Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2JEU3

Trdc, T cell receptor delta, constant region (Fragment), mousemouse

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Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdcA0A0G2JEU3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TrdcA0A0G2JEU3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TrdcA0A0G2JEU3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TrdcA0A0G2JEU3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TrdcA0A0G2JEU3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TrdcA0A0G2JEU3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TrdcA0A0G2JEU3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TrdcA0A0G2JEU3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TrdcA0A0G2JEU3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TrdcA0A0G2JEU3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TrdcA0A0G2JEU3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TrdcA0A0G2JEU3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TrdcA0A0G2JEU3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TrdcA0A0G2JEU3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TrdcA0A0G2JEU3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TrdcA0A0G2JEU3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TrdcA0A0G2JEU3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TrdcA0A0G2JEU3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TrdcA0A0G2JEU3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TrdcA0A0G2JEU3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TrdcA0A0G2JEU3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TrdcA0A0G2JEU3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TrdcA0A0G2JEU3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TrdcA0A0G2JEU3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TrdcA0A0G2JEU3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TrdcA0A0G2JEU3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TrdcA0A0G2JEU3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TrdcA0A0G2JEU3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TrdcA0A0G2JEU3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TrdcA0A0G2JEU3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TrdcA0A0G2JEU3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TrdcA0A0G2JEU3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TrdcA0A0G2JEU3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TrdcA0A0G2JEU3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TrdcA0A0G2JEU3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TrdcA0A0G2JEU3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TrdcA0A0G2JEU3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TrdcA0A0G2JEU3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TrdcA0A0G2JEU3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TrdcA0A0G2JEU3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TrdcA0A0G2JEU3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TrdcA0A0G2JEU3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TrdcA0A0G2JEU3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TrdcA0A0G2JEU3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TrdcA0A0G2JEU3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TrdcA0A0G2JEU3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TrdcA0A0G2JEU3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TrdcA0A0G2JEU3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TrdcA0A0G2JEU3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TrdcA0A0G2JEU3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TrdcA0A0G2JEU3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TrdcA0A0G2JEU3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TrdcA0A0G2JEU3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TrdcA0A0G2JEU3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TrdcA0A0G2JEU3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TrdcA0A0G2JEU3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TrdcA0A0G2JEU3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TrdcA0A0G2JEU3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TrdcA0A0G2JEU3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TrdcA0A0G2JEU3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TrdcA0A0G2JEU3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TrdcA0A0G2JEU3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TrdcA0A0G2JEU3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TrdcA0A0G2JEU3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TrdcA0A0G2JEU3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TrdcA0A0G2JEU3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TrdcA0A0G2JEU3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TrdcA0A0G2JEU3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TrdcA0A0G2JEU3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TrdcA0A0G2JEU3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TrdcA0A0G2JEU3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TrdcA0A0G2JEU3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TrdcA0A0G2JEU3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TrdcA0A0G2JEU3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TrdcA0A0G2JEU3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TrdcA0A0G2JEU3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TrdcA0A0G2JEU3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TrdcA0A0G2JEU3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TrdcA0A0G2JEU3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TrdcA0A0G2JEU3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TrdcA0A0G2JEU3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TrdcA0A0G2JEU3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TrdcA0A0G2JEU3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TrdcA0A0G2JEU3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TrdcA0A0G2JEU3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TrdcA0A0G2JEU3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TrdcA0A0G2JEU3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TrdcA0A0G2JEU3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TrdcA0A0G2JEU3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TrdcA0A0G2JEU3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TrdcA0A0G2JEU3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TrdcA0A0G2JEU3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TrdcA0A0G2JEU3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TrdcA0A0G2JEU3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TrdcA0A0G2JEU3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TrdcA0A0G2JEU3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TrdcA0A0G2JEU3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TrdcA0A0G2JEU3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TrdcA0A0G2JEU3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TrdcA0A0G2JEU3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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