Protein–RNA interactions for Protein: Q12502

LDB19, Protein LDB19, yeastyeast

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LDB19Q12502 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt3.03□□□□□ -1.92
LDB19Q12502 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt3.03□□□□□ -1.92
LDB19Q12502 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt3.03□□□□□ -1.92
LDB19Q12502 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt3.03□□□□□ -1.92
LDB19Q12502 REV3YPL167C 4515 nt3.03□□□□□ -1.92
LDB19Q12502 CAF120YNL278W 3183 nt3.02□□□□□ -1.93
LDB19Q12502 BUD2YKL092C 3315 nt3.02□□□□□ -1.93
LDB19Q12502 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt3.02□□□□□ -1.93
LDB19Q12502 SEY1YOR165W 2331 nt3.02□□□□□ -1.93
LDB19Q12502 YSP2YDR326C 4317 nt3.02□□□□□ -1.93
LDB19Q12502 TFC4YGR047C 3078 nt3.01□□□□□ -1.93
LDB19Q12502 SGS1YMR190C 4344 nt3.01□□□□□ -1.93
LDB19Q12502 DYN1YKR054C 12279 nt3□□□□□ -1.93
LDB19Q12502 SIP4YJL089W 2490 nt3□□□□□ -1.93
LDB19Q12502 JSN1YJR091C 3276 nt3□□□□□ -1.93
LDB19Q12502 YER172C-AYER172C-A 381 nt3□□□□□ -1.93
LDB19Q12502 FLO1YAR050W 4614 nt3□□□□□ -1.93
LDB19Q12502 TSC11YER093C 4293 nt2.99□□□□□ -1.93
LDB19Q12502 MYO2YOR326W 4725 nt2.98□□□□□ -1.93
LDB19Q12502 YLR278CYLR278C 4026 nt2.98□□□□□ -1.93
LDB19Q12502 TRM3YDL112W 4311 nt2.98□□□□□ -1.93
LDB19Q12502 YBT1YLL048C 4986 nt2.98□□□□□ -1.93
LDB19Q12502 SPO71YDR104C 3738 nt2.97□□□□□ -1.93
LDB19Q12502 AGC1YPR021C 2709 nt2.96□□□□□ -1.94
LDB19Q12502 EST2YLR318W 2655 nt2.94□□□□□ -1.94
LDB19Q12502 CHS1YNL192W 3396 nt2.94□□□□□ -1.94
LDB19Q12502 RAX2YLR084C 3663 nt2.94□□□□□ -1.94
LDB19Q12502 GCN2YDR283C 4980 nt2.92□□□□□ -1.94
LDB19Q12502 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.91□□□□□ -1.94
LDB19Q12502 RGR1YLR071C 3249 nt2.91□□□□□ -1.94
LDB19Q12502 FKS3YMR306W 5358 nt2.9□□□□□ -1.95
LDB19Q12502 YDR209CYDR209C 414 nt2.89□□□□□ -1.95
LDB19Q12502 VPS8YAL002W 3825 nt2.89□□□□□ -1.95
LDB19Q12502 PMR1YGL167C 2853 nt2.88□□□□□ -1.95
LDB19Q12502 snR14snR14 160 nt2.88□□□□□ -1.95
LDB19Q12502 snR40snR40 97 nt2.88□□□□□ -1.95
LDB19Q12502 SMC6YLR383W 3345 nt2.88□□□□□ -1.95
LDB19Q12502 SPC110YDR356W 2835 nt2.88□□□□□ -1.95
LDB19Q12502 DSE4YNR067C 3354 nt2.88□□□□□ -1.95
LDB19Q12502 YGR067CYGR067C 2415 nt2.87□□□□□ -1.95
LDB19Q12502 RDS3YPR094W 324 nt2.87□□□□□ -1.95
LDB19Q12502 YOR055WYOR055W 435 nt2.85□□□□□ -1.95
LDB19Q12502 TRL1YJL087C 2484 nt2.85□□□□□ -1.95
LDB19Q12502 ROM2YLR371W 4071 nt2.85□□□□□ -1.95
LDB19Q12502 PKH3YDR466W 2697 nt2.84□□□□□ -1.95
LDB19Q12502 SNQ2YDR011W 4506 nt2.84□□□□□ -1.95
LDB19Q12502 snR190snR190 190 nt2.83□□□□□ -1.96
LDB19Q12502 BCK1YJL095W 4437 nt2.82□□□□□ -1.96
LDB19Q12502 CBF2YGR140W 2871 nt2.82□□□□□ -1.96
LDB19Q12502 SAC3YDR159W 3906 nt2.82□□□□□ -1.96
LDB19Q12502 snR69snR69 101 nt2.81□□□□□ -1.96
LDB19Q12502 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.81□□□□□ -1.96
