Protein–RNA interactions for Protein: B1APN4

Rhox1, Reproductive homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox1B1APN4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rhox1B1APN4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rhox1B1APN4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rhox1B1APN4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rhox1B1APN4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rhox1B1APN4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rhox1B1APN4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rhox1B1APN4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rhox1B1APN4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rhox1B1APN4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rhox1B1APN4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rhox1B1APN4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rhox1B1APN4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rhox1B1APN4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rhox1B1APN4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rhox1B1APN4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rhox1B1APN4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rhox1B1APN4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rhox1B1APN4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rhox1B1APN4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rhox1B1APN4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rhox1B1APN4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rhox1B1APN4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rhox1B1APN4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rhox1B1APN4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rhox1B1APN4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rhox1B1APN4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rhox1B1APN4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rhox1B1APN4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rhox1B1APN4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rhox1B1APN4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rhox1B1APN4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rhox1B1APN4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rhox1B1APN4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rhox1B1APN4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rhox1B1APN4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rhox1B1APN4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rhox1B1APN4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rhox1B1APN4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rhox1B1APN4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rhox1B1APN4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rhox1B1APN4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rhox1B1APN4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rhox1B1APN4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rhox1B1APN4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rhox1B1APN4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rhox1B1APN4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rhox1B1APN4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rhox1B1APN4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rhox1B1APN4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rhox1B1APN4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rhox1B1APN4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rhox1B1APN4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rhox1B1APN4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rhox1B1APN4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rhox1B1APN4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rhox1B1APN4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rhox1B1APN4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rhox1B1APN4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rhox1B1APN4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rhox1B1APN4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rhox1B1APN4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rhox1B1APN4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rhox1B1APN4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rhox1B1APN4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rhox1B1APN4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rhox1B1APN4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rhox1B1APN4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rhox1B1APN4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rhox1B1APN4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rhox1B1APN4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rhox1B1APN4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rhox1B1APN4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rhox1B1APN4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rhox1B1APN4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rhox1B1APN4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rhox1B1APN4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rhox1B1APN4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rhox1B1APN4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rhox1B1APN4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rhox1B1APN4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rhox1B1APN4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rhox1B1APN4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rhox1B1APN4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rhox1B1APN4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rhox1B1APN4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Rhox1B1APN4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rhox1B1APN4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rhox1B1APN4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rhox1B1APN4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rhox1B1APN4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rhox1B1APN4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rhox1B1APN4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rhox1B1APN4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rhox1B1APN4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rhox1B1APN4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rhox1B1APN4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rhox1B1APN4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rhox1B1APN4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rhox1B1APN4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms