Protein–RNA interactions for Protein: Q12276

HER1, HMG2-induced ER-remodeling protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HER1Q12276 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt1.33□□□□□ -2.2
HER1Q12276 EAF1YDR359C 2949 nt1.33□□□□□ -2.2
HER1Q12276 YGR130CYGR130C 2451 nt1.31□□□□□ -2.2
HER1Q12276 YDR544CYDR544C 429 nt1.31□□□□□ -2.2
HER1Q12276 STO1YMR125W 2586 nt1.31□□□□□ -2.2
HER1Q12276 SET3YKR029C 2256 nt1.31□□□□□ -2.2
HER1Q12276 NUP157YER105C 4176 nt1.3□□□□□ -2.2
HER1Q12276 TFB5YDR079C-A 219 nt1.3□□□□□ -2.2
HER1Q12276 APL3YBL037W 3078 nt1.3□□□□□ -2.2
HER1Q12276 NOP9YJL010C 2001 nt1.29□□□□□ -2.2
HER1Q12276 TAH1YCR060W 336 nt1.29□□□□□ -2.2
HER1Q12276 PMP2YEL017C-A 132 nt1.29□□□□□ -2.2
HER1Q12276 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt1.29□□□□□ -2.2
HER1Q12276 YML002WYML002W 2214 nt1.29□□□□□ -2.2
HER1Q12276 SWI4YER111C 3282 nt1.29□□□□□ -2.2
HER1Q12276 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt1.28□□□□□ -2.2
HER1Q12276 CLU1YMR012W 3834 nt1.28□□□□□ -2.21
HER1Q12276 SOM1YEL059C-A 225 nt1.27□□□□□ -2.21
HER1Q12276 YLR041WYLR041W 321 nt1.27□□□□□ -2.21
HER1Q12276 YMR326CYMR326C 309 nt1.27□□□□□ -2.21
HER1Q12276 WAR1YML076C 2835 nt1.26□□□□□ -2.21
HER1Q12276 QCR9YGR183C 201 nt1.26□□□□□ -2.21
HER1Q12276 snR39BsnR39B 96 nt1.25□□□□□ -2.21
HER1Q12276 SEC3YER008C 4011 nt1.24□□□□□ -2.21
HER1Q12276 CDC25YLR310C 4770 nt1.24□□□□□ -2.21
HER1Q12276 ASE1YOR058C 2658 nt1.23□□□□□ -2.21
HER1Q12276 RAD9YDR217C 3930 nt1.23□□□□□ -2.21
HER1Q12276 FYV10YIL097W 1551 nt1.23□□□□□ -2.21
HER1Q12276 RPL26BYGR034W 384 nt1.23□□□□□ -2.21
HER1Q12276 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt1.23□□□□□ -2.21
HER1Q12276 snR190snR190 190 nt1.23□□□□□ -2.21
HER1Q12276 NUP145YGL092W 3954 nt1.23□□□□□ -2.21
HER1Q12276 snR61snR61 90 nt1.22□□□□□ -2.21
HER1Q12276 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.22□□□□□ -2.21
HER1Q12276 GEA2YEL022W 4380 nt1.22□□□□□ -2.21
HER1Q12276 PAU12YGR294W 363 nt1.21□□□□□ -2.22
HER1Q12276 PAU24YBR301W 363 nt1.21□□□□□ -2.22
HER1Q12276 YHR217CYHR217C 462 nt1.2□□□□□ -2.22
HER1Q12276 YLR232WYLR232W 348 nt1.2□□□□□ -2.22
HER1Q12276 LAA1YJL207C 6045 nt1.19□□□□□ -2.22
HER1Q12276 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.18□□□□□ -2.22
HER1Q12276 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.18□□□□□ -2.22
HER1Q12276 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.18□□□□□ -2.22
HER1Q12276 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.18□□□□□ -2.22
HER1Q12276 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.18□□□□□ -2.22
HER1Q12276 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.18□□□□□ -2.22
HER1Q12276 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.18□□□□□ -2.22
HER1Q12276 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt1.18□□□□□ -2.22
HER1Q12276 NST1YNL091W 3723 nt1.18□□□□□ -2.22
HER1Q12276 ROM2YLR371W 4071 nt1.18□□□□□ -2.22
HER1Q12276 IML1YJR138W 4755 nt1.17□□□□□ -2.22
HER1Q12276 COG6YNL041C 2520 nt1.15□□□□□ -2.23
HER1Q12276 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.14□□□□□ -2.23
HER1Q12276 YDR210WYDR210W 228 nt1.14□□□□□ -2.23
HER1Q12276 SBH1YER087C-B 249 nt1.14□□□□□ -2.23
HER1Q12276 SEC8YPR055W 3198 nt1.12□□□□□ -2.23
HER1Q12276 RCO1YMR075W 2055 nt1.12□□□□□ -2.23
HER1Q12276 KAP120YPL125W 3099 nt1.12□□□□□ -2.23
HER1Q12276 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt1.11□□□□□ -2.23
HER1Q12276 VAM6YDL077C 3150 nt1.11□□□□□ -2.23
HER1Q12276 PRP16YKR086W 3216 nt1.11□□□□□ -2.23
HER1Q12276 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt1.1□□□□□ -2.23
HER1Q12276 RPM2YML091C 3609 nt1.1□□□□□ -2.23
HER1Q12276 YDL073WYDL073W 2955 nt1.1□□□□□ -2.23
HER1Q12276 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt1.09□□□□□ -2.23
HER1Q12276 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.09□□□□□ -2.23
HER1Q12276 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.09□□□□□ -2.23
HER1Q12276 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt1.08□□□□□ -2.24
HER1Q12276 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt1.08□□□□□ -2.24
HER1Q12276 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt1.08□□□□□ -2.24
HER1Q12276 SEC1YDR164C 2175 nt1.07□□□□□ -2.24
HER1Q12276 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt1.07□□□□□ -2.24
HER1Q12276 SPT7YBR081C 3999 nt1.07□□□□□ -2.24
HER1Q12276 BIR1YJR089W 2865 nt1.06□□□□□ -2.24
HER1Q12276 BEM3YPL115C 3387 nt1.04□□□□□ -2.24
HER1Q12276 SIP4YJL089W 2490 nt1.03□□□□□ -2.24
HER1Q12276 YJR029WYJR029W 5268 nt1.03□□□□□ -2.24
HER1Q12276 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.03□□□□□ -2.24
HER1Q12276 EMT1tM(CAU)D 73 nt1.02□□□□□ -2.25
HER1Q12276 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.02□□□□□ -2.25
HER1Q12276 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.02□□□□□ -2.25
HER1Q12276 EMT4tM(CAU)M 73 nt1.02□□□□□ -2.25
HER1Q12276 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1.02□□□□□ -2.25
HER1Q12276 YNL266WYNL266W 420 nt1.02□□□□□ -2.25
HER1Q12276 UBP3YER151C 2739 nt1.02□□□□□ -2.25
HER1Q12276 YSP1YHR155W 3687 nt1.01□□□□□ -2.25
HER1Q12276 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt1□□□□□ -2.25
HER1Q12276 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt1□□□□□ -2.25
HER1Q12276 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt1□□□□□ -2.25
HER1Q12276 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt1□□□□□ -2.25
HER1Q12276 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt1□□□□□ -2.25
HER1Q12276 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt1□□□□□ -2.25
HER1Q12276 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt1□□□□□ -2.25
HER1Q12276 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt1□□□□□ -2.25
HER1Q12276 BEM2YER155C 6504 nt1□□□□□ -2.25
HER1Q12276 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt0.99□□□□□ -2.25
HER1Q12276 snR81snR81 201 nt0.98□□□□□ -2.25
HER1Q12276 DOP1YDR141C 5097 nt0.97□□□□□ -2.25
HER1Q12276 SCC2YDR180W 4482 nt0.97□□□□□ -2.25
HER1Q12276 GLG1YKR058W 1851 nt0.97□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.8 ms