Protein–RNA interactions for Protein: Q12010

YPQ1, Probable vacuolar amino acid transporter YPQ1, yeastyeast

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPQ1Q12010 CMC4YMR194C-B 222 nt0.9□□□□□ -2.27
YPQ1Q12010 snR46snR46 197 nt0.9□□□□□ -2.27
YPQ1Q12010 PMP1YCR024C-A 123 nt0.89□□□□□ -2.27
YPQ1Q12010 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt0.88□□□□□ -2.27
YPQ1Q12010 YEL014CYEL014C 306 nt0.88□□□□□ -2.27
YPQ1Q12010 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt0.88□□□□□ -2.27
YPQ1Q12010 HAL9YOL089C 3093 nt0.88□□□□□ -2.27
YPQ1Q12010 SCC2YDR180W 4482 nt0.88□□□□□ -2.27
YPQ1Q12010 NOP9YJL010C 2001 nt0.88□□□□□ -2.27
YPQ1Q12010 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt0.87□□□□□ -2.27
YPQ1Q12010 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt0.87□□□□□ -2.27
YPQ1Q12010 YJL182CYJL182C 318 nt0.86□□□□□ -2.27
YPQ1Q12010 snR52snR52 92 nt0.86□□□□□ -2.27
YPQ1Q12010 UTP20YBL004W 7482 nt0.85□□□□□ -2.27
YPQ1Q12010 YER053C-AYER053C-A 114 nt0.85□□□□□ -2.27
YPQ1Q12010 PRP39YML046W 1890 nt0.85□□□□□ -2.27
YPQ1Q12010 SMC1YFL008W 3678 nt0.84□□□□□ -2.27
YPQ1Q12010 YPL044CYPL044C 549 nt0.84□□□□□ -2.27
YPQ1Q12010 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt0.83□□□□□ -2.28
YPQ1Q12010 BFR2YDR299W 1605 nt0.82□□□□□ -2.28
YPQ1Q12010 RKR1YMR247C 4689 nt0.82□□□□□ -2.28
YPQ1Q12010 YGR151CYGR151C 336 nt0.82□□□□□ -2.28
YPQ1Q12010 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt0.82□□□□□ -2.28
YPQ1Q12010 YLR282CYLR282C 342 nt0.82□□□□□ -2.28
YPQ1Q12010 YMR160WYMR160W 2451 nt0.81□□□□□ -2.28
YPQ1Q12010 TRS65YGR166W 1683 nt0.81□□□□□ -2.28
YPQ1Q12010 snR190snR190 190 nt0.8□□□□□ -2.28
YPQ1Q12010 Q0032Q0032 291 nt0.79□□□□□ -2.28
YPQ1Q12010 YNL338WYNL338W 159 nt0.79□□□□□ -2.28
YPQ1Q12010 YOL014WYOL014W 375 nt0.79□□□□□ -2.28
YPQ1Q12010 COX5BYIL111W 456 nt0.78□□□□□ -2.28
YPQ1Q12010 DOP1YDR141C 5097 nt0.78□□□□□ -2.29
YPQ1Q12010 RPL26BYGR034W 384 nt0.77□□□□□ -2.29
YPQ1Q12010 YLR041WYLR041W 321 nt0.77□□□□□ -2.29
YPQ1Q12010 YLR294CYLR294C 330 nt0.77□□□□□ -2.29
YPQ1Q12010 YBL053WYBL053W 375 nt0.77□□□□□ -2.29
YPQ1Q12010 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.76□□□□□ -2.29
YPQ1Q12010 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.76□□□□□ -2.29
YPQ1Q12010 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.76□□□□□ -2.29
YPQ1Q12010 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.76□□□□□ -2.29
YPQ1Q12010 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.76□□□□□ -2.29
YPQ1Q12010 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.76□□□□□ -2.29
YPQ1Q12010 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.76□□□□□ -2.29
YPQ1Q12010 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.76□□□□□ -2.29
YPQ1Q12010 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.76□□□□□ -2.29
YPQ1Q12010 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.76□□□□□ -2.29
YPQ1Q12010 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.76□□□□□ -2.29
YPQ1Q12010 PRP42YDR235W 1635 nt0.75□□□□□ -2.29
YPQ1Q12010 YEL073CYEL073C 324 nt0.75□□□□□ -2.29
YPQ1Q12010 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.75□□□□□ -2.29
YPQ1Q12010 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt0.75□□□□□ -2.29
YPQ1Q12010 FYV10YIL097W 1551 nt0.74□□□□□ -2.29
YPQ1Q12010 YML002WYML002W 2214 nt0.73□□□□□ -2.29
YPQ1Q12010 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.73□□□□□ -2.29
YPQ1Q12010 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt0.73□□□□□ -2.29
YPQ1Q12010 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.73□□□□□ -2.29
YPQ1Q12010 PRP5YBR237W 2550 nt0.73□□□□□ -2.29
YPQ1Q12010 SEC1YDR164C 2175 nt0.72□□□□□ -2.29
YPQ1Q12010 LTE1YAL024C 4308 nt0.71□□□□□ -2.3
YPQ1Q12010 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt0.71□□□□□ -2.3
YPQ1Q12010 CHS6YJL099W 2241 nt0.7□□□□□ -2.3
YPQ1Q12010 SEC8YPR055W 3198 nt0.69□□□□□ -2.3
YPQ1Q12010 TAH1YCR060W 336 nt0.69□□□□□ -2.3
YPQ1Q12010 YGL182CYGL182C 324 nt0.69□□□□□ -2.3
YPQ1Q12010 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt0.69□□□□□ -2.3
YPQ1Q12010 YSP1YHR155W 3687 nt0.68□□□□□ -2.3
YPQ1Q12010 UTP8YGR128C 2142 nt0.67□□□□□ -2.3
YPQ1Q12010 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt0.66□□□□□ -2.3
YPQ1Q12010 YDR544CYDR544C 429 nt0.66□□□□□ -2.3
YPQ1Q12010 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.66□□□□□ -2.3
YPQ1Q12010 OST4YDL232W 111 nt0.65□□□□□ -2.31
YPQ1Q12010 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt0.65□□□□□ -2.31
YPQ1Q12010 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt0.65□□□□□ -2.31
YPQ1Q12010 IQG1YPL242C 4488 nt0.64□□□□□ -2.31
YPQ1Q12010 SNU13YEL026W 381 nt0.63□□□□□ -2.31
YPQ1Q12010 snR48snR48 113 nt0.63□□□□□ -2.31
YPQ1Q12010 YLR232WYLR232W 348 nt0.62□□□□□ -2.31
YPQ1Q12010 YOR170WYOR170W 306 nt0.62□□□□□ -2.31
YPQ1Q12010 snR39BsnR39B 96 nt0.62□□□□□ -2.31
YPQ1Q12010 BEM3YPL115C 3387 nt0.62□□□□□ -2.31
YPQ1Q12010 YOR102WYOR102W 351 nt0.61□□□□□ -2.31
YPQ1Q12010 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt0.61□□□□□ -2.31
YPQ1Q12010 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.61□□□□□ -2.31
YPQ1Q12010 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.6□□□□□ -2.31
YPQ1Q12010 FMP27YLR454W 7887 nt0.6□□□□□ -2.31
YPQ1Q12010 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt0.6□□□□□ -2.31
YPQ1Q12010 ULP2YIL031W 3105 nt0.6□□□□□ -2.31
YPQ1Q12010 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.58□□□□□ -2.32
YPQ1Q12010 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.57□□□□□ -2.32
YPQ1Q12010 COG6YNL041C 2520 nt0.56□□□□□ -2.32
YPQ1Q12010 SDH6YDR379C-A 240 nt0.56□□□□□ -2.32
YPQ1Q12010 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt0.56□□□□□ -2.32
YPQ1Q12010 YDR210WYDR210W 228 nt0.54□□□□□ -2.32
YPQ1Q12010 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt0.54□□□□□ -2.32
YPQ1Q12010 BUL2YML111W 2763 nt0.53□□□□□ -2.32
YPQ1Q12010 NNF2YGR089W 2811 nt0.52□□□□□ -2.33
YPQ1Q12010 AI1Q0050 2505 nt0.52□□□□□ -2.33
YPQ1Q12010 YGR164WYGR164W 336 nt0.51□□□□□ -2.33
YPQ1Q12010 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.5□□□□□ -2.33
YPQ1Q12010 ATP8Q0080 147 nt0.49□□□□□ -2.33
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