Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.3 ms