Protein–RNA interactions for Protein: P36517

MRPL4, 54S ribosomal protein L4, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MRPL4P36517 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt1.1□□□□□ -2.23
MRPL4P36517 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.1□□□□□ -2.23
MRPL4P36517 MYO1YHR023W 5787 nt1.1□□□□□ -2.23
MRPL4P36517 STO1YMR125W 2586 nt1.1□□□□□ -2.23
MRPL4P36517 GEA2YEL022W 4380 nt1.1□□□□□ -2.23
MRPL4P36517 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.09□□□□□ -2.23
MRPL4P36517 NUP192YJL039C 5052 nt1.09□□□□□ -2.24
MRPL4P36517 NST1YNL091W 3723 nt1.08□□□□□ -2.24
MRPL4P36517 CDC25YLR310C 4770 nt1.08□□□□□ -2.24
MRPL4P36517 OST4YDL232W 111 nt1.08□□□□□ -2.24
MRPL4P36517 YDR544CYDR544C 429 nt1.08□□□□□ -2.24
MRPL4P36517 UTP8YGR128C 2142 nt1.08□□□□□ -2.24
MRPL4P36517 snR39BsnR39B 96 nt1.08□□□□□ -2.24
MRPL4P36517 TAH1YCR060W 336 nt1.07□□□□□ -2.24
MRPL4P36517 QCR9YGR183C 201 nt1.07□□□□□ -2.24
MRPL4P36517 YLR282CYLR282C 342 nt1.07□□□□□ -2.24
MRPL4P36517 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt1.07□□□□□ -2.24
MRPL4P36517 SMC1YFL008W 3678 nt1.07□□□□□ -2.24
MRPL4P36517 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt1.06□□□□□ -2.24
MRPL4P36517 PAN2YGL094C 3348 nt1.06□□□□□ -2.24
MRPL4P36517 ROM2YLR371W 4071 nt1.05□□□□□ -2.24
MRPL4P36517 SOM1YEL059C-A 225 nt1.05□□□□□ -2.24
MRPL4P36517 COX5BYIL111W 456 nt1.05□□□□□ -2.24
MRPL4P36517 YMR326CYMR326C 309 nt1.04□□□□□ -2.24
MRPL4P36517 ASE1YOR058C 2658 nt1.03□□□□□ -2.24
MRPL4P36517 NOP9YJL010C 2001 nt1.03□□□□□ -2.25
MRPL4P36517 VAM6YDL077C 3150 nt1.02□□□□□ -2.25
MRPL4P36517 FYV10YIL097W 1551 nt1.02□□□□□ -2.25
MRPL4P36517 YML002WYML002W 2214 nt1.02□□□□□ -2.25
MRPL4P36517 WAR1YML076C 2835 nt1.02□□□□□ -2.25
MRPL4P36517 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt1.01□□□□□ -2.25
MRPL4P36517 snR190snR190 190 nt1.01□□□□□ -2.25
MRPL4P36517 RCO1YMR075W 2055 nt1□□□□□ -2.25
MRPL4P36517 MSH3YCR092C 3057 nt1□□□□□ -2.25
MRPL4P36517 YJR029WYJR029W 5268 nt0.99□□□□□ -2.25
MRPL4P36517 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.99□□□□□ -2.25
MRPL4P36517 snR61snR61 90 nt0.99□□□□□ -2.25
MRPL4P36517 YHR217CYHR217C 462 nt0.99□□□□□ -2.25
MRPL4P36517 YLR041WYLR041W 321 nt0.99□□□□□ -2.25
MRPL4P36517 KAP120YPL125W 3099 nt0.98□□□□□ -2.25
MRPL4P36517 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt0.98□□□□□ -2.25
MRPL4P36517 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt0.98□□□□□ -2.25
MRPL4P36517 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt0.98□□□□□ -2.25
MRPL4P36517 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt0.98□□□□□ -2.25
MRPL4P36517 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt0.98□□□□□ -2.25
MRPL4P36517 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt0.98□□□□□ -2.25
MRPL4P36517 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt0.98□□□□□ -2.25
MRPL4P36517 COG6YNL041C 2520 nt0.98□□□□□ -2.25
MRPL4P36517 LAA1YJL207C 6045 nt0.98□□□□□ -2.25
MRPL4P36517 SPT7YBR081C 3999 nt0.97□□□□□ -2.25
MRPL4P36517 BUD3YCL014W 4911 nt0.96□□□□□ -2.26
MRPL4P36517 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.96□□□□□ -2.26
MRPL4P36517 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.96□□□□□ -2.26
MRPL4P36517 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.96□□□□□ -2.26
MRPL4P36517 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.96□□□□□ -2.26
MRPL4P36517 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.96□□□□□ -2.26
MRPL4P36517 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt0.96□□□□□ -2.26
MRPL4P36517 YLR232WYLR232W 348 nt0.96□□□□□ -2.26
MRPL4P36517 YDR210WYDR210W 228 nt0.95□□□□□ -2.26
MRPL4P36517 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt0.95□□□□□ -2.26
MRPL4P36517 RPL26BYGR034W 384 nt0.95□□□□□ -2.26
MRPL4P36517 ANS1YHR126C 480 nt0.95□□□□□ -2.26
MRPL4P36517 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.92□□□□□ -2.26
MRPL4P36517 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.92□□□□□ -2.26
MRPL4P36517 YGR130CYGR130C 2451 nt0.92□□□□□ -2.26
MRPL4P36517 SCC2YDR180W 4482 nt0.91□□□□□ -2.26
MRPL4P36517 STF2YGR008C 255 nt0.91□□□□□ -2.26
MRPL4P36517 SEC1YDR164C 2175 nt0.91□□□□□ -2.26
MRPL4P36517 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt0.88□□□□□ -2.27
MRPL4P36517 BEM2YER155C 6504 nt0.88□□□□□ -2.27
MRPL4P36517 SBH1YER087C-B 249 nt0.87□□□□□ -2.27
MRPL4P36517 PRP16YKR086W 3216 nt0.87□□□□□ -2.27
MRPL4P36517 BIR1YJR089W 2865 nt0.86□□□□□ -2.27
MRPL4P36517 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt0.86□□□□□ -2.27
MRPL4P36517 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt0.86□□□□□ -2.27
MRPL4P36517 YDL073WYDL073W 2955 nt0.86□□□□□ -2.27
MRPL4P36517 YPR117WYPR117W 7470 nt0.85□□□□□ -2.27
MRPL4P36517 YNL266WYNL266W 420 nt0.85□□□□□ -2.27
MRPL4P36517 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.85□□□□□ -2.27
MRPL4P36517 SEC8YPR055W 3198 nt0.85□□□□□ -2.27
MRPL4P36517 IML1YJR138W 4755 nt0.84□□□□□ -2.27
MRPL4P36517 snR81snR81 201 nt0.84□□□□□ -2.27
MRPL4P36517 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt0.84□□□□□ -2.27
MRPL4P36517 SIP4YJL089W 2490 nt0.83□□□□□ -2.28
MRPL4P36517 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt0.83□□□□□ -2.28
MRPL4P36517 UBP3YER151C 2739 nt0.82□□□□□ -2.28
MRPL4P36517 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt0.82□□□□□ -2.28
MRPL4P36517 BEM3YPL115C 3387 nt0.82□□□□□ -2.28
MRPL4P36517 RKR1YMR247C 4689 nt0.81□□□□□ -2.28
MRPL4P36517 NNF2YGR089W 2811 nt0.81□□□□□ -2.28
MRPL4P36517 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.81□□□□□ -2.28
MRPL4P36517 DOP1YDR141C 5097 nt0.79□□□□□ -2.28
MRPL4P36517 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.79□□□□□ -2.28
MRPL4P36517 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt0.78□□□□□ -2.28
MRPL4P36517 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt0.76□□□□□ -2.29
MRPL4P36517 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt0.75□□□□□ -2.29
MRPL4P36517 snR45snR45 172 nt0.75□□□□□ -2.29
MRPL4P36517 YSP1YHR155W 3687 nt0.75□□□□□ -2.29
MRPL4P36517 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt0.74□□□□□ -2.29
MRPL4P36517 SEC10YLR166C 2616 nt0.73□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.2 ms