slfn9B1ARD6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slfn9B1ARD6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slfn9B1ARD6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slfn9B1ARD6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slfn9B1ARD6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slfn9B1ARD6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slfn9B1ARD6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slfn9B1ARD6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slfn9B1ARD6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slfn9B1ARD6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slfn9B1ARD6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slfn9B1ARD6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slfn9B1ARD6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slfn9B1ARD6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slfn9B1ARD6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slfn9B1ARD6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slfn9B1ARD6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slfn9B1ARD6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slfn9B1ARD6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slfn9B1ARD6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slfn9B1ARD6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slfn9B1ARD6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slfn9B1ARD6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slfn9B1ARD6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slfn9B1ARD6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slfn9B1ARD6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slfn9B1ARD6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slfn9B1ARD6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms