Protein–RNA interactions for Protein: Q08641

ABP140, tRNA(Thr) (cytosine(32)-N(3))-methyltransferase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ABP140Q08641 snR189snR189 189 nt-0.34□□□□□ -2.46
ABP140Q08641 YBR099CYBR099C 384 nt-0.34□□□□□ -2.46
ABP140Q08641 YBR285WYBR285W 435 nt-0.34□□□□□ -2.46
ABP140Q08641 YER053C-AYER053C-A 114 nt-0.35□□□□□ -2.47
ABP140Q08641 YOR121CYOR121C 306 nt-0.36□□□□□ -2.47
ABP140Q08641 CSE2YNR010W 450 nt-0.37□□□□□ -2.47
ABP140Q08641 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt-0.38□□□□□ -2.47
ABP140Q08641 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt-0.38□□□□□ -2.47
ABP140Q08641 SDH6YDR379C-A 240 nt-0.39□□□□□ -2.47
ABP140Q08641 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt-0.39□□□□□ -2.47
ABP140Q08641 RAD61YDR014W 1944 nt-0.39□□□□□ -2.47
ABP140Q08641 snR60snR60 104 nt-0.4□□□□□ -2.47
ABP140Q08641 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt-0.4□□□□□ -2.47
ABP140Q08641 YDR544CYDR544C 429 nt-0.41□□□□□ -2.48
ABP140Q08641 YLR202CYLR202C 327 nt-0.41□□□□□ -2.48
ABP140Q08641 YGR164WYGR164W 336 nt-0.42□□□□□ -2.48
ABP140Q08641 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt-0.42□□□□□ -2.48
ABP140Q08641 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt-0.44□□□□□ -2.48
ABP140Q08641 GLG1YKR058W 1851 nt-0.45□□□□□ -2.48
ABP140Q08641 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt-0.45□□□□□ -2.48
ABP140Q08641 YJR157WYJR157W 363 nt-0.45□□□□□ -2.48
ABP140Q08641 YKL063CYKL063C 504 nt-0.45□□□□□ -2.48
ABP140Q08641 AGA2YGL032C 264 nt-0.46□□□□□ -2.48
ABP140Q08641 APQ12YIL040W 417 nt-0.46□□□□□ -2.48
ABP140Q08641 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt-0.46□□□□□ -2.48
ABP140Q08641 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.46□□□□□ -2.48
ABP140Q08641 URB1YKL014C 5295 nt-0.46□□□□□ -2.48
ABP140Q08641 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt-0.47□□□□□ -2.48
ABP140Q08641 SEC10YLR166C 2616 nt-0.48□□□□□ -2.49
ABP140Q08641 HMRA1YCR097W 381 nt-0.49□□□□□ -2.49
ABP140Q08641 YOR015WYOR015W 360 nt-0.49□□□□□ -2.49
ABP140Q08641 BIL1YOR304C-A 231 nt-0.49□□□□□ -2.49
ABP140Q08641 snR36snR36 182 nt-0.49□□□□□ -2.49
ABP140Q08641 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt-0.5□□□□□ -2.49
ABP140Q08641 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt-0.51□□□□□ -2.49
ABP140Q08641 TAH1YCR060W 336 nt-0.52□□□□□ -2.49
ABP140Q08641 YIL032CYIL032C 357 nt-0.52□□□□□ -2.49
ABP140Q08641 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt-0.53□□□□□ -2.49
ABP140Q08641 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt-0.53□□□□□ -2.49
ABP140Q08641 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt-0.54□□□□□ -2.5
ABP140Q08641 snR46snR46 197 nt-0.54□□□□□ -2.5
ABP140Q08641 snR74snR74 88 nt-0.55□□□□□ -2.5
ABP140Q08641 YGR035CYGR035C 351 nt-0.55□□□□□ -2.5
ABP140Q08641 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt-0.55□□□□□ -2.5
ABP140Q08641 YNL324WYNL324W 396 nt-0.55□□□□□ -2.5
ABP140Q08641 COG6YNL041C 2520 nt-0.55□□□□□ -2.5
ABP140Q08641 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.56□□□□□ -2.5
ABP140Q08641 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt-0.57□□□□□ -2.5
ABP140Q08641 HTL1YCR020W-B 237 nt-0.58□□□□□ -2.5
ABP140Q08641 ATP6Q0085 780 nt-0.58□□□□□ -2.5
ABP140Q08641 YNL028WYNL028W 318 nt-0.59□□□□□ -2.5
ABP140Q08641 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.61□□□□□ -2.51
ABP140Q08641 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt-0.61□□□□□ -2.51
ABP140Q08641 YML099W-AYML099W-A 330 nt-0.61□□□□□ -2.51
ABP140Q08641 YML100W-AYML100W-A 174 nt-0.61□□□□□ -2.51
ABP140Q08641 YAF9YNL107W 681 nt-0.62□□□□□ -2.51
ABP140Q08641 YDR102CYDR102C 333 nt-0.63□□□□□ -2.51
ABP140Q08641 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt-0.63□□□□□ -2.51
ABP140Q08641 YGL052WYGL052W 306 nt-0.65□□□□□ -2.51
ABP140Q08641 YGL149WYGL149W 306 nt-0.66□□□□□ -2.52
ABP140Q08641 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt-0.67□□□□□ -2.52
ABP140Q08641 snR33snR33 183 nt-0.67□□□□□ -2.52
ABP140Q08641 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt-0.68□□□□□ -2.52
ABP140Q08641 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt-0.68□□□□□ -2.52
ABP140Q08641 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt-0.68□□□□□ -2.52
ABP140Q08641 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt-0.7□□□□□ -2.52
ABP140Q08641 RPM2YML091C 3609 nt-0.71□□□□□ -2.52
ABP140Q08641 YFL032WYFL032W 321 nt-0.71□□□□□ -2.52
ABP140Q08641 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt-0.71□□□□□ -2.52
ABP140Q08641 Q0017Q0017 162 nt-0.71□□□□□ -2.52
ABP140Q08641 YGL041CYGL041C 204 nt-0.72□□□□□ -2.52
ABP140Q08641 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt-0.72□□□□□ -2.52
ABP140Q08641 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt-0.73□□□□□ -2.53
ABP140Q08641 YGL182CYGL182C 324 nt-0.73□□□□□ -2.53
ABP140Q08641 YOR170WYOR170W 306 nt-0.73□□□□□ -2.53
ABP140Q08641 YEL014CYEL014C 306 nt-0.75□□□□□ -2.53
ABP140Q08641 snR49snR49 165 nt-0.76□□□□□ -2.53
ABP140Q08641 snR69snR69 101 nt-0.77□□□□□ -2.53
ABP140Q08641 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.77□□□□□ -2.53
ABP140Q08641 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.77□□□□□ -2.53
ABP140Q08641 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.77□□□□□ -2.53
ABP140Q08641 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt-0.77□□□□□ -2.53
ABP140Q08641 snR50snR50 90 nt-0.77□□□□□ -2.53
ABP140Q08641 YJL182CYJL182C 318 nt-0.78□□□□□ -2.53
ABP140Q08641 YFL019CYFL019C 354 nt-0.79□□□□□ -2.54
ABP140Q08641 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt-0.79□□□□□ -2.54
ABP140Q08641 YNL266WYNL266W 420 nt-0.8□□□□□ -2.54
ABP140Q08641 YDR157WYDR157W 402 nt-0.81□□□□□ -2.54
ABP140Q08641 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt-0.81□□□□□ -2.54
ABP140Q08641 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt-0.83□□□□□ -2.54
ABP140Q08641 YPR197CYPR197C 564 nt-0.83□□□□□ -2.54
ABP140Q08641 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt-0.83□□□□□ -2.54
ABP140Q08641 YER090C-AYER090C-A 90 nt-0.84□□□□□ -2.54
ABP140Q08641 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt-0.84□□□□□ -2.54
ABP140Q08641 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt-0.84□□□□□ -2.54
ABP140Q08641 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt-0.85□□□□□ -2.55
ABP140Q08641 YER097WYER097W 330 nt-0.85□□□□□ -2.55
ABP140Q08641 YDR413CYDR413C 576 nt-0.87□□□□□ -2.55
ABP140Q08641 JLP2YMR132C 627 nt-0.87□□□□□ -2.55
ABP140Q08641 RDS3YPR094W 324 nt-0.88□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.9 ms