Protein–RNA interactions for Protein: Q12483

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, yeastyeast

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNF8Q12483 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt-0.04□□□□□ -2.42
SNF8Q12483 BUL2YML111W 2763 nt-0.04□□□□□ -2.42
SNF8Q12483 YEL073CYEL073C 324 nt-0.05□□□□□ -2.42
SNF8Q12483 YER078W-AYER078W-A 165 nt-0.05□□□□□ -2.42
SNF8Q12483 YDR157WYDR157W 402 nt-0.06□□□□□ -2.42
SNF8Q12483 YDR366CYDR366C 399 nt-0.06□□□□□ -2.42
SNF8Q12483 YIL032CYIL032C 357 nt-0.06□□□□□ -2.42
SNF8Q12483 YLR041WYLR041W 321 nt-0.06□□□□□ -2.42
SNF8Q12483 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt-0.07□□□□□ -2.42
SNF8Q12483 Q0144Q0144 330 nt-0.08□□□□□ -2.42
SNF8Q12483 YAF9YNL107W 681 nt-0.08□□□□□ -2.42
SNF8Q12483 THO2YNL139C 4794 nt-0.08□□□□□ -2.42
SNF8Q12483 VAR1Q0140 1197 nt-0.09□□□□□ -2.42
SNF8Q12483 YGR069WYGR069W 336 nt-0.09□□□□□ -2.42
SNF8Q12483 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt-0.1□□□□□ -2.43
SNF8Q12483 YER053C-AYER053C-A 114 nt-0.11□□□□□ -2.43
SNF8Q12483 SOV1YMR066W 2697 nt-0.11□□□□□ -2.43
SNF8Q12483 HTL1YCR020W-B 237 nt-0.12□□□□□ -2.43
SNF8Q12483 YLR232WYLR232W 348 nt-0.12□□□□□ -2.43
SNF8Q12483 YDR102CYDR102C 333 nt-0.13□□□□□ -2.43
SNF8Q12483 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt-0.13□□□□□ -2.43
SNF8Q12483 snR45snR45 172 nt-0.13□□□□□ -2.43
SNF8Q12483 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt-0.15□□□□□ -2.43
SNF8Q12483 YNL028WYNL028W 318 nt-0.15□□□□□ -2.43
SNF8Q12483 YOR015WYOR015W 360 nt-0.16□□□□□ -2.44
SNF8Q12483 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt-0.17□□□□□ -2.44
SNF8Q12483 CSE1YGL238W 2883 nt-0.18□□□□□ -2.44
SNF8Q12483 snR36snR36 182 nt-0.18□□□□□ -2.44
SNF8Q12483 YGL149WYGL149W 306 nt-0.19□□□□□ -2.44
SNF8Q12483 snR128snR128 126 nt-0.19□□□□□ -2.44
SNF8Q12483 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt-0.21□□□□□ -2.44
SNF8Q12483 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt-0.21□□□□□ -2.44
SNF8Q12483 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt-0.21□□□□□ -2.44
SNF8Q12483 snR8snR8 190 nt-0.23□□□□□ -2.45
SNF8Q12483 YBR099CYBR099C 384 nt-0.23□□□□□ -2.45
SNF8Q12483 HMRA1YCR097W 381 nt-0.24□□□□□ -2.45
SNF8Q12483 snR74snR74 88 nt-0.24□□□□□ -2.45
SNF8Q12483 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt-0.24□□□□□ -2.45
SNF8Q12483 SDH6YDR379C-A 240 nt-0.24□□□□□ -2.45
SNF8Q12483 ATP6Q0085 780 nt-0.24□□□□□ -2.45
SNF8Q12483 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt-0.24□□□□□ -2.45
SNF8Q12483 YPR197CYPR197C 564 nt-0.24□□□□□ -2.45
SNF8Q12483 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt-0.25□□□□□ -2.45
SNF8Q12483 UTP8YGR128C 2142 nt-0.26□□□□□ -2.45
SNF8Q12483 GLG1YKR058W 1851 nt-0.26□□□□□ -2.45
SNF8Q12483 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt-0.26□□□□□ -2.45
SNF8Q12483 APQ12YIL040W 417 nt-0.27□□□□□ -2.45
SNF8Q12483 YDR544CYDR544C 429 nt-0.28□□□□□ -2.45
SNF8Q12483 YFL032WYFL032W 321 nt-0.28□□□□□ -2.45
SNF8Q12483 EST1YLR233C 2100 nt-0.29□□□□□ -2.46
SNF8Q12483 RAD61YDR014W 1944 nt-0.3□□□□□ -2.46
SNF8Q12483 YGL052WYGL052W 306 nt-0.32□□□□□ -2.46