LDB19Q12502 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt2.8□□□□□ -1.96
LDB19Q12502 PAN2YGL094C 3348 nt2.8□□□□□ -1.96
LDB19Q12502 BPT1YLL015W 4680 nt2.79□□□□□ -1.96
LDB19Q12502 INP51YIL002C 2841 nt2.79□□□□□ -1.96
LDB19Q12502 PDR1YGL013C 3207 nt2.77□□□□□ -1.97
LDB19Q12502 BUL2YML111W 2763 nt2.77□□□□□ -1.97
LDB19Q12502 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.77□□□□□ -1.97
LDB19Q12502 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.77□□□□□ -1.97
LDB19Q12502 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.77□□□□□ -1.97
LDB19Q12502 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.77□□□□□ -1.97
LDB19Q12502 YER138CYER138C 5268 nt2.77□□□□□ -1.97
LDB19Q12502 YER160CYER160C 5268 nt2.77□□□□□ -1.97
LDB19Q12502 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.77□□□□□ -1.97
LDB19Q12502 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.77□□□□□ -1.97
LDB19Q12502 YJR027WYJR027W 5268 nt2.77□□□□□ -1.97
LDB19Q12502 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.77□□□□□ -1.97
LDB19Q12502 YML039WYML039W 5268 nt2.77□□□□□ -1.97
LDB19Q12502 YML045WYML045W 5268 nt2.77□□□□□ -1.97
LDB19Q12502 YMR050CYMR050C 5268 nt2.77□□□□□ -1.97
LDB19Q12502 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.77□□□□□ -1.97
LDB19Q12502 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.77□□□□□ -1.97
LDB19Q12502 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.77□□□□□ -1.97
LDB19Q12502 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.77□□□□□ -1.97
LDB19Q12502 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.77□□□□□ -1.97
LDB19Q12502 TOM1YDR457W 9807 nt2.76□□□□□ -1.97
LDB19Q12502 ESL2YKR096W 3588 nt2.75□□□□□ -1.97
LDB19Q12502 TOF1YNL273W 3717 nt2.75□□□□□ -1.97
LDB19Q12502 ESL1YIL151C 3357 nt2.75□□□□□ -1.97
LDB19Q12502 SEC7YDR170C 6030 nt2.75□□□□□ -1.97
LDB19Q12502 CTR9YOL145C 3234 nt2.75□□□□□ -1.97
LDB19Q12502 RTT101YJL047C 2529 nt2.74□□□□□ -1.97
LDB19Q12502 SYH1YPL105C 2550 nt2.74□□□□□ -1.97
LDB19Q12502 NUP170YBL079W 4509 nt2.73□□□□□ -1.97
LDB19Q12502 GYP5YPL249C 2685 nt2.73□□□□□ -1.97
LDB19Q12502 NUP100YKL068W 2880 nt2.73□□□□□ -1.97
LDB19Q12502 MOT1YPL082C 5604 nt2.72□□□□□ -1.97
LDB19Q12502 TFC3YAL001C 3483 nt2.72□□□□□ -1.97
LDB19Q12502 YEF3YLR249W 3135 nt2.71□□□□□ -1.98
LDB19Q12502 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt2.71□□□□□ -1.98
LDB19Q12502 GEA1YJR031C 4227 nt2.71□□□□□ -1.98
LDB19Q12502 ECM29YHL030W 5607 nt2.71□□□□□ -1.98
LDB19Q12502 NST1YNL091W 3723 nt2.7□□□□□ -1.98
LDB19Q12502 PRP8YHR165C 7242 nt2.69□□□□□ -1.98
LDB19Q12502 SLH1YGR271W 5904 nt2.69□□□□□ -1.98
LDB19Q12502 STO1YMR125W 2586 nt2.69□□□□□ -1.98
LDB19Q12502 AXL1YPR122W 3627 nt2.69□□□□□ -1.98
LDB19Q12502 MET18YIL128W 3099 nt2.68□□□□□ -1.98
LDB19Q12502 YAR009CYAR009C 3591 nt2.68□□□□□ -1.98
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