Protein–RNA interactions for Protein: Q12287

COX17, Cytochrome c oxidase copper chaperone, yeastyeast

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
COX17Q12287 YPR117WYPR117W 7470 nt0.94□□□□□ -2.26
COX17Q12287 YER053C-AYER053C-A 114 nt0.94□□□□□ -2.26
COX17Q12287 snR46snR46 197 nt0.94□□□□□ -2.26
COX17Q12287 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.93□□□□□ -2.26
COX17Q12287 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.93□□□□□ -2.26
COX17Q12287 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.93□□□□□ -2.26
COX17Q12287 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.93□□□□□ -2.26
COX17Q12287 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.93□□□□□ -2.26
COX17Q12287 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.93□□□□□ -2.26
COX17Q12287 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.93□□□□□ -2.26
COX17Q12287 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.93□□□□□ -2.26
COX17Q12287 PRP5YBR237W 2550 nt0.93□□□□□ -2.26
COX17Q12287 FYV10YIL097W 1551 nt0.92□□□□□ -2.26
COX17Q12287 YJR029WYJR029W 5268 nt0.92□□□□□ -2.26
COX17Q12287 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.92□□□□□ -2.26
COX17Q12287 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.92□□□□□ -2.26
COX17Q12287 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.92□□□□□ -2.26
COX17Q12287 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.92□□□□□ -2.26
COX17Q12287 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.92□□□□□ -2.26
COX17Q12287 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.92□□□□□ -2.26
COX17Q12287 RPM2YML091C 3609 nt0.91□□□□□ -2.26
COX17Q12287 YSP1YHR155W 3687 nt0.91□□□□□ -2.26
COX17Q12287 BEM3YPL115C 3387 nt0.9□□□□□ -2.26
COX17Q12287 CHS6YJL099W 2241 nt0.89□□□□□ -2.27
COX17Q12287 UTP20YBL004W 7482 nt0.89□□□□□ -2.27
COX17Q12287 UTP8YGR128C 2142 nt0.88□□□□□ -2.27
COX17Q12287 PRP42YDR235W 1635 nt0.88□□□□□ -2.27
COX17Q12287 OST4YDL232W 111 nt0.87□□□□□ -2.27
COX17Q12287 TRS65YGR166W 1683 nt0.87□□□□□ -2.27
COX17Q12287 QCR9YGR183C 201 nt0.86□□□□□ -2.27
COX17Q12287 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt0.86□□□□□ -2.27
COX17Q12287 VAM6YDL077C 3150 nt0.86□□□□□ -2.27
COX17Q12287 PRP39YML046W 1890 nt0.86□□□□□ -2.27
COX17Q12287 YJL182CYJL182C 318 nt0.85□□□□□ -2.27
COX17Q12287 RKR1YMR247C 4689 nt0.85□□□□□ -2.27
COX17Q12287 YEL073CYEL073C 324 nt0.84□□□□□ -2.27
COX17Q12287 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.84□□□□□ -2.27
COX17Q12287 SEC1YDR164C 2175 nt0.83□□□□□ -2.28
COX17Q12287 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt0.83□□□□□ -2.28
COX17Q12287 SNU13YEL026W 381 nt0.81□□□□□ -2.28
COX17Q12287 YLR232WYLR232W 348 nt0.8□□□□□ -2.28
COX17Q12287 snR52snR52 92 nt0.8□□□□□ -2.28
COX17Q12287 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.79□□□□□ -2.28
COX17Q12287 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.78□□□□□ -2.28
COX17Q12287 YNL337WYNL337W 255 nt0.78□□□□□ -2.28
COX17Q12287 TAH1YCR060W 336 nt0.77□□□□□ -2.29
COX17Q12287 YMR160WYMR160W 2451 nt0.77□□□□□ -2.29
COX17Q12287 IQG1YPL242C 4488 nt0.77□□□□□ -2.29
COX17Q12287 YOL014WYOL014W 375 nt0.76□□□□□ -2.29
COX17Q12287 YGL182CYGL182C 324 nt0.75□□□□□ -2.29
COX17Q12287 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt0.75□□□□□ -2.29
COX17Q12287 YJL150WYJL150W 303 nt0.74□□□□□ -2.29
COX17Q12287 MLP1YKR095W 5628 nt0.73□□□□□ -2.29
COX17Q12287 ULP2YIL031W 3105 nt0.72□□□□□ -2.29
COX17Q12287 YOR170WYOR170W 306 nt0.71□□□□□ -2.3
COX17Q12287 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.71□□□□□ -2.3
COX17Q12287 NNF2YGR089W 2811 nt0.71□□□□□ -2.3
COX17Q12287 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.7□□□□□ -2.3
COX17Q12287 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt0.7□□□□□ -2.3
COX17Q12287 PET111YMR257C 2403 nt0.69□□□□□ -2.3
COX17Q12287 BEM2YER155C 6504 nt0.68□□□□□ -2.3
COX17Q12287 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.66□□□□□ -2.3
COX17Q12287 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt0.66□□□□□ -2.3
COX17Q12287 GLG1YKR058W 1851 nt0.66□□□□□ -2.3
COX17Q12287 BIR1YJR089W 2865 nt0.65□□□□□ -2.31
COX17Q12287 Q0032Q0032 291 nt0.64□□□□□ -2.31
COX17Q12287 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt0.64□□□□□ -2.31
COX17Q12287 NIP1YMR309C 2439 nt0.63□□□□□ -2.31
COX17Q12287 snR48snR48 113 nt0.63□□□□□ -2.31
COX17Q12287 COG6YNL041C 2520 nt0.63□□□□□ -2.31
COX17Q12287 BUL2YML111W 2763 nt0.62□□□□□ -2.31
COX17Q12287 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt0.62□□□□□ -2.31
COX17Q12287 YGR151CYGR151C 336 nt0.61□□□□□ -2.31
COX17Q12287 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.61□□□□□ -2.31
COX17Q12287 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.61□□□□□ -2.31
COX17Q12287 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.61□□□□□ -2.31
COX17Q12287 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.61□□□□□ -2.31
COX17Q12287 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.61□□□□□ -2.31
COX17Q12287 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.61□□□□□ -2.31
COX17Q12287 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.61□□□□□ -2.31
COX17Q12287 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.61□□□□□ -2.31
COX17Q12287 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.61□□□□□ -2.31
COX17Q12287 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.61□□□□□ -2.31
COX17Q12287 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.61□□□□□ -2.31
COX17Q12287 YDR544CYDR544C 429 nt0.6□□□□□ -2.31
COX17Q12287 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.6□□□□□ -2.31
COX17Q12287 MLP2YIL149C 5040 nt0.59□□□□□ -2.31
COX17Q12287 SDH6YDR379C-A 240 nt0.59□□□□□ -2.31
COX17Q12287 RPS26AYGL189C 360 nt0.59□□□□□ -2.31
COX17Q12287 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.57□□□□□ -2.32
COX17Q12287 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt0.57□□□□□ -2.32
COX17Q12287 YNL198CYNL198C 303 nt0.57□□□□□ -2.32
COX17Q12287 SBH1YER087C-B 249 nt0.56□□□□□ -2.32
COX17Q12287 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt0.56□□□□□ -2.32
COX17Q12287 YOR102WYOR102W 351 nt0.55□□□□□ -2.32
COX17Q12287 AI1Q0050 2505 nt0.54□□□□□ -2.32
COX17Q12287 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt0.54□□□□□ -2.32
COX17Q12287 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.54□□□□□ -2.32
COX17Q12287 UTP10YJL109C 5310 nt0.51□□□□□ -2.33
COX17Q12287 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt0.51□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 50.2 ms