SNF8Q12483 TAH1YCR060W 336 nt-0.33□□□□□ -2.46
SNF8Q12483 PRP39YML046W 1890 nt-0.34□□□□□ -2.46
SNF8Q12483 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt-0.34□□□□□ -2.46
SNF8Q12483 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt-0.35□□□□□ -2.47
SNF8Q12483 YDR210WYDR210W 228 nt-0.35□□□□□ -2.47
SNF8Q12483 YPR012WYPR012W 255 nt-0.35□□□□□ -2.47
SNF8Q12483 YDR413CYDR413C 576 nt-0.37□□□□□ -2.47
SNF8Q12483 YFL019CYFL019C 354 nt-0.37□□□□□ -2.47
SNF8Q12483 SBH2YER019C-A 267 nt-0.38□□□□□ -2.47
SNF8Q12483 COG6YNL041C 2520 nt-0.39□□□□□ -2.47
SNF8Q12483 TFB5YDR079C-A 219 nt-0.42□□□□□ -2.48
SNF8Q12483 YER097WYER097W 330 nt-0.42□□□□□ -2.48
SNF8Q12483 RPL39YJL189W 156 nt-0.43□□□□□ -2.48
SNF8Q12483 YKL118WYKL118W 312 nt-0.43□□□□□ -2.48
SNF8Q12483 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt-0.44□□□□□ -2.48
SNF8Q12483 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt-0.45□□□□□ -2.48
SNF8Q12483 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt-0.45□□□□□ -2.48
SNF8Q12483 YGL041CYGL041C 204 nt-0.47□□□□□ -2.48
SNF8Q12483 YGR164WYGR164W 336 nt-0.48□□□□□ -2.49
SNF8Q12483 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt-0.49□□□□□ -2.49
SNF8Q12483 YML099W-AYML099W-A 330 nt-0.5□□□□□ -2.49
SNF8Q12483 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt-0.51□□□□□ -2.49
SNF8Q12483 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt-0.52□□□□□ -2.49
SNF8Q12483 RPM2YML091C 3609 nt-0.52□□□□□ -2.49
SNF8Q12483 GIM4YEL003W 336 nt-0.53□□□□□ -2.49
SNF8Q12483 YGL182CYGL182C 324 nt-0.53□□□□□ -2.49
SNF8Q12483 snR46snR46 197 nt-0.57□□□□□ -2.5
SNF8Q12483 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt-0.58□□□□□ -2.5
SNF8Q12483 YEL014CYEL014C 306 nt-0.58□□□□□ -2.5
SNF8Q12483 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt-0.58□□□□□ -2.5
SNF8Q12483 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt-0.59□□□□□ -2.5
SNF8Q12483 SEC10YLR166C 2616 nt-0.59□□□□□ -2.5
SNF8Q12483 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt-0.6□□□□□ -2.51
SNF8Q12483 snR55snR55 98 nt-0.64□□□□□ -2.51
SNF8Q12483 YJL182CYJL182C 318 nt-0.64□□□□□ -2.51
SNF8Q12483 YER181CYER181C 324 nt-0.65□□□□□ -2.51
SNF8Q12483 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt-0.65□□□□□ -2.51
SNF8Q12483 URB1YKL014C 5295 nt-0.65□□□□□ -2.51
SNF8Q12483 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt-0.66□□□□□ -2.52
SNF8Q12483 YML100W-AYML100W-A 174 nt-0.66□□□□□ -2.52
SNF8Q12483 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt-0.66□□□□□ -2.52
SNF8Q12483 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt-0.67□□□□□ -2.52
SNF8Q12483 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt-0.67□□□□□ -2.52
SNF8Q12483 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt-0.67□□□□□ -2.52
SNF8Q12483 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.68□□□□□ -2.52
SNF8Q12483 snR49snR49 165 nt-0.68□□□□□ -2.52
SNF8Q12483 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt-0.7□□□□□ -2.52
SNF8Q12483 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.72□□□□□ -2.52
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